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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G466210
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 116800723-116807281 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1121 bp · TkA01G466210|TK1151|cDNA

GCGATTCCTAAATTGATACTGCGAAATTACTTTTATGCCCCCAGCATTGAAAGCCTCGTCTGCTCGCTCGCCGCTGAAACATGCTCGAAATTAATGGCCATCGCCATTTCTGCACAGTGAGAAACTACCCTTCTCCATCGTCGCTGATGAGAACTGACCATCACCATTAATGGCCATCGCCATCTACCCTCTGTACGCCCATCGCCTCTCCATTAATCGCCTTCTTACACTGATTTGGAAATCGATGAACTAACCTAGGG...

CDS

下载 CDS FASTA

570 bp · TkA01G466210|TK1151|CDS

ATGCCTACCTTAGAAGATTCACCATACATGACGATTAACCAGGAGGTGGAGATATTTACAAATAAAGAACTCACTAGGATGATGGAAATGAGGCGCAACATACGTAGCATATCTGTTATTGGTGATGTCGCTTCCGGGACGTCGACATTGATTGATTCTCTTGTGGTTGCTGCTGGTGTCATCCATCAAGAAGCTGGCTATTTCATGGACACCCGTGTTGATGAGATAGAACAAATAATGAGCATCAAGTCAACCAGTAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

190 aa · TkA01G466210|TK1151|PROTEIN

MPTLEDSPYMTINQEVEIFTNKELTRMMEMRRNIRSISVIGDVASGTSTLIDSLVVAAGVIHQEAGYFMDTRVDEIEQIMSIKSTSISRSYKMTNEALKALTVEHNGNEYLINLIDSPGHIDLSLEAIAALHVTDEALLIVDSMEGVGLQTQSLISQIFRERVVPFLIINKIDDCFFELQVDGEKAYRSF

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G466210
TK1151 IDTkA01G466210
OH-1004 IDLXL04_023921
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)98.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 95.960
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G466210
位置Chr01:116800723-116807281 (-)
描述Similar to LOS1: Elongation factor 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: Q9ASR1 催化翻译延伸过程中依赖GTP的核糖体易位步骤。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_023921 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002182 cytoplasmic translational elongation 生物过程
GO:0006414 translational elongation 生物过程
GO:0009409 response to cold 生物过程
GO:0009631 cold acclimation 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005730 nucleolus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G56070
bvg:104906141
gga:396325
spo:2539544
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.664
排名 1 · TkA01G466210 · TK1151
细胞核0.401
排名 2 · TkA01G466210 · TK1151
线粒体0.044
排名 3 · TkA01G466210 · TK1151
溶酶体／液泡0.034
排名 4 · TkA01G466210 · TK1151
细胞膜0.033
排名 5 · TkA01G466210 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF22180RH3_dom19-29 aa
PF13555AAA_2928-55 aa
PF00009GTP_EFTU33-179 aa
PF01926MMR_HSR137-171 aa
PF00735Septin37-122 aa
PF00350Dynamin_N37-55 aa
PF13561adh_short_C250-96 aa
PF00350Dynamin_N63-121 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G466210PF22180RH3_dom19290.2112.5
TkA01G466210PF13555AAA_2928550.07813.5
TkA01G466210PF00009GTP_EFTU331796.6e-29101.6
TkA01G466210PF01926MMR_HSR1371710.001819.1
TkA01G466210PF00735Septin371220.1112.5
TkA01G466210PF00350Dynamin_N37550.212.4
TkA01G466210PF13561adh_short_C250960.07913.2
TkA01G466210PF00350Dynamin_N631210.212.4
TkA01G466210PF22180RH3_dom751040.2112.5
TkA01G466210PF22180RH3_dom1261420.2112.5
TkA01G466210PF22180RH3_dom1441710.2112.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9ASR1拟南芥sp|Q9ASR1|EF2_ARATH Elongation factor 255.400%Swiss-Prot高置信

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