本页使用教程

基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkA01G000730
当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 170113-170472 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

360 bp · TkA01G000730|TK1151|cDNA

ATGGAACCCGTCTTCTTCCGTTCCAGTCTTCCAGCATCTCCATTTTCCGGCCTCCCTCTTCGTTCCAGTCTTCCAGCGATTTTCCGTCGACAACCCAGCGACCCCGACAACAACACAGCGATCCCGACAACAACCCCTTGCGCCATTGCTATCTCCTTCTCTCTGTCGTCTCTCACGCTGTGGTTTTGCATCTCGAAACTCTGTGCACCGGCGAATTCGGCTTTCTCCACCGGCGAACTTCAAGGTACTCATCTCTTTTT...

360 bp · TkA01G000730|TK1151|CDS

ATGGAACCCGTCTTCTTCCGTTCCAGTCTTCCAGCATCTCCATTTTCCGGCCTCCCTCTTCGTTCCAGTCTTCCAGCGATTTTCCGTCGACAACCCAGCGACCCCGACAACAACACAGCGATCCCGACAACAACCCCTTGCGCCATTGCTATCTCCTTCTCTCTGTCGTCTCTCACGCTGTGGTTTTGCATCTCGAAACTCTGTGCACCGGCGAATTCGGCTTTCTCCACCGGCGAACTTCAAGGTACTCATCTCTTTTT...

119 aa · TkA01G000730|TK1151|PROTEIN

MEPVFFRSSLPASPFSGLPLRSSLPAIFRRQPSDPDNNTAIPTTTPCAIAISFSLSSLTLWFCISKLCAPANSAFSTGELQGTHLFLLSLFLRSILSTRVLTKFVIDPTINFRPNCCLD

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA01G000730
TK1151 IDTkA01G000730
OH-1004 IDLXL04_008354
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)83.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA01G000730
位置Chr01:170113-170472 (+)
描述Protein of unknown function
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

当前来源表未检出该物种的同源命中。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_008354 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)暂无功能描述
KEGG 基因交叉引用暂无功能描述

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

细胞核0.429
排名 1 · TkA01G000730 · TK1151
细胞质0.333
排名 2 · TkA01G000730 · TK1151
细胞膜0.130
排名 3 · TkA01G000730 · TK1151
内质网0.108
排名 4 · TkA01G000730 · TK1151
线粒体0.085
排名 5 · TkA01G000730 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

没有找到该查询的结果。

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

JBrowse

在基因组浏览器中查看