TkA01G007110 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA01G007110

当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 1840820-1844264 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1603 bp · TkA01G007110|TK1151|cDNA

CTGGATCCAACGTGTAAATATGTTATTGGATCCTACAACCCCGATGACGACGATGAAGGAAAGTAGAGATCGGGATTCCTTTTACAAATCGCAACCGTCAACTTGAAGACGGCGAAAGGAAGGGCAGAGAGCATCAGCCATGGCAGCTCGCAAGAGAGGAGCTTCAAAACAACCACCGCCACCCACCGAATCACATCCTAAATCCTCGGAACCCGTCGCTACTTCTACAGACCCACAGATCACTCCTTCAAAGCCAAGCA...

CDS

下载 CDS FASTA

1266 bp · TkA01G007110|TK1151|CDS

ATGGCAGCTCGCAAGAGAGGAGCTTCAAAACAACCACCGCCACCCACCGAATCACATCCTAAATCCTCGGAACCCGTCGCTACTTCTACAGACCCACAGATCACTCCTTCAAAGCCAAGCAAAATCCTCTTATTCTCTTTGATTTTCTTTCTCCCCTACCTTTACCTGATATTTTATCACTATACAATCGAAACAGAGCTCAAAAAATCGATCCTTATCAATGCATCACTCAGCTTCGCCGGATTCTTTATAACCCTAAT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

421 aa · TkA01G007110|TK1151|PROTEIN

MAARKRGASKQPPPPTESHPKSSEPVATSTDPQITPSKPSKILLFSLIFFLPYLYLIFYHYTIETELKKSILINASLSFAGFFITLMMIPVASRYVLKRNLFGYDINKKGTPQGLVKVPESLGIVVGIVFLVVAILFQYFNFTADSIWLVEYNAALASVCFMILLGFVDDVLDIPWRVKLLLPSIAALPLLMAYAGHTTIMIPKPLVQYIGTEILDLGWIYKLYMGLLAVFCTNSINIHAGINGLEVGQTVVIAFAILIH...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA01G007110`
TK1151 ID	TkA01G007110
OH-1004 ID	LXL04_005922
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	99.500
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID	`TkA01G007110`
位置	Chr01:1840820-1844264 (+)
描述	Similar to alg7: UDP-N-acetylglucosamine--dolichyl-phosphate N-acetylglucosaminephosphotransferase
拟南芥 / 水稻参考基因与文献	下载当前基因文献拟南芥当前来源表未检出该物种的同源命中。水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。
功能注释来源	查看注释来源功能注释来源：OH1004 · `LXL04_005922` · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
GO 注释（OH1004 来源）	GO:0006487 protein N-linked glycosylation 生物过程 GO:0006488 dolichol-linked oligosaccharide biosynthetic process 生物过程 GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分 GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分 GO:0016020 membrane 细胞组分 GO:0043231 intracellular membrane-bounded organelle 细胞组分 GO:0003975 UDP-N-acetylglucosamine-dolichyl-phosphate N-acetylglucosaminephosphotransferase activity 分子功能 GO:0003976 UDP-N-acetylglucosamine-lysosomal-enzyme N-acetylglucosaminephosphotransferase activity 分子功能 GO:0016757 glycosyltransferase activity 分子功能 GO:0042802 identical protein binding 分子功能 GO:0046872 metal ion binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用	bta:537812 cge:100689054 hsa:1798 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.463

排名 1 · TkA01G007110 · TK1151

高尔基体0.338

排名 2 · TkA01G007110 · TK1151

溶酶体／液泡0.095

排名 3 · TkA01G007110 · TK1151

细胞质0.079

排名 4 · TkA01G007110 · TK1151

细胞核0.061

排名 5 · TkA01G007110 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08690GET29-100 aa

PF31053DUF879220-86 aa

PF06324Pigment_DH72-78 aa

PF00953Glycos_transf_4105-143 aa

PF05767Pox_A14124-163 aa

PF00953Glycos_transf_4155-325 aa

PF31053DUF8792241-327 aa

PF06324Pigment_DH339-347 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA01G007110	`PF08690`	GET2	9	100	0.11	12.9
TkA01G007110	`PF31053`	DUF8792	20	86	6.0	7.6
TkA01G007110	`PF06324`	Pigment_DH	72	78	1.2	10.1
TkA01G007110	`PF00953`	Glycos_transf_4	105	143	3.6e-29	102.5
TkA01G007110	`PF05767`	Pox_A14	124	163	0.52	11.2
TkA01G007110	`PF00953`	Glycos_transf_4	155	325	3.6e-29	102.5
TkA01G007110	`PF31053`	DUF8792	241	327	6.0	7.6
TkA01G007110	`PF06324`	Pigment_DH	339	347	1.2	10.1
TkA01G007110	`PF05767`	Pox_A14	394	401	0.52	11.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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