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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G023280
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 5966298-5968649 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1567 bp · TkA01G023280|TK1151|cDNA

CTCATCTTCTCATATAAATAATCATGTTCTTGCGACCACTTTTATCCACACTACCCCTACCAATTTTTTTATCATTCTCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTAGTAATGTCTGAAGAGGAAATGAACTTATCAGTGAACGTTAACGGTCAATCCAAGGTGCCTCCGGGTTTTCGTTTTCATCCTACCGAAGAAGAGCTTCTTCACTACTACTTAAGGAAGAAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1026 bp · TkA01G023280|TK1151|CDS

ATGCAAGATAGGATCCACCCCGCAAATGATTGGTACTTCTTTAGTCATAAAGACAAGAAGTACCCAACTGGGACCCGAACCAATCGTGCAACTGCTGCCGGATTCTGGAAAGCCACCGGCCGTGATAAAGTTATTTATAGCAGCGTTACAAGAATTGGTATGAGGAAGACACTTGTGTTCTATAAAGGGCGAGCTCCACATGGCCTGAAATCTGATTGGATAATGCATGAATATAGGCTTGATGATAACACCGTTACTTC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

341 aa · TkA01G023280|TK1151|PROTEIN

MQDRIHPANDWYFFSHKDKKYPTGTRTNRATAAGFWKATGRDKVIYSSVTRIGMRKTLVFYKGRAPHGLKSDWIMHEYRLDDNTVTSQDACNSNLCDSTQEDGWVVCRVFKKKNYHKALENPQRSLSSSMDSRTQLQSLNKDGVLDHLLVYMGSNTNKSCKQETDSLTAMQQFVTPIADRFFHLPRLDSPTMTTTLSPHDHSSGSFDQGLSFKPVVNDFMCTDSDQLQRNNTNANLIDVHHESRERLDNWADLERLVASQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G023280
TK1151 IDTkA01G023280
OH-1004 IDLXL04_005699
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 98.240 / OH-1004 82.310
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G023280
位置Chr01:5966298-5968649 (-)
描述Similar to NAC043: NAC domain-containing protein 43
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g46770 参与次生壁生物合成的基因转录激活剂。
The NAC transcription factors NST1 and NST2 of Arabidopsis regulate secondary wall thickenings and are required for anther dehiscence.2005 · DOI: 10.1105/tpc.105.036004
NAC transcription factors, NST1 and NST3, are key regulators of the formation of secondary walls in woody tissues of Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1105/tpc.106.047043
Two NAC domain transcription factors, SND1 and NST1, function redundantly in regulation of secondary wall synthesis in fibers of Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1007/s00425-007-0498-y
ZINC FINGER PROTEIN2 suppresses funiculus lignification to ensure seed loading efficiency in Arabidopsis.2025 · DOI: 10.1016/j.devcel.2025.01.021
At1g32770 参与二级细胞壁生物合成基因的转录激活因子。
SND1, a NAC domain transcription factor, is a key regulator of secondary wall synthesis in fibers of Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1105/tpc.106.047399
NAC transcription factors, NST1 and NST3, are key regulators of the formation of secondary walls in woody tissues of Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1105/tpc.106.047043
Two NAC domain transcription factors, SND1 and NST1, function redundantly in regulation of secondary wall synthesis in fibers of Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1007/s00425-007-0498-y
The MYB46 transcription factor is a direct target of SND1 and regulates secondary wall biosynthesis in Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1105/tpc.107.053678
At3g61910 参与次生壁生物合成的基因转录激活剂。
The NAC transcription factors NST1 and NST2 of Arabidopsis regulate secondary wall thickenings and are required for anther dehiscence.2005 · DOI: 10.1105/tpc.105.036004
At1g33280 转录激活剂。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os06g0530400 可能参与应激反应的转录因子。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_005699 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0003002 regionalization 生物过程
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0009834 plant-type secondary cell wall biogenesis 生物过程
GO:0010047 fruit dehiscence 生物过程
GO:0010455 positive regulation of cell fate commitment 生物过程
GO:0045893 positive regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0048829 root cap development 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0000976 transcription cis-regulatory region binding 分子功能
GO:0003677 DNA binding 分子功能
GO:0003700 DNA-binding transcription factor activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G32770
ath:AT1G79580
ath:AT2G46770
ath:AT3G61910
dosa:Os06g0530400
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.969
排名 1 · TkA01G023280 · TK1151
细胞质0.095
排名 2 · TkA01G023280 · TK1151
细胞膜0.037
排名 3 · TkA01G023280 · TK1151
内质网0.031
排名 4 · TkA01G023280 · TK1151
质体0.014
排名 5 · TkA01G023280 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02365NAM8-80 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G023280PF02365NAM8802.5e-2486.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q84WP6拟南芥sp|Q84WP6|NAC43_ARATH NAC domain-containing protein 4349.100%Swiss-Prot中等置信
Q9LPI7拟南芥sp|Q9LPI7|NAC12_ARATH NAC domain-containing protein 1245.600%Swiss-Prot中等置信
Q9M274拟南芥sp|Q9M274|NAC66_ARATH NAC domain-containing protein 6653.300%Swiss-Prot中等置信
Q9C878拟南芥sp|Q9C878|BRN1_ARATH Protein BEARSKIN161.700%Swiss-Prot低置信
Q5Z6B6水稻sp|Q5Z6B6|NAC76_ORYSJ NAC domain-containing protein 7669.200%Swiss-Prot低置信

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