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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G194810
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 49787227-49793938 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2297 bp · TkA01G194810|TK1151|cDNA

AATATTTAGTAAGTTGATAAGTGCATCTTTTCTCTTTACGTGATTTAATATGATTAACATAACTTTGGTGAACAGTTGTCCCTGTACAATATGGCCTCAACTAAGAGATGCTGAAAATAATAAAACAATTGCTGCATTTGAGCTACCACTAGGGAATACACGATCTGTTAAAACTCTTGCTGACTTTCATGGTTATTTGTATGGTTTGACCAGCTGCCAAATTAACAATGGATCCGGTTGTAAAAACACAAATGAACCTG...

CDS

下载 CDS FASTA

2166 bp · TkA01G194810|TK1151|CDS

ATGATTAACATAACTTTGGTGAACAGTTGTCCCTGTACAATATGGCCTCAACTAAGAGATGCTGAAAATAATAAAACAATTGCTGCATTTGAGCTACCACTAGGGAATACACGATCTGTTAAAACTCTTGCTGACTTTCATGGTTATTTGTATGGTTTGACCAGCTGCCAAATTAACAATGGATCCGGTTGTAAAAACACAAATGAACCTGTGACCATAGTTGTATTCAAGCTCCAAGTCAACGGAGCCGCTGAATATTA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

721 aa · TkA01G194810|TK1151|PROTEIN

MINITLVNSCPCTIWPQLRDAENNKTIAAFELPLGNTRSVKTLADFHGYLYGLTSCQINNGSGCKNTNEPVTIVVFKLQVNGAAEYYVDNMDGFNLPVSVDAIGGSGSGIYKCAKAGCIGQMKGWCPPELKVQGGDGCCSACNVFHAPEYCCSLSFSTPSTCKPTSYAKAFQRVCPRSRTLPYNTDNSTSIFTCEGADYIVRFCPAAGTFSTIQVGGQLRCTDRLTSTNGTFTLGFYGVHFGSLGIWYSNDENNKVWVAE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G194810
TK1151 IDTkA01G194810
OH-1004 IDLXL04_029217
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)33.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 94.730 / OH-1004 50.397
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G194810
位置Chr01:49787227-49793938 (-)
描述Similar to CES101: G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase CES101
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g11300 G型凝集素S-受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶At1g11300。 暂无已核实直接文献
At4g23180 富含半胱氨酸的受体样蛋白激酶 10。 暂无已核实直接文献
At4g23260 富半胱氨酸的类受体蛋白激酶 18。 暂无已核实直接文献
At4g23310 推测的富含半胱氨酸的受体样蛋白激酶23。 暂无已核实直接文献
At4g23240 推测的富含半胱氨酸的受体样蛋白激酶16。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_029217 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006955 immune response 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009620 response to fungus 生物过程
GO:0045087 innate immune response 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005516 calmodulin binding 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0030246 carbohydrate binding 分子功能
GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G67520
ath:AT3G16030
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.821
排名 1 · TkA01G194810 · TK1151
细胞质0.117
排名 2 · TkA01G194810 · TK1151
细胞核0.078
排名 3 · TkA01G194810 · TK1151
内质网0.071
排名 4 · TkA01G194810 · TK1151
溶酶体／液泡0.030
排名 5 · TkA01G194810 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00314Thaumatin8-205 aa
PF01636APH186-209 aa
PF24498Ig_TMEM131L_3242-328 aa
PF01453B_lectin256-329 aa
PF27946C1orf162340-382 aa
PF28423Epiregulin_C352-370 aa
PF00069Pkinase410-678 aa
PF03109ABC1411-437 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G194810PF00314Thaumatin82055.5e-39134.7
TkA01G194810PF01636APH1862090.0002821.4
TkA01G194810PF24498Ig_TMEM131L_32423280.2512.1
TkA01G194810PF01453B_lectin2563290.02715.6
TkA01G194810PF27946C1orf1623403820.1113.1
TkA01G194810PF28423Epiregulin_C3523700.06313.8
TkA01G194810PF00069Pkinase4106787.8e-45154.0
TkA01G194810PF03109ABC14114378.9e-0522.5
TkA01G194810PF07714PK_Tyr_Ser-Thr4126798.2e-44150.6
TkA01G194810PF03109ABC14795608.9e-0522.5
TkA01G194810PF06293Kdo4805530.05113.7
TkA01G194810PF01636APH4955570.0002821.4
TkA01G194810PF12330Haspin_kinase5035590.08112.7
TkA01G194810PF07387Seadorna_VP75105540.08812.5
TkA01G194810PF17667Pkinase_fungal5276010.0003920.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SXB4拟南芥sp|Q9SXB4|Y1130_ARATH G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g1130039.500%Swiss-Prot中等置信
Q8GYA4拟南芥sp|Q8GYA4|CRK10_ARATH Cysteine-rich receptor-like protein kinase 1045.900%Swiss-Prot中等置信
Q8RX80拟南芥sp|Q8RX80|CRK18_ARATH Cysteine-rich receptor-like protein kinase 1844.500%Swiss-Prot中等置信
O65482拟南芥sp|O65482|CRK23_ARATH Putative cysteine-rich receptor-like protein kinase 2343.500%Swiss-Prot中等置信
O65476拟南芥sp|O65476|CRK16_ARATH Putative cysteine-rich receptor-like protein kinase 1644.900%Swiss-Prot中等置信

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