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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G203540
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 51812946-51819949 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

4226 bp · TkA01G203540|TK1151|cDNA

TTTAATTTGAGTTCATCCCACATAGCCGTGGGTGGAAAACTTTGAAGGAAAATGAGCATTATACATACATATAATTTACATTGTCGGTCTCCATCGGCTTATTTGAGCCGTTCTGTTGCCTTCGATTGGTTACGCTTCGATGGCTTATATGAGCCGTTTTCCCACTTTGTGTGTCTGCTTCTTCCCTTCTGATGAGCTTCTTTACACTTTTGTCTTTTGCTTAACACATACGTGTTTCTTTCCCTCTTGCTGTTCGTTCG...

CDS

下载 CDS FASTA

600 bp · TkA01G203540|TK1151|CDS

ATGTTGATCTTCTATATATTGGATGCGGTTCTTTGTTTCCAGTTTTTTTGTTTTGCAGATTTGAAGCTTCCGTTGCTCGACTTTGATATTTATTTCACAGTGGGAGAGGTTTATTGGATGACAGTTCTAACCGTCTATATTTTCCTGTATGGAAGGGCATATTTGGCATTCTCAGGGCTTGATGAGGGGATTAGTACTAGATCCAGAATTCTTGGTAATACTGCATTCAGTGCAGTTTTAAATACTCAATTTTTAGTTCA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

199 aa · TkA01G203540|TK1151|PROTEIN

MLIFYILDAVLCFQFFCFADLKLPLLDFDIYFTVGEVYWMTVLTVYIFLYGRAYLAFSGLDEGISTRSRILGNTAFSAVLNTQFLVQIGVFTAVPMVMAFILELGLLEVPELIILEEQSYMVVLNTKQLVEALLYNTSNLLIPTGSTQEAILSTRICKCNCQDGGDIASYSLYWTFVTKAALPSLLQANHVLIIKNLII

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G203540
TK1151 IDTkA01G203540
OH-1004 IDLXL04_009440
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)86.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 39.196 / OH-1004 4.261
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G203540
位置Chr01:51812946-51819949 (-)
描述Similar to CALS10: Callose synthase 10
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g36850 参与孢子体和配子体的发育。
Dual function of Arabidopsis glucan synthase-like genes GSL8 and GSL10 in male gametophyte development and plant growth.2008 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2008.03462.x
Dysregulation of cell-to-cell connectivity and stomatal patterning by loss-of-function mutation in Arabidopsis chorus (glucan synthase-like 8).2010 · DOI: 10.1242/dev.049197
At3g07160 参与孢子体和配子体的发育。
Dual function of Arabidopsis glucan synthase-like genes GSL8 and GSL10 in male gametophyte development and plant growth.2008 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2008.03462.x
At5g13000 参与胞质分裂过程中形成细胞板的胼胝质合成。 暂无已核实直接文献
At1g05570 参与胞质分裂过程中形成细胞板的胼胝质合成。
An Arabidopsis Callose Synthase, GSL5, Is Required for Wound and Papillary Callose Formation.2003 · DOI: 10.1105/tpc.016097
At2g31960 参与胞质分裂过程中形成细胞板的胼胝质合成。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_009440 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006075 (1->3)-beta-D-glucan biosynthetic process 生物过程
GO:0008360 regulation of cell shape 生物过程
GO:0009555 pollen development 生物过程
GO:0009556 microsporogenesis 生物过程
GO:0009846 pollen germination 生物过程
GO:0009860 pollen tube growth 生物过程
GO:0010208 pollen wall assembly 生物过程
GO:0048589 developmental growth 生物过程
GO:0051592 response to calcium ion 生物过程
GO:0052543 callose deposition in cell wall 生物过程
GO:0055047 generative cell mitosis 生物过程
GO:0071555 cell wall organization 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G05570
ath:AT2G13680
ath:AT2G36850
ath:AT3G07160
ath:AT5G13000
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.334
排名 1 · TkA01G203540 · TK1151
细胞质0.178
排名 2 · TkA01G203540 · TK1151
质体0.145
排名 3 · TkA01G203540 · TK1151
内质网0.143
排名 4 · TkA01G203540 · TK1151
细胞核0.132
排名 5 · TkA01G203540 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

没有找到该查询的结果。

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SJM0拟南芥sp|Q9SJM0|CALSA_ARATH Callose synthase 1067.900%Swiss-Prot低置信
Q9SFU6拟南芥sp|Q9SFU6|CALS9_ARATH Callose synthase 959.300%Swiss-Prot低置信
Q9LXT9拟南芥sp|Q9LXT9|CALS3_ARATH Callose synthase 351.300%Swiss-Prot低置信
Q9AUE0拟南芥sp|Q9AUE0|CALS1_ARATH Callose synthase 148.700%Swiss-Prot低置信
Q9SL03拟南芥sp|Q9SL03|CALS2_ARATH Callose synthase 248.700%Swiss-Prot低置信

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