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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G100560
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 25437365-25439428 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1328 bp · TkA01G100560|TK1151|cDNA

AAATAATGGAGGGATTAAGGAATTGAAATAGGATATACCACTCATCAACTTTTAAAACATTTGTTAAAGATGGTTCGATTGAAGTTCATATATCAGAAAATATTTGGTAGAGAAATTGGTTAGAAAATATATGAAAGATACACGTTATGCAATGGATATTCACGGTGATAATTGAATCTAATTGGAGTTATGGGGTTCGAAAAGACGTTTATGGCTTATTTAGTGGGAATTGAAGAGAAGGATCTGAACCAGAGCTGTCA...

CDS

下载 CDS FASTA

999 bp · TkA01G100560|TK1151|CDS

ATGGGGTTCGAAAAGACGTTTATGGCTTATTTAGTGGGAATTGAAGAGAAGGATCTGAACCAGAGCTGTCACTTTGAATATAAGAAGCTCAAGGACGAATTGAACGATTGCAGGCATAATGAAGCTCCAATTGATTCTCGCGGCGACGGAAACGATGAAGACGATCTCAATTTGATTCTCCCTCATCAATCCTGCCAGCGGTGTGATCGGATGTTCACCGAACTAACAACGGAAGCTACCAAGATGGCGGATTATTTCAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

332 aa · TkA01G100560|TK1151|PROTEIN

MGFEKTFMAYLVGIEEKDLNQSCHFEYKKLKDELNDCRHNEAPIDSRGDGNDEDDLNLILPHQSCQRCDRMFTELTTEATKMADYFSLRVMQLVHLHFSPGMLRFLSCLLPCFKDDQEALIHKGRMLIQFVVMNAIAIRKILKKYDKVHESASGMNFKSKLQAKHLDIMQSPWLIELVAFHMNLTNSDNLMSEEPLDQFSYDLNISDEAPILTLKLKGSENLEYNLTCPICLDIVFQPYGLSCGHIFCKSCACLAAGVLI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G100560
TK1151 IDTkA01G100560
OH-1004 IDLXL04_018885
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)37.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G100560
位置Chr01:25437365-25439428 (+)
描述Similar to BAH1: E3 ubiquitin-protein ligase BAH1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g38920 可能的E3泛素蛋白连接酶BAH1样蛋白。 暂无已核实直接文献
At1g02860 E3 泛素蛋白连接酶，介导 E2 依赖性蛋白泛素化。
BAH1/NLA, a RING-type ubiquitin E3 ligase, regulates the accumulation of salicylic acid and immune responses to Pseudomonas syringae DC3000.2008 · DOI: 10.1104/pp.108.124529

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: A2XK56 可能的 E3 泛素-蛋白连接酶 BAH1 样蛋白 1。 暂无已核实直接文献
Os03g0650900 可能的 E3 泛素-蛋白连接酶 BAH1 样蛋白 1。 暂无已核实直接文献
UniProt: B8B5U8 可能的 E3 泛素-蛋白连接酶 BAH1 样蛋白 1。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_018885 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程
GO:0009627 systemic acquired resistance 生物过程
GO:0009697 salicylic acid biosynthetic process 生物过程
GO:0009751 response to salicylic acid 生物过程
GO:0010167 response to nitrate 生物过程
GO:0010337 regulation of salicylic acid metabolic process 生物过程
GO:0016567 protein ubiquitination 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0080021 response to benzoic acid 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G02860
dosa:Os03g0650900
dosa:Os07g0673200
osa:4333590
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.489
排名 1 · TkA01G100560 · TK1151
细胞核0.411
排名 2 · TkA01G100560 · TK1151
细胞膜0.158
排名 3 · TkA01G100560 · TK1151
内质网0.072
排名 4 · TkA01G100560 · TK1151
溶酶体／液泡0.070
排名 5 · TkA01G100560 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00097zf-C3HC423-39 aa
PF03105SPX27-48 aa
PF13923zf-C3HC4_229-39 aa
PF00097zf-C3HC462-68 aa
PF24921RING_XB3-XBAT3162-71 aa
PF13923zf-C3HC4_262-68 aa
PF13920zf-C3HC4_362-71 aa
PF01363FYVE63-74 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G100560PF00097zf-C3HC423395.9e-0626.8
TkA01G100560PF03105SPX27480.0001123.1
TkA01G100560PF13923zf-C3HC4_229390.0005920.3
TkA01G100560PF00097zf-C3HC462685.9e-0626.8
TkA01G100560PF24921RING_XB3-XBAT3162719e-0523.2
TkA01G100560PF13923zf-C3HC4_262680.0005920.3
TkA01G100560PF13920zf-C3HC4_362710.004517.5
TkA01G100560PF01363FYVE63740.5611.1
TkA01G100560PF13639zf-RING_264680.005817.6
TkA01G100560PF14634zf-RING_565713.3e-0524.5
TkA01G100560PF03105SPX1271490.0001123.1
TkA01G100560PF21936Pcf11_C1441580.7810.4
TkA01G100560PF14835zf-RING_62222560.1312.9
TkA01G100560PF29536PTR3_N2222322.78.4
TkA01G100560PF11789zf-Nse2232760.04914.2
TkA01G100560PF21936Pcf11_C2232390.7810.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8GW10拟南芥sp|Q8GW10|BAH1L_ARATH Probable E3 ubiquitin-protein ligase BAH1-like46.300%Swiss-Prot中等置信
Q9SRX9拟南芥sp|Q9SRX9|NLA_ARATH E3 ubiquitin-protein ligase NLA40.100%Swiss-Prot中等置信
A2XK56水稻sp|A2XK56|BAHL1_ORYSI Probable E3 ubiquitin-protein ligase BAH1-like 146.900%Swiss-Prot中等置信
Q7XZZ3水稻sp|Q7XZZ3|BAHL1_ORYSJ Probable E3 ubiquitin-protein ligase BAH1-like 146.900%Swiss-Prot中等置信
B8B5U8水稻sp|B8B5U8|BAHL2_ORYSI Probable E3 ubiquitin-protein ligase BAH1-like 136.800%Swiss-Prot中等置信

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