基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
TkA01G495950
当前版本: TK1151
染色体: Chr01
坐标: 124116646-124121267
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA3151 bp · TkA01G495950|TK1151|cDNA
CTGTTTTAGTAAAATGCTAGAAAAGAAGGGTAATAGCTACAAAATCGTGAGGAACCACAAGTATAACCCGAACCTAGAAAAACGCTCATCAGTCATAACCCTCCCTCCTACCTTTTTGATCGATAACAAATCCCAAATTTCCTCTGTTTCAAATTCCACATGTTTACCTTCATGCATTACAGACTCCAGTTCCTCGTTCTAAAAAACTAATTCGAGATTTCTTGCTTAGAATCTAGCAATTGTTCCTGACAGGTTTTTGC...
CDS
下载 CDS FASTA2223 bp · TkA01G495950|TK1151|CDS
ATGGGTAGACCGCCCAGTAATGGAGGCCCTTCTTTCCGCTTTAACCCGGCCGAGATTGCGGAGATGGAAGCCATCTTGCAAGCACACAAAACCCAAATGCCTGCACGTGAGGTTCTTGTTGCCTTAGCCGAAAAGTTCAGCAACTCTGAAGAACGAAAGGGAAAGATTGAAGTTCAAATGAAACAAGTATGGAATTGGTTCCAAAATAGACGATATGCAATCAGGGCTAAAGCAGGAAAATCACCAGGGAAGTTAATAAA...
740 aa · TkA01G495950|TK1151|PROTEIN
MGRPPSNGGPSFRFNPAEIAEMEAILQAHKTQMPAREVLVALAEKFSNSEERKGKIEVQMKQVWNWFQNRRYAIRAKAGKSPGKLINITQVNRDDNPTMAKGIPQPTLPHAASAATVRFMPQAQQHPTVPTVRTFPQAPQNTMSFSVQNAGRVTDNSQMEYEAKSARDGAWYDVSTFLSHRSLDSGDPEVMVRFAGFGAEEDEWVNVRKNVRQRSLPCEASECVAVLPADLILCFQEGKEQALYFDAHVLDAQRRRHDVR...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | TkA01G495950 |
|---|---|
| TK1151 ID | TkA01G495950 |
| OH-1004 ID | LXL04_001948 |
| 关系 / 置信度 | 跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系 |
| 蛋白一致性 (%) | 92.200 |
| 蛋白覆盖度 (%) | TK1151 99.595 / OH-1004 98.797覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。 |
| 版本 | TK1151 / GWHBCHF00000000 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | TkA01G495950 | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr01:124116646-124121267 (-) | |||||||||
| 描述 | Similar to SHH2: Protein SAWADEE HOMEODOMAIN HOMOLOG 2 | |||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。 | |||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | |||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006346 DNA methylation-dependent constitutive heterochromatin formation 生物过程 GO:0007155 cell adhesion 生物过程 GO:0007339 binding of sperm to zona pellucida 生物过程 GO:0031047 regulatory ncRNA-mediated gene silencing 生物过程 GO:0040029 epigenetic regulation of gene expression 生物过程 GO:2000359 regulation of binding of sperm to zona pellucida 生物过程 GO:0005615 extracellular space 细胞组分 GO:0005634 nucleus 细胞组分 GO:0005886 plasma membrane 细胞组分 GO:0031012 extracellular matrix 细胞组分 GO:0003677 DNA binding 分子功能 GO:0003682 chromatin binding 分子功能 | |||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G15215 ath:AT3G18380 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞核0.874
细胞质0.180
细胞膜0.042
内质网0.031
线粒体0.020
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF00046Homeodomain13-73 aaPF23604Ig_TRAPPC1048-75 aaPF16719SAWADEE158-285 aaPF30489Ropporin_N413-433 aaPF23604Ig_TRAPPC10421-452 aaPF23604Ig_TRAPPC10467-516 aaPF30489Ropporin_N535-544 aaPF30489Ropporin_N557-566 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| TkA01G495950 | PF00046 | Homeodomain | 13 | 73 | 0.0012 | 19.3 |
| TkA01G495950 | PF23604 | Ig_TRAPPC10 | 48 | 75 | 8.2 | 7.2 |
| TkA01G495950 | PF16719 | SAWADEE | 158 | 285 | 2.9e-44 | 150.9 |
| TkA01G495950 | PF30489 | Ropporin_N | 413 | 433 | 9.9 | 7.0 |
| TkA01G495950 | PF23604 | Ig_TRAPPC10 | 421 | 452 | 8.2 | 7.2 |
| TkA01G495950 | PF23604 | Ig_TRAPPC10 | 467 | 516 | 8.2 | 7.2 |
| TkA01G495950 | PF30489 | Ropporin_N | 535 | 544 | 9.9 | 7.0 |
| TkA01G495950 | PF30489 | Ropporin_N | 557 | 566 | 9.9 | 7.0 |
| TkA01G495950 | PF23604 | Ig_TRAPPC10 | 604 | 643 | 8.2 | 7.2 |
| TkA01G495950 | PF30489 | Ropporin_N | 612 | 621 | 9.9 | 7.0 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。