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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G089490
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 22747317-22751782 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3150 bp · TkA01G089490|TK1151|cDNA

CCGTTAAACCCTAGCACCCAAAAACCTCAACCGGAACAATTGCACCAAACGAAGAAGGAAGCAAGGCAAAAGAATCAAAATGGTGAAGTCGTACCTCCGGTATGAGCCGGCGACGGCGTTCGGAGTGATTGCGTCAGTGGATACTAACATCACATACGACACCACCGGTAAACATCTACTAGCTCCGGCTCTTGAGAAGGTCGGCGTTTGGCATGTCCGTCAAGGCGTCTGTGCTAAAACGCTTACGCCTTCTACCCAAA...

CDS

下载 CDS FASTA

2652 bp · TkA01G089490|TK1151|CDS

ATGGTGAAGTCGTACCTCCGGTATGAGCCGGCGACGGCGTTCGGAGTGATTGCGTCAGTGGATACTAACATCACATACGACACCACCGGTAAACATCTACTAGCTCCGGCTCTTGAGAAGGTCGGCGTTTGGCATGTCCGTCAAGGCGTCTGTGCTAAAACGCTTACGCCTTCTACCCAAAACCGTGGCCCTTCTTTAGCTGTTACTTCCATTGCAGCCGTGCCTTCTTCTTCATCTCTGATAGCCAGTGGGCACGCCGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

883 aa · TkA01G089490|TK1151|PROTEIN

MVKSYLRYEPATAFGVIASVDTNITYDTTGKHLLAPALEKVGVWHVRQGVCAKTLTPSTQNRGPSLAVTSIAAVPSSSSLIASGHADGSIRIWDCERGTCETTLNGHKGATTILRFNKTGSILASGSKDNDIVIWDVIGEVGLYRLRGHRDQITDLAFLDSGKKLVSASKDKFLRVWDLDTQHCTQIIGGHHSEIWSIDVDPEQRYLVTGSADSELRFYTIKQENTETDNKDTSIDNKWEILKPFGEIQRQNKERVATLT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G089490
TK1151 IDTkA01G089490
OH-1004 IDLXL04_005096
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)93.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G089490
位置Chr01:22747317-22751782 (-)
描述Similar to Wdr3: WD repeat-containing protein 3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

当前来源表未检出该物种的同源命中。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_005096 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000447 endonucleolytic cleavage in ITS1 to separate SSU-rRNA from 5.8S rRNA and LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) 生物过程
GO:0000462 maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) 生物过程
GO:0000472 endonucleolytic cleavage to generate mature 5'-end of SSU-rRNA from (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) 生物过程
GO:0000480 endonucleolytic cleavage in 5'-ETS of tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) 生物过程
GO:0030490 maturation of SSU-rRNA 生物过程
GO:0042274 ribosomal small subunit biogenesis 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005654 nucleoplasm 细胞组分
GO:0005730 nucleolus 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0030686 90S preribosome 细胞组分
GO:0031965 nuclear membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ddi:DDB_G0282623
hsa:10885
mmu:269470
sce:YLR129W
spo:2540971
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.947
排名 1 · TkA01G089490 · TK1151
细胞质0.117
排名 2 · TkA01G089490 · TK1151
线粒体0.014
排名 3 · TkA01G089490 · TK1151
细胞膜0.013
排名 4 · TkA01G089490 · TK1151
内质网0.008
排名 5 · TkA01G089490 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF23798Beta-prop_SPT815-157 aa
PF23869Beta-prop_WDR75_1st18-137 aa
PF24805EIF3I22-103 aa
PF25174Beta-prop_THOC324-222 aa
PF25175Beta-prop_WDR525-104 aa
PF21029RMC1_N25-100 aa
PF24782WD40_MABP1-WDR62_2nd27-136 aa
PF25172Beta-prop_WDR3_2nd28-57 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G089490PF23798Beta-prop_SPT8151571.2e-1248.2
TkA01G089490PF23869Beta-prop_WDR75_1st181378e-1865.5
TkA01G089490PF24805EIF3I221033.6e-49168.4
TkA01G089490PF25174Beta-prop_THOC3242222.1e-83280.2
TkA01G089490PF25175Beta-prop_WDR5251041.3e-85288.0
TkA01G089490PF21029RMC1_N251004.1e-0524.3
TkA01G089490PF24782WD40_MABP1-WDR62_2nd271362.9e-30106.1
TkA01G089490PF25172Beta-prop_WDR3_2nd28572.8e-162539.6
TkA01G089490PF25171Beta-prop_WDR36-Utp21_1st302199.2e-35121.1
TkA01G089490PF25173Beta-prop_WDR3_1st312212.8e-122406.0
TkA01G089490PF24807WD40_CDC20-Fz312313e-55188.3
TkA01G089490PF23586Beta-prop_NWD2_C391043.9e-1143.4
TkA01G089490PF23409Beta-prop_EML401368.7e-31108.1
TkA01G089490PF25460Beta-prop_Aladin401031.7e-2177.5
TkA01G089490PF25391WD40_Gbeta41563.9e-35122.2
TkA01G089490PF16756PALB2_WD4041624.9e-0523.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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