TkA01G515460 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA01G515460

当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 129175473-129177521 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1317 bp · TkA01G515460|TK1151|cDNA

ATGACTTCAATACATTTATATTTAATATCTGAACTTGGATTTCGATTTTCAGGTGGAAGAGTAAACAATGGCGTTAACAAAGAAGGTGTTGACTACTACAATAACCTAATCAATGAGCTCATACTCCATGGAATTACTCCATATGTCACTTTGTTTCATTGGGACACTCCTAACTGCCTAGAAAAAGAATACATGGGTTTCTTAGATAAAAAAATCATATGCGATTTTAAAAGTTACGTGGGATTTTGCTTTTGGGAATT...

CDS

下载 CDS FASTA

1317 bp · TkA01G515460|TK1151|CDS

ATGACTTCAATACATTTATATTTAATATCTGAACTTGGATTTCGATTTTCAGGTGGAAGAGTAAACAATGGCGTTAACAAAGAAGGTGTTGACTACTACAATAACCTAATCAATGAGCTCATACTCCATGGAATTACTCCATATGTCACTTTGTTTCATTGGGACACTCCTAACTGCCTAGAAAAAGAATACATGGGTTTCTTAGATAAAAAAATCATATGCGATTTTAAAAGTTACGTGGGATTTTGCTTTTGGGAATT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

438 aa · TkA01G515460|TK1151|PROTEIN

MTSIHLYLISELGFRFSGGRVNNGVNKEGVDYYNNLINELILHGITPYVTLFHWDTPNCLEKEYMGFLDKKIICDFKSYVGFCFWEFGDRVVNWITLNEPANYAISGYDLGVFPPGRGVAGSGVGNGGTEPYIVTHNLLLCHAAAVELYRERFQASQGGKIGITLDATYFLPLDPQKVEDKDAALRALNFHFGWYMEPLFSGKYPDIMRKNVGDRLPEFTVEEAKLLKGAYDFLGLNYYCSNYATTAVPTDVVSYSNDIN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA01G515460`
TK1151 ID	TkA01G515460
OH-1004 ID	LXL04_001741
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	99.800
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 96.119 / OH-1004 79.584 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA01G515460

位置 Chr01:129175473-129177521 (+)

描述 Similar to BGLU11: Beta-glucosidase 11

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

当前来源表未检出该物种的同源命中。

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os04g0474800`	水解对硝基苯基β-D-葡萄糖苷、对硝基苯基β-D-半乳糖苷、对硝基苯基β-D-木糖苷、对硝基苯基β-D-岩藻糖苷、对硝基苯基β-L-阿拉伯糖苷、纤维二糖寡糖和层藻二糖。	暂无已核实直接文献
`UniProt: B8AVF0`	水解对硝基苯基β-D-葡萄糖苷、对硝基苯基β-D-半乳糖苷、对硝基苯基β-D-木糖苷、对硝基苯基β-D-岩藻糖苷、对硝基苯基β-L-阿拉伯糖苷、纤维二糖寡糖和层藻二糖。	暂无已核实直接文献
`UniProt: Q7XKV5`	β-葡萄糖苷酶 11。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_001741 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0005975 carbohydrate metabolic process 生物过程

GO:0006952 defense response 生物过程

GO:0051259 protein complex oligomerization 生物过程

GO:0005576 extracellular region 细胞组分

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0004338 glucan exo-1,3-beta-glucosidase activity 分子功能

GO:0004565 beta-galactosidase activity 分子功能

GO:0008422 beta-glucosidase activity 分子功能

GO:0033907 beta-D-fucosidase activity 分子功能

GO:0047701 beta-L-arabinosidase activity 分子功能

GO:0080083 beta-gentiobiose beta-glucosidase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ag:AAL93619

dosa:Os04g0474800

dosa:Os06g0320200

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.383

排名 1 · TkA01G515460 · TK1151

质体0.156

排名 2 · TkA01G515460 · TK1151

溶酶体／液泡0.134

排名 3 · TkA01G515460 · TK1151

内质网0.116

排名 4 · TkA01G515460 · TK1151

细胞核0.112

排名 5 · TkA01G515460 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00232Glyco_hydro_122-402 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA01G515460	`PF00232`	Glyco_hydro_1	22	402	2.9e-111	373.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q7XKV4`	水稻	sp\|Q7XKV4\|BGL12_ORYSJ Beta-glucosidase 12	51.200%	Swiss-Prot	高置信
`B8AVF0`	水稻	sp\|B8AVF0\|BGL12_ORYSI Beta-glucosidase 12	50.900%	Swiss-Prot	高置信
`Q7XKV5`	水稻	sp\|Q7XKV5\|BGL11_ORYSJ Beta-glucosidase 11	50.100%	Swiss-Prot	高置信

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