TkA01G270140 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA01G270140

当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 67690128-67690801 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

426 bp · TkA01G270140|TK1151|cDNA

ATGAAGTCATCAAGGTTAACGATGACCTCACCCCTGAACATCATCAATTCTTCTGTATCAACTCCTTCGCGCTTTAAAATATATACATACAGTTCATCACATCGCGATCTGAAACCCAAGAACATTCTCGCAAATGCAAATTGCAAATTAAAGATTTGTGATTTTGGTTTAGCGCGTGCTTCATTTGATGATACCCCGTGTCAGCGATTTTTTGGACTGACTACGTGGCCACTAGATGGTATCGCGCTACTGAACTTTGC...

CDS

下载 CDS FASTA

426 bp · TkA01G270140|TK1151|CDS

ATGAAGTCATCAAGGTTAACGATGACCTCACCCCTGAACATCATCAATTCTTCTGTATCAACTCCTTCGCGCTTTAAAATATATACATACAGTTCATCACATCGCGATCTGAAACCCAAGAACATTCTCGCAAATGCAAATTGCAAATTAAAGATTTGTGATTTTGGTTTAGCGCGTGCTTCATTTGATGATACCCCGTGTCAGCGATTTTTTGGACTGACTACGTGGCCACTAGATGGTATCGCGCTACTGAACTTTGC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

141 aa · TkA01G270140|TK1151|PROTEIN

MKSSRLTMTSPLNIINSSVSTPSRFKIYTYSSSHRDLKPKNILANANCKLKICDFGLARASFDDTPCQRFFGLTTWPLDGIALLNFAVHFFSKYTSAIDIWSIGCIFAEMLTGSHCFLEEMLCTNWILLLICLVLLPRNNC

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA01G270140`
TK1151 ID	TkA01G270140
OH-1004 ID	LXL04_014939
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	60.600
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 64.539 / OH-1004 18.672 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA01G270140

位置 Chr01:67690128-67690801 (-)

描述 Similar to MPK9: Mitogen-activated protein kinase 9

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g19010`	丝裂原活化蛋白激酶16。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os05g0582400`	丝裂原活化蛋白激酶9。	暂无已核实直接文献
`Os01g0629900`	丝裂原活化蛋白激酶10。	暂无已核实直接文献
`Os11g0271100`	丝裂原活化蛋白激酶 15。	暂无已核实直接文献
`Os01g0643800`	丝裂原活化蛋白激酶16。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_014939 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0000302 response to reactive oxygen species 生物过程

GO:0007165 signal transduction 生物过程

GO:0009611 response to wounding 生物过程

GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程

GO:0009753 response to jasmonic acid 生物过程

GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程

GO:0042542 response to hydrogen peroxide 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G18150

ath:AT1G73670

ath:AT3G18040

dosa:Os05g0576800

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.410

排名 1 · TkA01G270140 · TK1151

细胞核0.368

排名 2 · TkA01G270140 · TK1151

线粒体0.178

排名 3 · TkA01G270140 · TK1151

内质网0.093

排名 4 · TkA01G270140 · TK1151

细胞膜0.065

排名 5 · TkA01G270140 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03109ABC123-60 aa

PF00069Pkinase31-118 aa

PF12330Haspin_kinase31-61 aa

PF07714PK_Tyr_Ser-Thr34-117 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA01G270140	`PF03109`	ABC1	23	60	0.048	13.5
TkA01G270140	`PF00069`	Pkinase	31	118	5.3e-18	66.1
TkA01G270140	`PF12330`	Haspin_kinase	31	61	0.0012	18.7
TkA01G270140	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	34	117	3.9e-10	40.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q8W4J2`	拟南芥	sp\|Q8W4J2\|MPK16_ARATH Mitogen-activated protein kinase 16	60.600%	Swiss-Prot	中等置信
`Q6L5D4`	水稻	sp\|Q6L5D4\|MPK9_ORYSJ Mitogen-activated protein kinase 9	61.700%	Swiss-Prot	中等置信
`Q5ZCI1`	水稻	sp\|Q5ZCI1\|MPK10_ORYSJ Mitogen-activated protein kinase 10	60.600%	Swiss-Prot	中等置信
`Q53N72`	水稻	sp\|Q53N72\|MPK15_ORYSJ Mitogen-activated protein kinase 15	60.600%	Swiss-Prot	中等置信
`Q5VP69`	水稻	sp\|Q5VP69\|MPK16_ORYSJ Mitogen-activated protein kinase 16	60.600%	Swiss-Prot	中等置信

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