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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G098220
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 24811838-24815859 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3172 bp · TkA01G098220|TK1151|cDNA

ATGAACAATGTTAAGCAATTACACAAACAATCAGGTGCAAATTTTAGAAGAGATGAAGAAATGTCTACCCATGAAATCCCACCTTACTCACCCAAATCCCTCAAACACACATCCGCCGCCAGATCTCTTTCGAGATCCGTCAATTACATCCTCAAAGAACAACGCCTTCACTTCACCCTAGTAGGAATCCTCATCGGCTCCGTCTTCTTCATCTACAAACCATCATTATCCACCATTTCCACAATTGACACCATTACGAG...

CDS

下载 CDS FASTA

1308 bp · TkA01G098220|TK1151|CDS

ATGAACAATGTTAAGCAATTACACAAACAATCAGGTGCAAATTTTAGAAGAGATGAAGAAATGTCTACCCATGAAATCCCACCTTACTCACCCAAATCCCTCAAACACACATCCGCCGCCAGATCTCTTTCGAGATCCGTCAATTACATCCTCAAAGAACAACGCCTTCACTTCACCCTAGTAGGAATCCTCATCGGCTCCGTCTTCTTCATCTACAAACCATCATTATCCACCATTTCCACAATTGACACCATTACGAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

435 aa · TkA01G098220|TK1151|PROTEIN

MNNVKQLHKQSGANFRRDEEMSTHEIPPYSPKSLKHTSAARSLSRSVNYILKEQRLHFTLVGILIGSVFFIYKPSLSTISTIDTITRKEIPSMRVVSFSQPTTYGATGRIPVGIARKRMRVVVTGGSGFVGSHLVDKLMARGDDVIVIDNFFTGRKENVAHHFDNPRFELIRHDVVEPILLEVDQIYHLACPASPVHYKYNPVKTIKTNVMGTLNMLGLAKRIGAKFLLTSTSEVYGDPLEHPQKETYWGHVNPIGVRSC...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G098220
TK1151 IDTkA01G098220
OH-1004 IDLXL04_004903
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)98.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G098220
位置Chr01:24811838-24815859 (+)
描述Similar to UXS1: UDP-glucuronic acid decarboxylase 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g53520 催化 UDP-葡萄糖醛酸向 UDP-木糖的 NAD 依赖性脱羧。 暂无已核实直接文献
At3g62830 催化 UDP-葡萄糖醛酸向 UDP-木糖的 NAD 依赖性脱羧。
Biosynthesis of UDP-xylose: characterization of membrane-bound AtUxs2.2005 · DOI: 10.1007/s00425-004-1471-7
At2g47650 催化 UDP-葡萄糖醛酸向 UDP-木糖的 NAD 依赖性脱羧。 暂无已核实直接文献
At3g46440 催化 UDP-葡萄糖醛酸向 UDP-木糖的 NAD 依赖性脱羧。 暂无已核实直接文献
At2g28760 催化 UDP-葡萄糖醛酸向 UDP-木糖的 NAD 依赖性脱羧。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_004903 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0019305 dTDP-rhamnose biosynthetic process 生物过程
GO:0033320 UDP-D-xylose biosynthetic process 生物过程
GO:0042732 D-xylose metabolic process 生物过程
GO:0045492 xylan biosynthetic process 生物过程
GO:0000138 Golgi trans cisterna 细胞组分
GO:0000139 Golgi membrane 细胞组分
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005768 endosome 细胞组分
GO:0005773 vacuole 细胞组分
GO:0005777 peroxisome 细胞组分
GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G28760
ath:AT2G47650
ath:AT3G46440
ath:AT3G53520
ath:AT3G62830
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

高尔基体0.427
排名 1 · TkA01G098220 · TK1151
内质网0.331
排名 2 · TkA01G098220 · TK1151
细胞质0.104
排名 3 · TkA01G098220 · TK1151
溶酶体／液泡0.084
排名 4 · TkA01G098220 · TK1151
细胞膜0.072
排名 5 · TkA01G098220 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF04321RmlD_sub_bind119-376 aa
PF01370Epimerase121-354 aa
PF02719Polysacc_synt_2121-232 aa
PF00106adh_short121-174 aa
PF010733Beta_HSD122-335 aa
PF16363GDP_Man_Dehyd123-417 aa
PF07993NAD_binding_4123-145 aa
PF07993NAD_binding_4176-288 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G098220PF04321RmlD_sub_bind1193762.4e-1040.7
TkA01G098220PF01370Epimerase1213542.5e-47162.0
TkA01G098220PF02719Polysacc_synt_21212321.2e-0731.9
TkA01G098220PF00106adh_short1211740.1512.3
TkA01G098220PF010733Beta_HSD1223351.3e-1351.4
TkA01G098220PF16363GDP_Man_Dehyd1234177.9e-56190.6
TkA01G098220PF07993NAD_binding_41231456.6e-1349.1
TkA01G098220PF07993NAD_binding_41762886.6e-1349.1
TkA01G098220PF00106adh_short2042170.1512.3
TkA01G098220PF02719Polysacc_synt_22613741.2e-0731.9
TkA01G098220PF07993NAD_binding_43633846.6e-1349.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8VZC0拟南芥sp|Q8VZC0|UXS1_ARATH UDP-glucuronic acid decarboxylase 177.300%Swiss-Prot高置信
Q9LZI2拟南芥sp|Q9LZI2|UXS2_ARATH UDP-glucuronic acid decarboxylase 272.600%Swiss-Prot高置信
Q8S8T4拟南芥sp|Q8S8T4|UXS4_ARATH UDP-glucuronic acid decarboxylase 469.400%Swiss-Prot高置信
Q9SN95拟南芥sp|Q9SN95|UXS5_ARATH UDP-glucuronic acid decarboxylase 570.400%Swiss-Prot高置信
Q9ZV36拟南芥sp|Q9ZV36|UXS6_ARATH UDP-glucuronic acid decarboxylase 670.700%Swiss-Prot高置信

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