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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA01G015560
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 3976355-3982958 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

4995 bp · TkA01G015560|TK1151|cDNA

TCAGAATTTCAGATTACTACTCTGTCTGGCTCTCACTCTCTCACACACAAACACACACTAAATCCGATTAAAAATTTTCAGCTGGATTTCTGATTCGCTGTTGGAGGGGTGATCCGGCGGAGTTTTAAGCTTCGTTTCATCGGAAATTTGGAGGATCAAGGTCCATTGTGATAAAGAAACAGATTGCCTTGAACACCATCTTTGCTCTTCTGTCAAACACTGAGCTGTTCTTGAAGATTTGAGGAGCATTTTGTGAAAAC...

CDS

下载 CDS FASTA

4659 bp · TkA01G015560|TK1151|CDS

ATGAAGAAGAAAAGTTTCAGAAATAAAATTAAGTCGATTGTTGGAAGTCATATTGATCCAGACAAAGATGAGGAACTTAAAGGCAGTAATATAGAAATGGAAGATAATTACAAGAAGATTCTAGAGCTTCTCAAAGAGGAAGACAAGAATGACAAAGACAAACTTCTTGAATTAATTGAAGATTTCCACAAACATCATCAATCTGTTTACACCCGTTATGATCACATCACAGGAGAGCTAAGAGCAAAAGTGCATTCAAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1552 aa · TkA01G015560|TK1151|PROTEIN

MKKKSFRNKIKSIVGSHIDPDKDEELKGSNIEMEDNYKKILELLKEEDKNDKDKLLELIEDFHKHHQSVYTRYDHITGELRAKVHSKKDNDSSSSSSSSESDLDGTISKKGSKNGKLKVADILKEQLQSANTEIEQLTKKLTLAAKEKQELSSQCQETEKKYEESSNLVAELSQKLEATESEKTSLSVKGSELATELQELVTKCGQLQEKLAEKEKELLNHLDMHTSHKSETEVKMRGFEEELGSLISKKSEMEKQKEEE...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G015560
TK1151 IDTkA01G015560
OH-1004 IDLXL04_005784
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)92.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G015560
位置Chr01:3976355-3982958 (-)
描述Similar to CIP1: COP1-interactive protein 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g41790 脱落酸（ABA）介导信号通路的正调控因子，参与非生物胁迫反应（如渗透胁迫），并导致植物各种适应性变化（如气孔关闭）。
Arabidopsis COP1-interacting protein 1 is a positive regulator of ABA response.2016 · DOI: 10.1016/j.bbrc.2016.06.147

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_005784 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006970 response to osmotic stress 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009789 positive regulation of abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0042306 regulation of protein import into nucleus 生物过程
GO:0071215 cellular response to abscisic acid stimulus 生物过程
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005856 cytoskeleton 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G41790
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.672
排名 1 · TkA01G015560 · TK1151
高尔基体0.169
排名 2 · TkA01G015560 · TK1151
细胞核0.160
排名 3 · TkA01G015560 · TK1151
细胞膜0.100
排名 4 · TkA01G015560 · TK1151
内质网0.065
排名 5 · TkA01G015560 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07765KIP115-74 aa
PF10473CENP-F_leu_zip36-65 aa
PF05859Mis1239-110 aa
PF30917CCDC57_N41-345 aa
PF10473CENP-F_leu_zip118-207 aa
PF07926TPR_MLP1_2121-228 aa
PF05859Mis12124-233 aa
PF07765KIP1125-172 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA01G015560PF07765KIP115741.7e-0628.8
TkA01G015560PF10473CENP-F_leu_zip36657.2e-0523.6
TkA01G015560PF05859Mis12391100.002618.3
TkA01G015560PF30917CCDC57_N413457.5e-0522.5
TkA01G015560PF10473CENP-F_leu_zip1182077.2e-0523.6
TkA01G015560PF07926TPR_MLP1_21212280.005417.5
TkA01G015560PF05859Mis121242330.002618.3
TkA01G015560PF07765KIP11251721.7e-0628.8
TkA01G015560PF10473CENP-F_leu_zip1722597.2e-0523.6
TkA01G015560PF07765KIP12472641.7e-0628.8
TkA01G015560PF07765KIP12492671.7e-0628.8
TkA01G015560PF05859Mis122503410.002618.3
TkA01G015560PF07926TPR_MLP1_22523250.005417.5
TkA01G015560PF10473CENP-F_leu_zip2583827.2e-0523.6
TkA01G015560PF07765KIP12743081.7e-0628.8
TkA01G015560PF30917CCDC57_N3275097.5e-0522.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
F4JZY1拟南芥sp|F4JZY1|CIP1_ARATH COP1-interactive protein 136.800%Swiss-Prot低置信

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