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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G103400
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 26255263-26259395 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2647 bp · TkA01G103400|TK1151|cDNA

AAGAGGACATGCACCATGAAAGAATGTAAAAAAGCAAAAGAATTAAAGAAAGGTTTTAGGGCTGCAGAAGGAGACGTTTCCTCGTTTTTCAGCTGTTTATATTTTCTGACACAACTTTGATATTACAAGAGCAGCACACCCTTTTGTTTTTTTTTTCTCCCTTTTTTTATATATTCCAACTCTACTCCTACTCTCTCTCTCTCCACTGAAAACACAGTGAAAACACCTACAACCATCGACATCTTTGGGATTGCTTTCTC...

CDS

下载 CDS FASTA

2067 bp · TkA01G103400|TK1151|CDS

ATGGCGACATACTACAATGGAAATTCAGAAATTCAAGGGGGAGATGGATTACAGACCCTAGTTCTAATGAATCCTGGATACGTTTATTACTCAGACGCCCAACAATCGCAACCGCAATCAGCTGGGAACTTCTCGTTTCTTGATTCCAATCATCCGGGAAATAATCCGGTGAGTAATCATAATCATAACCACCACAACCACCACGCAAACATGTCTCACAATCCGACACCGCAACCACAACCACCACCCTCCGGCCAGAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

688 aa · TkA01G103400|TK1151|PROTEIN

MATYYNGNSEIQGGDGLQTLVLMNPGYVYYSDAQQSQPQSAGNFSFLDSNHPGNNPVSNHNHNHHNHHANMSHNPTPQPQPPPSGQTQQFVGIPLSASPPSSVHSQHDVSSLHAFIPRAQYMYNPVEMVAAAAPPREVTPFQQGLSLTLSSQQSRYGSQAARVTSISPTGDEGRAAGIAGGSGGSTSSASGISNNGMHNMLLNSKYLKATQEILEEVVNVGKGVLKNSDQLSKSLKAPAIGDGGSQSPVNGEGLRDESGS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G103400
TK1151 IDTkA01G103400
OH-1004 IDLXL04_004828
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 98.256 / OH-1004 81.840
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G103400
位置Chr01:26255263-26259395 (-)
描述Similar to BLH1: BEL1-like homeodomain protein 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g35940 BEL1 样同源结构域蛋白 1。 暂无已核实直接文献
At2g16400 BEL1 样同源域蛋白 7。 暂无已核实直接文献
At4g36870 通过抑制叶片特定亚区的生长来确定叶片形状的转录因子。 暂无已核实直接文献
At1g75410 参与SHOOT MERISTEMLESS（STM，茎端分生组织相关蛋白）核输入的转录因子。 暂无已核实直接文献
At1g19700 BEL1样同源域蛋白10。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_004828 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006357 regulation of transcription by RNA polymerase II 生物过程
GO:0009610 response to symbiotic fungus 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0010197 polar nucleus fusion 生物过程
GO:0010201 response to continuous far red light stimulus by the high-irradiance response system 生物过程
GO:0048510 regulation of timing of transition from vegetative to reproductive phase 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0000976 transcription cis-regulatory region binding 分子功能
GO:0000978 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding 分子功能
GO:0003677 DNA binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G19700
ath:AT1G75410
ath:AT2G16400
ath:AT2G35940
ath:AT4G34610
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.968
排名 1 · TkA01G103400 · TK1151
细胞质0.119
排名 2 · TkA01G103400 · TK1151
细胞膜0.021
排名 3 · TkA01G103400 · TK1151
内质网0.011
排名 4 · TkA01G103400 · TK1151
线粒体0.009
排名 5 · TkA01G103400 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF10428SOG249-240 aa
PF07526POX200-340 aa
PF00046Homeodomain318-334 aa
PF05920Homeobox_KN413-452 aa
PF00046Homeodomain420-452 aa
PF10428SOG2474-534 aa
PF07526POX475-496 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G103400PF10428SOG2492409.66.2
TkA01G103400PF07526POX2003401.6e-48165.3
TkA01G103400PF00046Homeodomain3183346.9e-0729.7
TkA01G103400PF05920Homeobox_KN4134529.7e-2070.9
TkA01G103400PF00046Homeodomain4204526.9e-0729.7
TkA01G103400PF10428SOG24745349.66.2
TkA01G103400PF07526POX4754961.6e-48165.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SJ56拟南芥sp|Q9SJ56|BLH1_ARATH BEL1-like homeodomain protein 144.800%Swiss-Prot中等置信
Q9SIW1拟南芥sp|Q9SIW1|BLH7_ARATH BEL1-like homeodomain protein 754.900%Swiss-Prot低置信
Q9SW80拟南芥sp|Q9SW80|BLH2_ARATH BEL1-like homeodomain protein 250.900%Swiss-Prot低置信
Q9FWS9拟南芥sp|Q9FWS9|BLH3_ARATH BEL1-like homeodomain protein 352.700%Swiss-Prot低置信
Q9FXG8拟南芥sp|Q9FXG8|BLH10_ARATH BEL1-like homeodomain protein 1052.100%Swiss-Prot低置信

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