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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkA01G033520
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 8705427-8724570 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

5686 bp · TkA01G033520|TK1151|cDNA

TGCAATTTTATTCAAACGGAGAAAATTCTTTCAAATATAAACCGCAAACGTCTTATCCTTTTGCTTCTTCATCTGCAACTTTGCATCCTTTGAAATCAAAAGTCTCAACAAAGCAAAACAAACAATCTTTCCTTTTTCCGAACTCCAATGGCTGAAATCGTTGTTAGCGCCGTCATCACCGCACTGTGTGAAAGGCTGATCTCTGGAGACTTGTTGAAGCTGGCTCGATTAGAAGGGATCGATTCTCAGCTGCACAAATT...

3195 bp · TkA01G033520|TK1151|CDS

ATGGCTGAAATCGTTGTTAGCGCCGTCATCACCGCACTGTGTGAAAGGCTGATCTCTGGAGACTTGTTGAAGCTGGCTCGATTAGAAGGGATCGATTCTCAGCTGCACAAATTGAAGAAAAACTTGCTCATGATCCAAGCGGTGCTTGCTGATGCAAGCCAGAAGCACATAACCGACAGAGCTGTTCAACTGTGGGTGACTGAGCTCCAGGAATTGGCTTACGACATAGATGATGTACTTGATGATTTGGCTACCGAAGA...

1064 aa · TkA01G033520|TK1151|PROTEIN

MAEIVVSAVITALCERLISGDLLKLARLEGIDSQLHKLKKNLLMIQAVLADASQKHITDRAVQLWVTELQELAYDIDDVLDDLATEDIRRKLNQEDSASTSNITGKVLKLFPNCCTNFTPRNITGLAKLREVSTKLRDLVDQKNDLGLNVNVERSNITERRLEQTSLVDDESKIMGREGDKEALLEKLLGKEECVKNVSIVSIVGMGGIGKTTLAKLLYNDQKVNDQFKLKAWVCVSEELDVFSVSKAIFQAVTGENKDF...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G033520
TK1151 IDTkA01G033520
OH-1004 IDLXL04_005570
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)87.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 57.670
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G033520
位置Chr01:8705427-8724570 (-)
描述Similar to KIN14K: Kinesin-like protein KIN-14K
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g14470 潜在的抗病蛋白。 暂无已核实直接文献
At3g14460 潜在的抗病蛋白。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_005570 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0007017 microtubule-based process 生物过程
GO:0007018 microtubule-based movement 生物过程
GO:0098542 defense response to other organism 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005874 microtubule 细胞组分
GO:0015630 microtubule cytoskeleton 细胞组分
GO:0003777 microtubule motor activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0008017 microtubule binding 分子功能
GO:0043531 ADP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G63640
ath:AT3G14470
ath:AT5G41310
dosa:Os01g0744000
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

细胞膜0.663
排名 1 · TkA01G033520 · TK1151
细胞质0.204
排名 2 · TkA01G033520 · TK1151
细胞核0.134
排名 3 · TkA01G033520 · TK1151
内质网0.079
排名 4 · TkA01G033520 · TK1151
质体0.038
排名 5 · TkA01G033520 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF18052Rx_N5-94 aa
PF19993DO-GTPase243-72 aa
PF13191AAA_1653-98 aa
PF23598LRR_1463-133 aa
PF13855LRR_8106-131 aa
PF18052Rx_N126-142 aa
PF13191AAA_16175-243 aa
PF00931NB-ARC178-348 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G033520PF18052Rx_N5947e-2174.9
TkA01G033520PF19993DO-GTPase243720.3111.4
TkA01G033520PF13191AAA_1653980.0216.1
TkA01G033520PF23598LRR_14631336.2e-2691.7
TkA01G033520PF13855LRR_81061312.3e-0731.2
TkA01G033520PF18052Rx_N1261427e-2174.9
TkA01G033520PF13191AAA_161752430.0216.1
TkA01G033520PF00931NB-ARC1783487.6e-38130.5
TkA01G033520PF20720nSTAND31942430.007316.7
TkA01G033520PF00005ABC_tran1952230.03415.5
TkA01G033520PF13401AAA_221992860.008817.1
TkA01G033520PF13173AAA_141993130.009816.6
TkA01G033520PF05729NACHT2003430.01316.1
TkA01G033520PF19993DO-GTPase22002950.3111.4
TkA01G033520PF02760HIN2452880.1312.7
TkA01G033520PF23286LRR_133163801.69.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LRR4拟南芥sp|Q9LRR4|R13L1_ARATH Putative disease resistance RPP13-like protein 139.400%Swiss-Prot中等置信
Q9LRR5拟南芥sp|Q9LRR5|DRL21_ARATH Putative disease resistance protein At3g1446034.600%Swiss-Prot中等置信

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