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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G429170
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 107174460-107177579 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2812 bp · TkA01G429170|TK1151|cDNA

GTGGCTGTGATGTATTTGAAGATCAACACCTCAGCATGATATACATGCATCCCCCTTTTGCATATATAATCCCACAATCCCTATTTCCACAATAGCACTGCGTGTTTTTCAAACATTCCAAAACTTCATTCCTCTTTCTCTCTCTCCTTTCCTTTTTTTGCCCTGCTACTGGGTTGTAGAGGGTTCCTTTTCGAATGCAATCGAATCTTCAACGAGATTTTATCAAGAGCTTCTATTTTTGGATCATATTTGCGTGCTTT...

CDS

下载 CDS FASTA

1878 bp · TkA01G429170|TK1151|CDS

ATGCCTGCTTTGGTTAATTACAGGGGTGACGATGATTATCACACAGGCGGATCATTGTGCTCAAAAGATTCAACCCGTTTGTTCTCTGTTTACGGTCCGCCTTGCAAACGCCAACGAATCAGCGATTCATATGTTCTATTCTTCGAAGAGGACCAAAACCCATCGATCGAAGTTCTTCCTGACGAATGCCTTTACGAAATCCTCCGGCGTTTGCCAGGCTGTCAATCCCGGAGCGCCTCCGCCTGTGTTTCAAAGCGTTG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

625 aa · TkA01G429170|TK1151|PROTEIN

MPALVNYRGDDDYHTGGSLCSKDSTRLFSVYGPPCKRQRISDSYVLFFEEDQNPSIEVLPDECLYEILRRLPGCQSRSASACVSKRWLTVLSNIRTSEIDNVSSTDVEMISPENDGFLTRCVEGKKATDGRLAAIAVGTSARGGLGKLSIRATNKVTKTGFTAIARGCPSLKVLSLWNLPSIGDESLIEIAKECHSLEKLDLSHCPSISNKGVSAIAESCPNLSSLTIEACKNIGNETLQSVARHCPNLQSITIKDCPFV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G429170
TK1151 IDTkA01G429170
OH-1004 IDLXL04_032368
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)46.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.200 / OH-1004 98.482
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G429170
位置Chr01:107174460-107177579 (-)
描述Similar to EBF1: EIN3-binding F-box protein 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g25350 SCF(EBF1)型E3泛素连接酶复合物的组分，可能介导靶蛋白（可能包括EIN3和EIL1）的泛素化及随后的蛋白酶体降解。
EIN3-dependent regulation of plant ethylene hormone signaling by two arabidopsis F box proteins: EBF1 and EBF2.2003 · DOI: 10.1016/s0092-8674(03)00968-1
At2g25490 SCF(EBF1)型E3泛素连接酶复合物的组分，可能介导靶蛋白（可能包括EIN3和EIL1）的泛素化及随后的蛋白酶体降解。
EIN3-dependent regulation of plant ethylene hormone signaling by two arabidopsis F box proteins: EBF1 and EBF2.2003 · DOI: 10.1016/s0092-8674(03)00968-1

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_032368 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006289 nucleotide-excision repair 生物过程
GO:0006511 ubiquitin-dependent protein catabolic process 生物过程
GO:0009723 response to ethylene 生物过程
GO:0009873 ethylene-activated signaling pathway 生物过程
GO:0010105 negative regulation of ethylene-activated signaling pathway 生物过程
GO:0010225 response to UV-C 生物过程
GO:0016567 protein ubiquitination 生物过程
GO:0031146 SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0019005 SCF ubiquitin ligase complex 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G25490
ath:AT4G15475
ath:AT5G25350
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.837
排名 1 · TkA01G429170 · TK1151
细胞质0.119
排名 2 · TkA01G429170 · TK1151
细胞膜0.046
排名 3 · TkA01G429170 · TK1151
质体0.042
排名 4 · TkA01G429170 · TK1151
内质网0.018
排名 5 · TkA01G429170 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12937F-box-like56-92 aa
PF00646F-box59-92 aa
PF27094DUF8346148-190 aa
PF25372LRR_FBXL15154-374 aa
PF12799LRR_4154-179 aa
PF29594LRR_SKP2156-248 aa
PF09029Preseq_ALAS164-261 aa
PF23247LRR_RPS2165-232 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G429170PF12937F-box-like56920.0006420.1
TkA01G429170PF00646F-box59921.7e-0525.3
TkA01G429170PF27094DUF83461481900.0003220.0
TkA01G429170PF25372LRR_FBXL151543742.2e-32112.9
TkA01G429170PF12799LRR_41541799.8e-0626.4
TkA01G429170PF29594LRR_SKP21562485.4e-1762.6
TkA01G429170PF09029Preseq_ALAS1642610.01216.6
TkA01G429170PF23247LRR_RPS21652321.9e-0835.1
TkA01G429170PF26020LRR_161682252.6e-0524.5
TkA01G429170PF23622LRR_At1g61320_AtMIF11683090.001119.1
TkA01G429170PF12799LRR_41692099.8e-0626.4
TkA01G429170PF24758LRR_At5g563701712582.4e-0731.3
TkA01G429170PF13516LRR_61821914.6e-1245.7
TkA01G429170PF27087LRR_TMOD-LMOD1852280.004117.5
TkA01G429170PF23247LRR_RPS21932571.9e-0835.1
TkA01G429170PF13516LRR_61942174.6e-1245.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q708Y0拟南芥sp|Q708Y0|EBF2_ARATH EIN3-binding F-box protein 258.900%Swiss-Prot高置信
Q9SKK0拟南芥sp|Q9SKK0|EBF1_ARATH EIN3-binding F-box protein 148.800%Swiss-Prot中等置信

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