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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkA01G032800
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 8507135-8517464 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

2090 bp · TkA01G032800|TK1151|cDNA

AGTTAAGCGGCATCTTAACATAAGTGATACTCCAAATCTGCAAAAGATGCCCTTAGGGATTGCTAGGTTGACGAGTCTACAAACTCTAACCAAGGTCATTGTTGAAGGAGCTAATAGGTTCATAATATCCGATCTTAAGGGTCTAGCGGATCTTCAAGGTCGACTTTCCATTATCGGTCTAGAGAAAGTGATAGATCCAATACAAGCAATGAATGCCAACTTACATCAAAAGAAAGATCTTGATGTTTTGGAGATGGAAT...

3687 bp · TkA01G032800|TK1151|CDS

ATGGCTGAAATCATTGTTAGCGCCGTCATCACCGTGCTGTGTGAAAAGCTAATCTCTGGAGACTTGTTGAAGTTGGCTCGATCAGAAGGGATCGACTCTCAGCTGCAGAAATTGAAGAAAAACTTGCCGCTAATCCAGGCGGTGCTTGCTGATGCAAGCCAGAAGCACATAACAGACAAAGCTGTTCAATTGTGGGTGAACGAGCTCCAAGAATTGGCTTACGACATAGATGATGTACTCGATGATTTGGCTACTGAAGC...

1228 aa · TkA01G032800|TK1151|PROTEIN

MAEIIVSAVITVLCEKLISGDLLKLARSEGIDSQLQKLKKNLPLIQAVLADASQKHITDKAVQLWVNELQELAYDIDDVLDDLATEAIRRKLNQEATASTSNVTGKMLKLFPSCCTNFTPRNITYGHQMSSKLDEVSTKLRDLVDQKNDLGLNVNVGGSNERERRQEETSLVDESRIIGREGDKEALLEKLLGNEECVENVSIVSIVGMGGIGKTTLAKLLYNDRKVKDHFEVKAWVCVSEDLDVFSVSKAIFQAVTQEN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G032800
TK1151 IDTkA01G032800
OH-1004 IDLXL04_005570
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)84.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 96.987 / OH-1004 63.442
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G032800
位置Chr01:8507135-8517464 (+)
描述Similar to KIN14K: Kinesin-like protein KIN-14K
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g14470 潜在的抗病蛋白。 暂无已核实直接文献
At3g14460 潜在的抗病蛋白。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_005570 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0007017 microtubule-based process 生物过程
GO:0007018 microtubule-based movement 生物过程
GO:0098542 defense response to other organism 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005874 microtubule 细胞组分
GO:0015630 microtubule cytoskeleton 细胞组分
GO:0003777 microtubule motor activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0008017 microtubule binding 分子功能
GO:0043531 ADP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G63640
ath:AT3G14470
ath:AT5G41310
dosa:Os01g0744000
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

细胞膜0.542
排名 1 · TkA01G032800 · TK1151
细胞质0.288
排名 2 · TkA01G032800 · TK1151
细胞核0.210
排名 3 · TkA01G032800 · TK1151
内质网0.077
排名 4 · TkA01G032800 · TK1151
质体0.045
排名 5 · TkA01G032800 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF18052Rx_N5-94 aa
PF19993DO-GTPase210-72 aa
PF13191AAA_1649-95 aa
PF13238AAA_18131-204 aa
PF13173AAA_14133-173 aa
PF13191AAA_16177-278 aa
PF00931NB-ARC181-350 aa
PF20720nSTAND3197-232 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G032800PF18052Rx_N5945.4e-2381.6
TkA01G032800PF19993DO-GTPase210721.59.1
TkA01G032800PF13191AAA_1649950.003918.4
TkA01G032800PF13238AAA_181312040.1313.4
TkA01G032800PF13173AAA_141331730.002418.6
TkA01G032800PF13191AAA_161772780.003918.4
TkA01G032800PF00931NB-ARC1813505.3e-39134.3
TkA01G032800PF20720nSTAND31972320.006916.8
TkA01G032800PF00005ABC_tran1982260.04115.2
TkA01G032800PF13401AAA_222022890.002219.0
TkA01G032800PF13173AAA_142023170.002418.6
TkA01G032800PF05729NACHT2033480.0006820.2
TkA01G032800PF19993DO-GTPase22032991.59.1
TkA01G032800PF13238AAA_182052990.1313.4
TkA01G032800PF23247LRR_RPS22572722.3e-1660.9
TkA01G032800PF23559WHD_DRP4385061.9e-2486.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LRR4拟南芥sp|Q9LRR4|R13L1_ARATH Putative disease resistance RPP13-like protein 139.900%Swiss-Prot中等置信
Q9LRR5拟南芥sp|Q9LRR5|DRL21_ARATH Putative disease resistance protein At3g1446034.700%Swiss-Prot中等置信

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