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基因概览

LXL04_038815

当前版本: OH-1004 染色体: Chr09 坐标: 51046238-51046603 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

366 bp · LXL04_038815|LXL04_038815|OH1004|cDNA

ATGAATGATGATGGTGACATGGCGGAAATGTACCTAACCGAAAAGAAACAAAAGGATTCATGCACCGATTTATACGATCAAGTTCAAGGTGGTGGGACCGCCACCAGTAGCATTGCAACTTCAATAACGGGGCCCGTATTGGGAGTCATGTCAAAATCCGCCCCGGTTTCTCCCGTGGGGTCCGCAAGCGGGTCGCAGAGATTGCAAAGGGCGTTTAGTAATATAAGTACACATAAACACGGAAGCTTGTTGAGTTCATC...

CDS

下载 CDS FASTA

366 bp · LXL04_038815|LXL04_038815|OH1004|CDS

ATGAATGATGATGGTGACATGGCGGAAATGTACCTAACCGAAAAGAAACAAAAGGATTCATGCACCGATTTATACGATCAAGTTCAAGGTGGTGGGACCGCCACCAGTAGCATTGCAACTTCAATAACGGGGCCCGTATTGGGAGTCATGTCAAAATCCGCCCCGGTTTCTCCCGTGGGGTCCGCAAGCGGGTCGCAGAGATTGCAAAGGGCGTTTAGTAATATAAGTACACATAAACACGGAAGCTTGTTGAGTTCATC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

121 aa · LXL04_038815|LXL04_038815|OH1004|PROTEIN

MNDDGDMAEMYLTEKKQKDSCTDLYDQVQGGGTATSSIATSITGPVLGVMSKSAPVSPVGSASGSQRLQRAFSNISTHKHGSLLSSSVTGETENIDQLEMLLEAYFVGIDNTLNKLLSVRQ

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_038815`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_038815

位置 Chr09:51046238-51046603 (+)

描述 Similar to MRS2-B: Magnesium transporter MRS2-B

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g80900`	高亲和力镁转运蛋白，介导镁的流入。	A novel family of magnesium transport genes in Arabidopsis.2001 · DOI: 10.1105/tpc.010352 Overexpression of an Arabidopsis magnesium transport gene, AtMGT1, in Nicotiana benthamiana confers Al tolerance.2006 · DOI: 10.1093/jxb/erl201
`At1g16010`	镁转运蛋白，可能介导镁离子的流入。	暂无已核实直接文献
`At2g03620`	镁转运蛋白，可能介导镁离子的流入。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os06g0650800`	镁转运蛋白，可能介导镁离子的流入。	暂无已核实直接文献
`UniProt: A2YFN7`	镁转运蛋白，可能介导镁离子的流入。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_038815 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0015693 magnesium ion transport 生物过程

GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0016020 membrane 细胞组分

GO:0015095 magnesium ion transmembrane transporter activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G16010

ath:AT1G80900

ath:AT2G03620

dosa:Os06g0650800

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.509

排名 1 · LXL04_038815 · OH-1004

细胞核0.336

排名 2 · LXL04_038815 · OH-1004

细胞膜0.140

排名 3 · LXL04_038815 · OH-1004

线粒体0.088

排名 4 · LXL04_038815 · OH-1004

溶酶体／液泡0.069

排名 5 · LXL04_038815 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

没有找到该查询的结果。

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9SAH0`	拟南芥	Magnesium transporter MRS2-10	47.934%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`Q9S9N4`	拟南芥	Magnesium transporter MRS2-1	47.107%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`Q9ZPR4`	拟南芥	Magnesium transporter MRS2-5	55.085%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`Q67UQ7`	水稻	Magnesium transporter MRS2-B	47.934%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`A2YFN7`	水稻	Magnesium transporter MRS2-B	47.934%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据

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