TkA01G458160 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA01G458160

当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 114716630-114721296 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2597 bp · TkA01G458160|TK1151|cDNA

CCACAGGCCTTTGTTTTATTTCCCGCGTTTGTAAACATTTCCCGCTTCTCGTCGAAACCCTAATTTGCGAAAAATGGGGACGAAGCACCACTCTTCCGATCCCGTCTCCGATCCTAAAAAGCGTAGAAAGGTCGGATTCTCCAAAGTCGATGAAGGGGTTCAACCTAACGATTGCATTAAAATTTACATGGTTTCTCGTCAAGAGGAAGTTGGCTCTCCAGAAAGCTTCCCTGTTGAACCTGTTGACTTAAGTCCCTTTT...

CDS

下载 CDS FASTA

1638 bp · TkA01G458160|TK1151|CDS

ATGGGGACGAAGCACCACTCTTCCGATCCCGTCTCCGATCCTAAAAAGCGTAGAAAGGTCGGATTCTCCAAAGTCGTTTCTCGTCAAGAGGAAGTTGGCTCTCCAGAAAGCTTCCCTGTTGAACCTGTTGACTTAAGTCCCTTTTTTGAAGAAGATGGAAAAATATATGGCTACCAAGGGTTGAAGATCACAATCTGGATTAGCAGCATATCATTTCAAGCATATGCTGATATTTCTTTTGAGAGCACATCTGATAACAT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

545 aa · TkA01G458160|TK1151|PROTEIN

MGTKHHSSDPVSDPKKRRKVGFSKVVSRQEEVGSPESFPVEPVDLSPFFEEDGKIYGYQGLKITIWISSISFQAYADISFESTSDNIFADNLVETKDDFLKTFSTESNYIKSMISNGKTIHQNTPSDLEVIRVEGTSMGLLYCRLVPLVLLLVDGSNPIDVTDPDWEVYLLLEKKLDESLKLVGFAALYRFFHYPDSQRLRLGQILVLPPYQRKGYGGHLFETLTNMAVSENIHDLSIEEPLDSLQHIRSCIDIPRLLAL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA01G458160`
TK1151 ID	TkA01G458160
OH-1004 ID	LXL04_002464
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)	91.900
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 76.514 / OH-1004 99.774 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA01G458160

位置 Chr01:114716630-114721296 (+)

描述 Similar to HAG2: Histone acetyltransferase type B catalytic subunit

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g56740`	乙酰化可溶性但非核小体 H4（通过相似性）。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os09g0347800`	乙酰化可溶性H4，但不乙酰化核小体H4。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_002464 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0031509 subtelomeric heterochromatin formation 生物过程

GO:0000123 histone acetyltransferase complex 细胞组分

GO:0000781 chromosome, telomeric region 细胞组分

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0010485 histone H4 acetyltransferase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT5G56740

ddi:DDB_G0274269

ddi:DDB_G0275159

dosa:Os09g0347800

zma:542083

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.804

排名 1 · TkA01G458160 · TK1151

细胞质0.262

排名 2 · TkA01G458160 · TK1151

线粒体0.037

排名 3 · TkA01G458160 · TK1151

细胞膜0.029

排名 4 · TkA01G458160 · TK1151

内质网0.020

排名 5 · TkA01G458160 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13673Acetyltransf_1019-33 aa

PF10394Hat1_N24-154 aa

PF13508Acetyltransf_750-64 aa

PF01853MOZ_SAS117-243 aa

PF13673Acetyltransf_10177-238 aa

PF00583Acetyltransf_1181-236 aa

PF13508Acetyltransf_7181-228 aa

PF10394Hat1_N275-300 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA01G458160	`PF13673`	Acetyltransf_10	19	33	0.019	15.6
TkA01G458160	`PF10394`	Hat1_N	24	154	4.2e-17	63.5
TkA01G458160	`PF13508`	Acetyltransf_7	50	64	0.00038	21.5
TkA01G458160	`PF01853`	MOZ_SAS	117	243	8.8e-05	22.8
TkA01G458160	`PF13673`	Acetyltransf_10	177	238	0.019	15.6
TkA01G458160	`PF00583`	Acetyltransf_1	181	236	8.4e-07	30.0
TkA01G458160	`PF13508`	Acetyltransf_7	181	228	0.00038	21.5
TkA01G458160	`PF10394`	Hat1_N	275	300	4.2e-17	63.5
TkA01G458160	`PF21183`	HAT1_C	295	316	0.067	14.4
TkA01G458160	`PF10394`	Hat1_N	391	425	4.2e-17	63.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9FJT8`	拟南芥	sp\|Q9FJT8\|HATB_ARATH Histone acetyltransferase type B catalytic subunit	50.200%	Swiss-Prot	高置信
`Q6ES10`	水稻	sp\|Q6ES10\|HAT1_ORYSJ Probable histone acetyltransferase type B catalytic subunit	48.200%	Swiss-Prot	中等置信

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