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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G096850
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 24480295-24482617 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

765 bp · TkA01G096850|TK1151|cDNA

ATGGCTCAATTTACGCTTAGTAACGCAAGGCCTACCCCGACAGCAACCGGCGATGGAGGAGCTGCTACTCTGTCGCACCGGCGGGAGGTTAGACACCGCACTAGTCGCCGGAGGAAGAACGAAGATGGGCAGGAGCGGCTGGAAGCAAAACGCGAGAGAGAGAGAGGGAGAACCGCTATTTTAGTTGCAGCAACTGAATCATACATCCGGGTCTTGGAACTTGTTCTTGGTGGTATTGGAAGTATCACCGTTGTTGATGG...

CDS

下载 CDS FASTA

765 bp · TkA01G096850|TK1151|CDS

ATGGCTCAATTTACGCTTAGTAACGCAAGGCCTACCCCGACAGCAACCGGCGATGGAGGAGCTGCTACTCTGTCGCACCGGCGGGAGGTTAGACACCGCACTAGTCGCCGGAGGAAGAACGAAGATGGGCAGGAGCGGCTGGAAGCAAAACGCGAGAGAGAGAGAGGGAGAACCGCTATTTTAGTTGCAGCAACTGAATCATACATCCGGGTCTTGGAACTTGTTCTTGGTGGTATTGGAAGTATCACCGTTGTTGATGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

254 aa · TkA01G096850|TK1151|PROTEIN

MAQFTLSNARPTPTATGDGGAATLSHRREVRHRTSRRRKNEDGQERLEAKRERERGRTAILVAATESYIRVLELVLGGIGSITVVDGSKVENGDLGNNFMVSESSLGQPKEKCVCAFLQELNDAVKAKFIKEHPLVEDSMVKLDRICRDENVMVIFARSYGLTGFVRISVKEHAVIESKPDHFLDDLRFTESVNLDTTDPVAHKHTPYILILVKMASVGENLPWCRISVAKNLLWCRFTGRRFCVSYVCTNMFP

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G096850
TK1151 IDTkA01G096850
OH-1004 IDLXL04_035848
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)78.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 56.693 / OH-1004 33.397
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G096850
位置Chr01:24480295-24482617 (-)
描述Similar to AXR1: NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit AXR1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g32410 二聚体 ECR1-AXL1 E1 酶的调节亚基。
AXR1-ECR1 and AXL1-ECR1 heterodimeric RUB-activating enzymes diverge in function in Arabidopsis thaliana.2011 · DOI: 10.1007/s11103-011-9750-8
At1g05180 二聚体 ECR1-AXR1 E1 酶的调节亚基。
Multiple ubiquitin ligase-mediated processes require COP9 signalosome and AXR1 function.2002 · DOI: 10.1105/tpc.003434
AXL and AXR1 have redundant functions in RUB conjugation and growth and development in Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03211.x
AXR1-ECR1 and AXL1-ECR1 heterodimeric RUB-activating enzymes diverge in function in Arabidopsis thaliana.2011 · DOI: 10.1007/s11103-011-9750-8
Crossover localisation is regulated by the neddylation posttranslational regulatory pathway.2014 · DOI: 10.1371/journal.pbio.1001930
Arabidopsis auxin-resistance gene AXR1 encodes a protein related to ubiquitin-activating enzyme E1.1993 · DOI: 10.1038/364161a0

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_035848 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006281 DNA repair 生物过程
GO:0007131 reciprocal meiotic recombination 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009734 auxin-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009735 response to cytokinin 生物过程
GO:0009791 post-embryonic development 生物过程
GO:0009965 leaf morphogenesis 生物过程
GO:0019954 asexual reproduction 生物过程
GO:0033314 mitotic DNA replication checkpoint signaling 生物过程
GO:0043326 chemotaxis to folate 生物过程
GO:0043327 chemotaxis to cAMP 生物过程
GO:0045116 protein neddylation 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G05180
ath:AT2G32410
ddi:DDB_G0287965
mmu:234664
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.425
排名 1 · TkA01G096850 · TK1151
细胞核0.386
排名 2 · TkA01G096850 · TK1151
线粒体0.138
排名 3 · TkA01G096850 · TK1151
细胞膜0.096
排名 4 · TkA01G096850 · TK1151
内质网0.082
排名 5 · TkA01G096850 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF27072KilB20-64 aa
PF00899ThiF74-132 aa
PF00899ThiF141-170 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G096850PF27072KilB20640.009417.3
TkA01G096850PF00899ThiF741323.7e-0730.3
TkA01G096850PF00899ThiF1411703.7e-0730.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9ZV69拟南芥sp|Q9ZV69|AXL1_ARATH NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit AXL59.800%Swiss-Prot中等置信
P42744拟南芥sp|P42744|AXR1_ARATH NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit AXR158.400%Swiss-Prot中等置信

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