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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G315120
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 78171023-78172688 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1249 bp · TkA01G315120|TK1151|cDNA

CTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTTATATAACGCTACCCCTCCCCTACTAAATCTAAAGAAGGACGCTCCAGAGTATTAATAACTTCTCTCTCTCTCTCTTTCTCTGTTTCTCTCTCTCAAAGTCCATATTATAAATCAAGAAAAAGAAGCTCAAATGAACAACAACTGTGTGGAAATGGGTGGAAGTGAAGAGGATGATCAAATAAACATGATGGAAGATCTCAGAAGAGGTCCATGGACTGTGGAAGAAG...

CDS

下载 CDS FASTA

939 bp · TkA01G315120|TK1151|CDS

ATGAACAACAACTGTGTGGAAATGGGTGGAAGTGAAGAGGATGATCAAATAAACATGATGGAAGATCTCAGAAGAGGTCCATGGACTGTGGAAGAAGATTTCACTCTCATCAATTACATAGCCCATCACGGAGAAGGCCGATGGAATTCTCTTGCTCGTTGTGCGGGGCTTAAAAGAACCGGAAAGAGTTGCCGATTAAGATGGTTGAATTACTTACGACCGGATGTTCGTCGTGGAAATATTACTCTCGAAGAACAACT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

312 aa · TkA01G315120|TK1151|PROTEIN

MNNNCVEMGGSEEDDQINMMEDLRRGPWTVEEDFTLINYIAHHGEGRWNSLARCAGLKRTGKSCRLRWLNYLRPDVRRGNITLEEQLLILELHSRWGNRWSKIAQHLPGRTDNEIKNYWRTRVQKHAKQLKCDVNSKQFKDTMRYLWMPRLIERIQAAATTGGSSSSTTTTSTGNTTNSYPLNQTNMDCIVTSQLVIPQGNNNTCSSYGNTQMITAENSSTTAVSPVSDMTDCYYPANQSQNHESFEHNNPIGGGFTDAM...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G315120
TK1151 IDTkA01G315120
OH-1004 IDLXL04_015358
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)66.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.038 / OH-1004 78.297
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G315120
位置Chr01:78171023-78172688 (+)
描述Similar to MYB78: Transcription factor MYB78
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g49620 转录因子 MYB78。 暂无已核实直接文献
At3g06490 参与调节雄蕊成熟和对茉莉酸信号响应的雄性生育的转录因子。
The BOTRYTIS SUSCEPTIBLE1 gene encodes an R2R3MYB transcription factor protein that is required for biotic and abiotic stress responses in Arabidopsis.2003 · DOI: 10.1105/tpc.014167
MYB108 acts together with MYB24 to regulate jasmonate-mediated stamen maturation in Arabidopsis.2009 · DOI: 10.1104/pp.108.132597
The Arabidopsis Botrytis Susceptible1 Interactor defines a subclass of RING E3 ligases that regulate pathogen and stress responses.2010 · DOI: 10.1104/pp.110.163915
Regulation of ABA dependent wound induced spreading cell death by MYB108.2013 · DOI: 10.1111/nph.12456
At1g68320 磷(Pi)匮乏诱导基因的转录抑制因子。
Phosphate starvation responses and gibberellic acid biosynthesis are regulated by the MYB62 transcription factor in Arabidopsis.2009 · DOI: 10.1093/mp/ssn081

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0315400 参与非生物胁迫响应的转录因子。
A R2R3-type MYB gene, OsMYB2, is involved in salt, cold, and dehydration tolerance in rice.2012 · DOI: 10.1093/jxb/err431
Os11g0684000 茉莉酸（JA）响应转录因子，通过结合其启动子中的AG样基序促进AGO18、AGO1a和AGO1b的表达。
A novel jasmonic acid-inducible rice myb gene associates with fungal infection and host cell death.2001 · DOI: 10.1094/mpmi.2001.14.4.527
Jasmonate Signaling Enhances RNA Silencing and Antiviral Defense in Rice.2020 · DOI: 10.1016/j.chom.2020.05.001
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_015358 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009409 response to cold 生物过程
GO:0009620 response to fungus 生物过程
GO:0009686 gibberellin biosynthetic process 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009740 gibberellic acid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009753 response to jasmonic acid 生物过程
GO:0010015 root morphogenesis 生物过程
GO:0010373 negative regulation of gibberellin biosynthetic process 生物过程
GO:0012501 programmed cell death 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G68320
ath:AT3G06490
ath:AT5G49620
dosa:Os03g0315400
dosa:Os11g0684000
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.963
排名 1 · TkA01G315120 · TK1151
细胞质0.130
排名 2 · TkA01G315120 · TK1151
细胞膜0.021
排名 3 · TkA01G315120 · TK1151
内质网0.012
排名 4 · TkA01G315120 · TK1151
线粒体0.010
排名 5 · TkA01G315120 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00249Myb_DNA-binding25-72 aa
PF23082Myb_DNA-binding_227-53 aa
PF13921Myb_DNA-bind_628-85 aa
PF23588HTH_CHD1_Hrp328-58 aa
PF00249Myb_DNA-binding78-121 aa
PF13921Myb_DNA-bind_682-124 aa
PF15963Myb_DNA-bind_794-142 aa
PF23082Myb_DNA-binding_298-129 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G315120PF00249Myb_DNA-binding25728.1e-36122.6
TkA01G315120PF23082Myb_DNA-binding_227533.98.3
TkA01G315120PF13921Myb_DNA-bind_628852.1e-2176.6
TkA01G315120PF23588HTH_CHD1_Hrp328580.1512.8
TkA01G315120PF00249Myb_DNA-binding781218.1e-36122.6
TkA01G315120PF13921Myb_DNA-bind_6821242.1e-2176.6
TkA01G315120PF15963Myb_DNA-bind_7941420.1612.5
TkA01G315120PF23082Myb_DNA-binding_2981293.98.3
TkA01G315120PF23082Myb_DNA-binding_22983103.98.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FGY3拟南芥sp|Q9FGY3|MYB78_ARATH Transcription factor MYB7857.500%Swiss-Prot高置信
Q9LDE1拟南芥sp|Q9LDE1|MY108_ARATH Transcription factor MYB10857.400%Swiss-Prot高置信
Q9C9G7拟南芥sp|Q9C9G7|MYB62_ARATH Transcription factor MYB6275.000%Swiss-Prot低置信
Q10MB4水稻sp|Q10MB4|MYB2_ORYSJ Transcription factor MYB292.000%Swiss-Prot低置信
Q2QZJ8水稻sp|Q2QZJ8|JAMYB_ORYSJ Transcription factor JAMYB87.500%Swiss-Prot低置信

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