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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G417320
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 104174950-104186772 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

4291 bp · TkA01G417320|TK1151|cDNA

GTGGATGTAAGAATCCGTCTTTCAATACTTCCATTCTACCATATCCGTCTTCCATTTTTTGACAACCGGAACACTCCAAACTTCCTCTAATCATCTCGATTCCATCCATTTGGGTACGATTTCGGTAAATATGATTCATTGACGAGCTGTCCGTCAGTGACCCAGACGGTGAACGGCTCTTACCAGTTTGTTATTCGGAAAACACATCGACACTGATAATTTCAAGGTGGGATGGTAGTAATGGGCTGTATACTTCTACC...

CDS

下载 CDS FASTA

3096 bp · TkA01G417320|TK1151|CDS

ATGAGTTCAACTGAAAGCGTAATACAAAGGGGAAAACTTCTAGTTCACATAGCAGAAAACGGGCATTCATTTGAGCTTGATTGTGATGAAGACACCCTCGTTGAATCAATCCAACAGTACTTAGAATCTCTATCTGGAATCCGCTTACACGATCAGCTAATCCTCTATCTGGATTTAAAACTAGAACCTCAACAGCCACTCTCATCCTACAAACTCCCATCAGATGATCGAGAGGTTTTCTTATTCAATCGAGCCAAAAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1031 aa · TkA01G417320|TK1151|PROTEIN

MSSTESVIQRGKLLVHIAENGHSFELDCDEDTLVESIQQYLESLSGIRLHDQLILYLDLKLEPQQPLSSYKLPSDDREVFLFNRAKMRTNSPPPNPEEQDLELSQNYHIDPPRPSSSHDPHPLDEASDPALKALPSYERQFRYHYQLGDAIYHRTLLKYQTCERLSREQRVQEKALEIARGNLDHFYKMILQNYTDFVKCYSQQQRTHSNLLVNFGRDLERLRSIKLLPVLQSGDRKCLLDFVKEDNLRKMVDDCSNSHR...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G417320
TK1151 IDTkA01G417320
OH-1004 IDLXL04_002843
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G417320
位置Chr01:104174950-104186772 (+)
描述Similar to ATG11: Autophagy-related protein 11
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g30790 参与自噬的辅助蛋白。
AUTOPHAGY-RELATED11 plays a critical role in general autophagy- and senescence-induced mitophagy in Arabidopsis.2014 · DOI: 10.1105/tpc.113.120014

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_002843 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000045 autophagosome assembly 生物过程
GO:0000422 autophagy of mitochondrion 生物过程
GO:0000425 pexophagy 生物过程
GO:0006914 autophagy 生物过程
GO:0010150 leaf senescence 生物过程
GO:0015031 protein transport 生物过程
GO:0034517 ribophagy 生物过程
GO:0034727 piecemeal microautophagy of the nucleus 生物过程
GO:0061709 reticulophagy 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005774 vacuolar membrane 细胞组分
GO:0005776 autophagosome 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT4G30790
mgr:MGG_04486
ncr:NCU09998
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.616
排名 1 · TkA01G417320 · TK1151
高尔基体0.231
排名 2 · TkA01G417320 · TK1151
细胞核0.197
排名 3 · TkA01G417320 · TK1151
细胞膜0.137
排名 4 · TkA01G417320 · TK1151
溶酶体／液泡0.127
排名 5 · TkA01G417320 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00240ubiquitin19-75 aa
PF04108ATG17_like153-486 aa
PF28533DUF8429174-196 aa
PF28533DUF8429281-281 aa
PF00240ubiquitin296-317 aa
PF10377ATG11363-405 aa
PF07195FliD_C378-404 aa
PF178374PPT_N473-501 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G417320PF00240ubiquitin19750.002818.1
TkA01G417320PF04108ATG17_like1534862e-30107.2
TkA01G417320PF28533DUF84291741960.01316.1
TkA01G417320PF28533DUF84292812810.01316.1
TkA01G417320PF00240ubiquitin2963170.002818.1
TkA01G417320PF10377ATG113634058.4e-2278.4
TkA01G417320PF07195FliD_C3784042.97.9
TkA01G417320PF178374PPT_N4735010.1113.4
TkA01G417320PF07195FliD_C5666582.97.9
TkA01G417320PF12939DUF38375666494.68.4
TkA01G417320PF11932DUF34506276527.36.5
TkA01G417320PF28533DUF84296446580.01316.1
TkA01G417320PF11932DUF34507217807.36.5
TkA01G417320PF12939DUF38377247484.68.4
TkA01G417320PF28533DUF84297437550.01316.1
TkA01G417320PF12179IKKbetaNEMObind7597830.02715.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SUG7拟南芥sp|Q9SUG7|ATG11_ARATH Autophagy-related protein 1154.100%Swiss-Prot高置信

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