TkA01G000700 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA01G000700

当前版本: TK1151 染色体: Chr01 坐标: 160848-162131 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1242 bp · TkA01G000700|TK1151|cDNA

ATGCCGGAGATCGTCAATAATGCGCCGCCGTTGGCCGCCAACTCTCTGTTCGGAAAGTATGAGATCGGAAGACTTCTTGGCTGCGGCGCTTTCGCCAAGGTTTACCTCGCCAGAGACATCGTCACCGGCCAGAGCCTCGCCGTCAAGGTAATCAATAAACAAAAAATCACTCATAACACCAGTCTCATGTCTAATATCGAGCGCGAGATCGATATCATGCGCCGACTCCGCCATCCCAACATCGTGAAATTGTACGAAGT...

CDS

下载 CDS FASTA

1242 bp · TkA01G000700|TK1151|CDS

ATGCCGGAGATCGTCAATAATGCGCCGCCGTTGGCCGCCAACTCTCTGTTCGGAAAGTATGAGATCGGAAGACTTCTTGGCTGCGGCGCTTTCGCCAAGGTTTACCTCGCCAGAGACATCGTCACCGGCCAGAGCCTCGCCGTCAAGGTAATCAATAAACAAAAAATCACTCATAACACCAGTCTCATGTCTAATATCGAGCGCGAGATCGATATCATGCGCCGACTCCGCCATCCCAACATCGTGAAATTGTACGAAGT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

413 aa · TkA01G000700|TK1151|PROTEIN

MPEIVNNAPPLAANSLFGKYEIGRLLGCGAFAKVYLARDIVTGQSLAVKVINKQKITHNTSLMSNIEREIDIMRRLRHPNIVKLYEVLATKTKIYFVMELVKGGELFAKVAKTRLSESQSRKYFQQLISAIGYCHSRDENGNLKVSDFGLSAVTGQIRDDGMLHTLCGTPAYVAPEILTKRGYNGAKADVWSCGVILFVLTAGYLPFNDPNLMMLYKKIYKGEYHFAKWMSADLRRLLARLMDTNPVNRITIDDITRHPW...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA01G000700`
TK1151 ID	TkA01G000700
OH-1004 ID	LXL04_036634
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)	96.500
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA01G000700

位置 Chr01:160848-162131 (-)

描述 Similar to CIPK11: CBL-interacting serine/threonine-protein kinase 11

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At2g30360`	CIPK 丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶与 CBL 蛋白相互作用。	Arabidopsis protein kinase PKS5 inhibits the plasma membrane H+ -ATPase by preventing interaction with 14-3-3 protein.2007 · DOI: 10.1105/tpc.105.035626
`At5g01820`	CIPK 丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶与 CBL 蛋白相互作用。	暂无已核实直接文献
`At1g29230`	CIPK 丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶与 CBL 蛋白相互作用。	暂无已核实直接文献
`At4g18700`	CIPK 丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶与 CBL 蛋白相互作用。	暂无已核实直接文献
`At5g45810`	CIPK 丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶与 CBL 蛋白相互作用。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_036634 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程

GO:0007165 signal transduction 生物过程

GO:0009268 response to pH 生物过程

GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程

GO:0019722 calcium-mediated signaling 生物过程

GO:0048768 root hair cell tip growth 生物过程

GO:0051592 response to calcium ion 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0004672 protein kinase activity 分子功能

GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G29230

ath:AT2G30360

ath:AT4G18700

ath:AT5G45810

dosa:Os01g0206700

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.543

排名 1 · TkA01G000700 · TK1151

细胞核0.436

排名 2 · TkA01G000700 · TK1151

细胞膜0.145

排名 3 · TkA01G000700 · TK1151

内质网0.048

排名 4 · TkA01G000700 · TK1151

溶酶体／液泡0.048

排名 5 · TkA01G000700 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase20-261 aa

PF07714PK_Tyr_Ser-Thr22-257 aa

PF14531Kinase-like23-78 aa

PF13040Fur_reg_FbpB52-71 aa

PF13040Fur_reg_FbpB121-129 aa

PF14531Kinase-like186-245 aa

PF03822NAF286-346 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA01G000700	`PF00069`	Pkinase	20	261	8e-58	196.6
TkA01G000700	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	22	257	7.8e-28	98.2
TkA01G000700	`PF14531`	Kinase-like	23	78	0.097	12.6
TkA01G000700	`PF13040`	Fur_reg_FbpB	52	71	0.33	11.3
TkA01G000700	`PF13040`	Fur_reg_FbpB	121	129	0.33	11.3
TkA01G000700	`PF14531`	Kinase-like	186	245	0.097	12.6
TkA01G000700	`PF03822`	NAF	286	346	9.7e-15	55.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`O22932`	拟南芥	sp\|O22932\|CIPKB_ARATH CBL-interacting serine/threonine-protein kinase 11	57.800%	Swiss-Prot	高置信
`Q9LZW4`	拟南芥	sp\|Q9LZW4\|CIPKE_ARATH CBL-interacting serine/threonine-protein kinase 14	51.100%	Swiss-Prot	高置信
`Q9LP51`	拟南芥	sp\|Q9LP51\|CIPKI_ARATH CBL-interacting serine/threonine-protein kinase 18	49.200%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9SN43`	拟南芥	sp\|Q9SN43\|CIPKC_ARATH CBL-interacting serine/threonine-protein kinase 12	47.800%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9FJ55`	拟南芥	sp\|Q9FJ55\|CIPKJ_ARATH CBL-interacting serine/threonine-protein kinase 19	47.500%	Swiss-Prot	中等置信

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