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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G293340
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 73094595-73098244 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1686 bp · TkA01G293340|TK1151|cDNA

AAACAATCCAGTCGTGGCGATCTTACGGTCAAAAAAATGAGCACGGTGGATTAACGCCCACGTGTCCTGGTATTATTGGACTTTCTGTTTCACCTTCCTCTATATACACCGATCCAGCCAATCCCATTTTCTGGAGTCCTACCTAGATACCTGTCCCAATACATTATTTGATCGGAAACCGATATTCGTAATTCATCATCAAATTCAATGGCGAATAAGTCTTTCAAGTACGTGATCGTCGGCGGGGGTGTCTCAGCTGG...

CDS

下载 CDS FASTA

1305 bp · TkA01G293340|TK1151|CDS

ATGGCGAATAAGTCTTTCAAGTACGTGATCGTCGGCGGGGGTGTCTCAGCTGGTTATGCTGCCAGGGAGTTTGCAAAGCAAGGAGTACAACCAGGCGAGCTAGCCATCATTTCAAAAGAGGGGGTGGCTCCATATGAACGTCCTGCACTAAGCAAGGCTTATTTGTTTCCAGAAGGAGCTGCCAGACTTCCAGGTTTTCATACATGTGTTGGAAGTGGAGGAGAGAGACTACTCCCAGAGTGGTACACAGAGAAAGGGAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

434 aa · TkA01G293340|TK1151|PROTEIN

MANKSFKYVIVGGGVSAGYAAREFAKQGVQPGELAIISKEGVAPYERPALSKAYLFPEGAARLPGFHTCVGSGGERLLPEWYTEKGINLILNTEIVKADLASKTLTSAAGETFTYKFLIIATGSTTLKLTDFGVEGASAKNILYLRDIDDADKLVEAIKAKKNGTAVVVGGGYIGLELSAVLKINNFDVKMVYPEPWCMPRLFTAGIAAFYEGYYEKKGVSIIKGTVASGFTSNDNGEVKEVKLKDGRVLEADIVVVGVG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G293340
TK1151 IDTkA01G293340
OH-1004 IDLXL04_003711
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G293340
位置Chr01:73094595-73098244 (+)
描述Similar to AFRR: Monodehydroascorbate reductase
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g52880 催化单脱氢抗坏血酸转化为抗坏血酸，同时氧化 NADH。
Arabidopsis peroxisomes possess functionally redundant membrane and matrix isoforms of monodehydroascorbate reductase.2005 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2005.02503.x

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os09g0567300 催化单脱氢抗坏血酸转化为抗坏血酸，同时氧化 NADH。 暂无已核实直接文献
Os08g0557600 催化单脱氢抗坏血酸转化为抗坏血酸，同时氧化 NADH。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_003711 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0042744 hydrogen peroxide catabolic process 生物过程
GO:0098869 cellular oxidant detoxification 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005777 peroxisome 细胞组分
GO:0005782 peroxisomal matrix 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0048046 apoplast 细胞组分
GO:0000166 nucleotide binding 分子功能
GO:0003729 mRNA binding 分子功能
GO:0016656 monodehydroascorbate reductase (NADH) activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G52880
dosa:Os08g0557600
dosa:Os09g0567300
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.723
排名 1 · TkA01G293340 · TK1151
细胞核0.250
排名 2 · TkA01G293340 · TK1151
线粒体0.139
排名 3 · TkA01G293340 · TK1151
过氧化物酶体0.098
排名 4 · TkA01G293340 · TK1151
质体0.066
排名 5 · TkA01G293340 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07992Pyr_redox_26-320 aa
PF13738Pyr_redox_37-29 aa
PF00070Pyr_redox8-29 aa
PF01266DAO8-33 aa
PF04820Trp_halogenase9-42 aa
PF13454NAD_binding_99-40 aa
PF00890FAD_binding_29-40 aa
PF13450NAD_binding_810-29 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G293340PF07992Pyr_redox_263207.2e-58197.0
TkA01G293340PF13738Pyr_redox_37290.0003220.8
TkA01G293340PF00070Pyr_redox8299.7e-1762.0
TkA01G293340PF01266DAO8330.06713.4
TkA01G293340PF04820Trp_halogenase9423e-0627.1
TkA01G293340PF13454NAD_binding_99400.02215.5
TkA01G293340PF00890FAD_binding_29400.05313.4
TkA01G293340PF13450NAD_binding_810290.1812.8
TkA01G293340PF00070Pyr_redox811039.7e-1762.0
TkA01G293340PF01266DAO831260.06713.4
TkA01G293340PF01593Amino_oxidase851280.03614.1
TkA01G293340PF24346CLIPPER_2941280.2112.4
TkA01G293340PF13454NAD_binding_91011240.02215.5
TkA01G293340PF13738Pyr_redox_31102960.0003220.8
TkA01G293340PF00070Pyr_redox1662479.7e-1762.0
TkA01G293340PF01266DAO1661760.06713.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LFA3拟南芥sp|Q9LFA3|MDAR1_ARATH Monodehydroascorbate reductase 1, peroxisomal75.100%Swiss-Prot高置信
Q652L6水稻sp|Q652L6|MDAR3_ORYSJ Monodehydroascorbate reductase 3, cytosolic77.700%Swiss-Prot高置信
Q6ZJ08水稻sp|Q6ZJ08|MDAR4_ORYSJ Monodehydroascorbate reductase 4, cytosolic80.300%Swiss-Prot高置信

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