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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G385800
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 96295111-96298735 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1252 bp · TkA01G385800|TK1151|cDNA

TTGATATTGAGCGCCGGAAACCCCAACATACATATATGCTGTGTGCAAGCAGCAACTTGTGTTTGAATTCGTACCTGGCTGCAACTCATGAAGCACGCGGCAAGTGCATAGTGAGGGTGAGAGCGAACATCCGAGTCGAGATGGAGATCGGTGGGTTAGATAGCAATGGCCGGGAATTCAAGAACGCCGATGAAATGTGGCGAGAAGAAGTTGGTGATTCACAGAAGAAGCTCGATTGGTACCGCAACGGCGTTGGCTAC...

CDS

下载 CDS FASTA

936 bp · TkA01G385800|TK1151|CDS

ATGCTGTGTGCAAGCAGCAACTTGTGTTTGAATTCGTACCTGGCTGCAACTCATGAAGCACGCGGCAAGTGCATAGTGAGGGTGAGAGCGAACATCCGAGTCGAGATGGAGATCGGTGGGTTAGATAGCAATGGCCGGGAATTCAAGAACGCCGATGAAATGTGGCGAGAAGAAGTTGGTGATTCACAGAAGAAGCTCGATTGGTACCGCAACGGCGTTGGCTACTGGCAAGGCGTGGATGCGTCAGTTGATGGAGTTCT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

311 aa · TkA01G385800|TK1151|PROTEIN

MLCASSNLCLNSYLAATHEARGKCIVRVRANIRVEMEIGGLDSNGREFKNADEMWREEVGDSQKKLDWYRNGVGYWQGVDASVDGVLGGYGHVNEPDIKSSEAFLNTLLNELIPNAGRNRHLVALDCGSGIGRVTKNLLIRYFNEVDLLEPVSHFLEAARENLAPENLSVSEEHKAANFYCTPLQEFTPDAGRYDVIWIQWCIGHLADDDFVSFFKRAKAGLKPGGFFVLKENLARSGFVLDKEDKSLTRSDVYFKELFT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G385800
TK1151 IDTkA01G385800
OH-1004 IDLXL04_003205
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G385800
位置Chr01:96295111-96298735 (+)
描述Similar to At5g44450: Alpha N-terminal protein methyltransferase 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g44450 α-N-甲基转移酶，在起始 Met 被切除时，甲基化含有 N 端基序列 [Ala/Pro/Ser]-Pro-Lys 的靶蛋白的 N 端。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0780900 α-N-甲基转移酶，在起始 Met 被切除时，甲基化含有 N 端基序列 [Ala/Pro/Ser]-Pro-Lys 的靶蛋白的 N 端。 暂无已核实直接文献
UniProt: A2XMJ1 α-N-甲基转移酶，在起始 Met 被切除时，甲基化含有 N 端基序列 [Ala/Pro/Ser]-Pro-Lys 的靶蛋白的 N 端。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_003205 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007051 spindle organization 生物过程
GO:0007059 chromosome segregation 生物过程
GO:0018013 N-terminal peptidyl-glycine methylation 生物过程
GO:0018016 N-terminal peptidyl-proline dimethylation 生物过程
GO:0032259 methylation 生物过程
GO:0035572 N-terminal peptidyl-serine dimethylation 生物过程
GO:0035573 N-terminal peptidyl-serine trimethylation 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0008168 methyltransferase activity 分子功能
GO:0008276 protein methyltransferase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G44450
dosa:Os03g0780900
xla:734671
xtr:100145456
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.432
排名 1 · TkA01G385800 · TK1151
细胞质0.233
排名 2 · TkA01G385800 · TK1151
细胞核0.231
排名 3 · TkA01G385800 · TK1151
线粒体0.091
排名 4 · TkA01G385800 · TK1151
过氧化物酶体0.065
排名 5 · TkA01G385800 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13649Methyltransf_2539-99 aa
PF05891Methyltransf_PK66-288 aa
PF13489Methyltransf_23108-243 aa
PF13847Methyltransf_31120-232 aa
PF13649Methyltransf_25125-226 aa
PF08241Methyltransf_11125-230 aa
PF08242Methyltransf_12125-228 aa
PF00891Methyltransf_2125-236 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G385800PF13649Methyltransf_2539992.6e-1144.8
TkA01G385800PF05891Methyltransf_PK662889.6e-95316.9
TkA01G385800PF13489Methyltransf_231082438.1e-0729.6
TkA01G385800PF13847Methyltransf_311202320.1112.9
TkA01G385800PF13649Methyltransf_251252262.6e-1144.8
TkA01G385800PF08241Methyltransf_111252301.6e-0938.9
TkA01G385800PF08242Methyltransf_121252283.8e-0731.5
TkA01G385800PF00891Methyltransf_21252360.2311.5
TkA01G385800PF06859Bin32052330.2912.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q5PP70拟南芥sp|Q5PP70|NTM1_ARATH Alpha N-terminal protein methyltransferase 171.000%Swiss-Prot高置信
Q10CT5水稻sp|Q10CT5|NTM1_ORYSJ Alpha N-terminal protein methyltransferase 158.900%Swiss-Prot高置信
A2XMJ1水稻sp|A2XMJ1|NTM1_ORYSI Alpha N-terminal protein methyltransferase 158.600%Swiss-Prot高置信

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