TkA01G316710 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA01G316710

当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 78609992-78613728 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1736 bp · TkA01G316710|TK1151|cDNA

TCTGAAGGATAAATAAACCGATTTTTGTAATTAACAACAACAAATCTTACGAGGGAGACGCTGCCGAAAGTTTTAGAACAAGAGCTAGCAACGTCGGCAATGGTCGGCTACAAATCCATATATGGCGGCGATAAAATGAGGACCTTTAGCTGAATCATTACATGTTTAAGGAAACAGAAACCAATCTCCACGCTGTCTTCTTCTCTCTCGCGTTCATGGCCGCAACAGCATTCTCTCTTTCTTCCTCCATTGACCTCTAC...

CDS

下载 CDS FASTA

999 bp · TkA01G316710|TK1151|CDS

ATGTTTAAGGAAACAGAAACCAATCTCCACGCTGTCTTCTTCTCTCTCGCGTTCATGGCCGCAACAGCATTCTCTCTTTCTTCCTCCATTGACCTCTACCACCAACACCACCTCCAACCCCACCGCAATCTCCGCCACCAGCCACCGTATTCCAAAACCCACATCTTCCCCCACCCTTCCTCCAAGATCTTCCCCAAATCCACAAATCTCTTTCTCACCTGCTCCTCTCACTCCTCATCATCTCCAACTCTCCAAGAAAA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

332 aa · TkA01G316710|TK1151|PROTEIN

MFKETETNLHAVFFSLAFMAATAFSLSSSIDLYHQHHLQPHRNLRHQPPYSKTHIFPHPSSKIFPKSTNLFLTCSSHSSSSPTLQENPLPTGKFLSNPDLQKLKFLENFKFFHKLPSGSMLLIRVMQEQEMDMTVDLLAESFAESMMLPKTYVKLLGFLVKQYLVERRGLMPHAATLIAFHRRDTDEEGGEVEDIQLAGTVEVSFNKLGANVSPPSPTPPKDAPYICNMTVKKSLRRQGIGWHLLKASEELISEMSSVRE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA01G316710`
TK1151 ID	TkA01G316710
OH-1004 ID	LXL04_020941
关系 / 置信度	序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)	97.800
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 94.578 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA01G316710

位置 Chr01:78609992-78613728 (+)

描述 Protein of unknown function

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g24040`	蛋白乙酰转移酶，具有双重特异性，可触发 N-α-乙酰化 (NTA)，修改范围广泛的 N 端，包括甲硫氨酸、丙氨酸、丝氨酸，以及较少的苏氨酸和缬氨酸作为底物，同时也可进行 ε-赖氨酸乙酰化 (KA)。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_020941 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006474 N-terminal protein amino acid acetylation 生物过程

GO:0018394 peptidyl-lysine acetylation 生物过程

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0004596 protein-N-terminal amino-acid acetyltransferase activity 分子功能

GO:0008080 N-acetyltransferase activity 分子功能

GO:0061733 protein-lysine-acetyltransferase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G24040

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.969

排名 1 · TkA01G316710 · TK1151

细胞核0.034

排名 2 · TkA01G316710 · TK1151

线粒体0.030

排名 3 · TkA01G316710 · TK1151

细胞质0.027

排名 4 · TkA01G316710 · TK1151

细胞膜0.018

排名 5 · TkA01G316710 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF09949APP1_cat90-128 aa

PF00583Acetyltransf_1197-281 aa

PF13673Acetyltransf_10222-264 aa

PF08445FR47224-283 aa

PF13508Acetyltransf_7225-282 aa

PF09949APP1_cat248-326 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA01G316710	`PF09949`	APP1_cat	90	128	0.15	12.7
TkA01G316710	`PF00583`	Acetyltransf_1	197	281	6.7e-06	27.1
TkA01G316710	`PF13673`	Acetyltransf_10	222	264	0.0016	19.2
TkA01G316710	`PF08445`	FR47	224	283	0.016	15.9
TkA01G316710	`PF13508`	Acetyltransf_7	225	282	0.0003	21.8
TkA01G316710	`PF09949`	APP1_cat	248	326	0.15	12.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9LR91`	拟南芥	sp\|Q9LR91\|GNAT5_ARATH GCN5-related N-acetyltransferase 5, chloroplastic	63.600%	Swiss-Prot	中等置信

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