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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G384620
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 96013533-96015375 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1445 bp · TkA01G384620|TK1151|cDNA

CTTCATCTACGAGCGACCACAGGGAGCTATCAGTTGAATGAAACTCTTCTGAATCCTTTTATTTTGTTCACATAAATTCAAGTCATGAAGAAATCCGAACGACCAAAGGCATCAAAACGGGAAGATGGGGTCGATTTGATCAGTAAAATGCCGGATGCTATTCTTCTTTTGATTCTCTCACGTCTTTCATCCACTGGAGAACAAATTCGAAGCAGCATTTTGTCCAGAAGATGGAGGTATTTGTGGACTGCAGTTCCCTC...

CDS

下载 CDS FASTA

1197 bp · TkA01G384620|TK1151|CDS

ATGAAGAAATCCGAACGACCAAAGGCATCAAAACGGGAAGATGGGGTCGATTTGATCAGTAAAATGCCGGATGCTATTCTTCTTTTGATTCTCTCACGTCTTTCATCCACTGGAGAACAAATTCGAAGCAGCATTTTGTCCAGAAGATGGAGGTATTTGTGGACTGCAGTTCCCTCAGTAGACATGCAGTTTTTATCCGAGGAAGAATCCAAACAAAGCCAGTTTAAAGAGTTTGTGTATCGGGTTTTAGCAAGCAAAAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

398 aa · TkA01G384620|TK1151|PROTEIN

MKKSERPKASKREDGVDLISKMPDAILLLILSRLSSTGEQIRSSILSRRWRYLWTAVPSVDMQFLSEEESKQSQFKEFVYRVLASKTVNLDSFRLSLYYCDSIATVWRWVRLAVTRNFKQFDFSFWTINDTKPIELPHYLVSCSSLEVLRLDFRNHGLSLPKVVGFPALRVLHLTNVCLPEDDDLVNDFLKSCPLLEDLSLVGCLLRGLVRISYPNLKKLKIINWDDVGCHSIKISCPKLVDFDLGGCILKGSREIVQFL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G384620
TK1151 IDTkA01G384620
OH-1004 IDLXL04_003224
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)93.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G384620
位置Chr01:96013533-96015375 (-)
描述Similar to At3g52680: F-box/FBD/LRR-repeat protein At3g52680
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g56370 与 FBD 相关的 F-box 蛋白 At5g56370。 暂无已核实直接文献
At5g56420 F-box/FBD/LRR 重复蛋白 At5g56420。 暂无已核实直接文献
At2g26860 FBD相关F-box蛋白At2g26860。 暂无已核实直接文献
At5g02920 F-box/LRR重复蛋白 25。 暂无已核实直接文献
At4g14103 F-box/LRR重复蛋白At4g14103。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_003224 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G51370
ath:AT1G69630
ath:AT3G52680
ath:AT5G56370
ath:AT5G56420
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.856
排名 1 · TkA01G384620 · TK1151
细胞质0.188
排名 2 · TkA01G384620 · TK1151
细胞膜0.041
排名 3 · TkA01G384620 · TK1151
内质网0.037
排名 4 · TkA01G384620 · TK1151
质体0.016
排名 5 · TkA01G384620 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00646F-box19-57 aa
PF12937F-box-like19-53 aa
PF07723LRR_286-95 aa
PF23622LRR_At1g61320_AtMIF193-300 aa
PF24758LRR_At5g56370108-239 aa
PF12799LRR_4138-152 aa
PF12799LRR_4145-177 aa
PF12799LRR_4167-204 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G384620PF00646F-box19572.7e-0524.6
TkA01G384620PF12937F-box-like19530.001618.9
TkA01G384620PF07723LRR_286950.07914.3
TkA01G384620PF23622LRR_At1g61320_AtMIF1933003.6e-1040.5
TkA01G384620PF24758LRR_At5g563701082396.1e-1762.7
TkA01G384620PF12799LRR_41381520.03115.3
TkA01G384620PF12799LRR_41451770.03115.3
TkA01G384620PF12799LRR_41672040.03115.3
TkA01G384620PF07723LRR_21691940.07914.3
TkA01G384620PF12799LRR_41962220.03115.3
TkA01G384620PF12799LRR_42772940.03115.3
TkA01G384620PF24758LRR_At5g563702803216.1e-1762.7
TkA01G384620PF23622LRR_At1g61320_AtMIF12873413.6e-1040.5
TkA01G384620PF07723LRR_22872950.07914.3
TkA01G384620PF00646F-box3043182.7e-0524.6
TkA01G384620PF12799LRR_43063200.03115.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FM94拟南芥sp|Q9FM94|FBD21_ARATH FBD-associated F-box protein At5g5637036.300%Swiss-Prot低置信
Q9FM89拟南芥sp|Q9FM89|FDL38_ARATH F-box/FBD/LRR-repeat protein At5g5642033.600%Swiss-Prot中等置信
Q84X02拟南芥sp|Q84X02|FBD7_ARATH FBD-associated F-box protein At2g2686028.500%Swiss-Prot低置信
Q1PE04拟南芥sp|Q1PE04|FBL25_ARATH F-box/LRR-repeat protein 2530.700%Swiss-Prot低置信
Q8L7H1拟南芥sp|Q8L7H1|FBL75_ARATH F-box/LRR-repeat protein At4g1410330.000%Swiss-Prot中等置信

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