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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G515400
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 129151128-129153028 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1202 bp · TkA01G515400|TK1151|cDNA

ACAGAACGGATAACGAACTAACGTAGACCGGTTTCCCGTTTCATTCTTTGTAATATTCCATTTTGGTTTTCACCGACGAACTTTTGAGGCTTTCACGGCGATATATATTTCTTTTTATAGAAAATTGACCTCGGAAAACCTCTGTCTTCGATTTTGAATTCCTGTTCGTATGTCTGTCTAAGTCCTTCTCCGTCCATGGCAAAAACCCGCACCACAAGAAAAACCCTAGATTCTTACACCGTCAAAGGCTCAAATAAATC...

CDS

下载 CDS FASTA

651 bp · TkA01G515400|TK1151|CDS

ATGGCAAAAACCCGCACCACAAGAAAAACCCTAGATTCTTACACCGTCAAAGGCTCAAATAAATCCATCAAACCCGGCGATTGCGTGTTGATGCGTCCGGCCGATTCATCGAAGCCATCGTATGTAGCGAAAGTGGAGAAGCTGGAATCGGACGCCAAAGGAAGTAACGTGAAAGTTCATATACAGTGGTACTACCGCCCGGAGGAATCGATCGGTGGCCGGAGACAGTTTCACGGCATTAAAGAGGTTTTCCTCTCCGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

216 aa · TkA01G515400|TK1151|PROTEIN

MAKTRTTRKTLDSYTVKGSNKSIKPGDCVLMRPADSSKPSYVAKVEKLESDAKGSNVKVHIQWYYRPEESIGGRRQFHGIKEVFLSDHHDVQSADTIEGKCTVHTFKSYTKLDAVGNEDYFCRFEYNSSTGAFNPDRVAVYCKCEMPYNPDDLMVQCDACTDWFHPACIDMTPEDAKKIEHFFCLNCSSEEQKLLQNSHATSRHTDVKVTTKRRRR

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G515400
TK1151 IDTkA01G515400
OH-1004 IDLXL04_001744
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G515400
位置Chr01:129151128-129153028 (-)
描述Similar to EBS: Chromatin remodeling protein EBS
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g22140 染色质重塑因子，可结合甲基化组蛋白（例如H3K4me2/3）以防止其乙酰化（例如H3K9K14Ac），可能通过招募组蛋白去乙酰化酶（HDAC）复合体，从而调节靶基因的转录。 暂无已核实直接文献
At4g39100 染色质重塑因子，结合甲基化组蛋白（例如 H3K4me2/3）以防止其乙酰化（例如 H3K9K14Ac），可能通过招募组蛋白去乙酰化酶（HDAC）复合物，从而调控靶基因转录。 暂无已核实直接文献
At4g04260 染色质重塑因子，结合甲基化组蛋白（例如 H3K4me2/3）以防止其乙酰化（例如 H3K9K14Ac），可能通过招募组蛋白去乙酰化酶（HDAC）复合物，从而调控靶基因转录。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_001744 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006338 chromatin remodeling 生物过程
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006357 regulation of transcription by RNA polymerase II 生物过程
GO:0006482 protein demethylation 生物过程
GO:0009791 post-embryonic development 生物过程
GO:0009845 seed germination 生物过程
GO:0009908 flower development 生物过程
GO:0010228 vegetative to reproductive phase transition of meristem 生物过程
GO:0010628 positive regulation of gene expression 生物过程
GO:0045814 negative regulation of gene expression, epigenetic 生物过程
GO:0045815 transcription initiation-coupled chromatin remodeling 生物过程
GO:0048579 negative regulation of long-day photoperiodism, flowering 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G04260
ath:AT4G22140
ath:AT4G39100
dre:503778
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.917
排名 1 · TkA01G515400 · TK1151
细胞质0.176
排名 2 · TkA01G515400 · TK1151
细胞膜0.028
排名 3 · TkA01G515400 · TK1151
线粒体0.021
排名 4 · TkA01G515400 · TK1151
内质网0.018
排名 5 · TkA01G515400 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF23576SEN1_barrel20-60 aa
PF01426BAH23-135 aa
PF00628PHD110-123 aa
PF30811PHD_UBR7-like140-193 aa
PF20826PHD_5140-187 aa
PF31197PHD_JHD1141-172 aa
PF00628PHD142-187 aa
PF27108PHD_Pygo143-176 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G515400PF23576SEN1_barrel20600.1512.8
TkA01G515400PF01426BAH231352.6e-2589.4
TkA01G515400PF00628PHD1101234.1e-0833.8
TkA01G515400PF30811PHD_UBR7-like1401936.3e-1039.6
TkA01G515400PF20826PHD_51401870.0003421.4
TkA01G515400PF31197PHD_JHD11411720.001219.4
TkA01G515400PF00628PHD1421874.1e-0833.8
TkA01G515400PF27108PHD_Pygo1431760.003118.3
TkA01G515400PF22908PHD_NSD1471841.110.3
TkA01G515400PF16866PHD_41541760.07213.8
TkA01G515400PF21257PHD_ash2p_like1541720.1712.5
TkA01G515400PF31197PHD_JHD11721850.001219.4
TkA01G515400PF30124F10E9_2_M1771914.08.0
TkA01G515400PF27108PHD_Pygo1801980.003118.3
TkA01G515400PF16866PHD_41831940.07213.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
F4JL28拟南芥sp|F4JL28|EBS_ARATH Chromatin remodeling protein EBS68.900%Swiss-Prot高置信
Q9FEN9拟南芥sp|Q9FEN9|SHL_ARATH Chromatin remodeling protein SHL66.700%Swiss-Prot高置信
F4JGB7拟南芥sp|F4JGB7|EBSL_ARATH Chromatin remodeling protein At4g0426063.200%Swiss-Prot高置信

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