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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_038740
当前版本: OH-1004 染色体: Chr09 坐标: 49270429-49274737 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2169 bp · LXL04_038740|LXL04_038740|OH1004|cDNA

ATGCTTCACCAGACAGACCACGATAGAACGCCAGGCATTCGGTCACAATCATCGTCCCCATCATATTTGATAAACGAACACGTGTATGACCACCGGAGCAAACCGATCAGCTGTGGTGGCGAAATGGACGATGAAACTAACCCGATTTCGTTCACAACTGAATGTTACGCATGCACTCAAGTGGGTGTTCCGGTGTTCCACTCCACGAGCTGCGACCAAGCTCAGCAACCGGAATGGGAAGCCTCCGCCGGGTCTTCCCT...

CDS

下载 CDS FASTA

2169 bp · LXL04_038740|LXL04_038740|OH1004|CDS

ATGCTTCACCAGACAGACCACGATAGAACGCCAGGCATTCGGTCACAATCATCGTCCCCATCATATTTGATAAACGAACACGTGTATGACCACCGGAGCAAACCGATCAGCTGTGGTGGCGAAATGGACGATGAAACTAACCCGATTTCGTTCACAACTGAATGTTACGCATGCACTCAAGTGGGTGTTCCGGTGTTCCACTCCACGAGCTGCGACCAAGCTCAGCAACCGGAATGGGAAGCCTCCGCCGGGTCTTCCCT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

722 aa · LXL04_038740|LXL04_038740|OH1004|PROTEIN

MLHQTDHDRTPGIRSQSSSPSYLINEHVYDHRSKPISCGGEMDDETNPISFTTECYACTQVGVPVFHSTSCDQAQQPEWEASAGSSLIPIRNRAGSKIIKNRASAGKRGSPSSGVFRRVYDPRSKGVQRWNRFVLLARGMALAVDPLFFYVLSIGRGGTPCLYMDGGLVVVVVAMRTVIDCFHVVHIWLQFRVAYVSRESLVVGCGKLVWDPNSIAYRYVRSLKGFWYDAFVILPIPQIVFLLLLPRLIREDRIKEIMTM...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_038740
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_038740
位置Chr09:49270429-49274737 (-)
描述Similar to CNGC2: Cyclic nucleotide-gated ion channel 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g15410 充当环核苷酸门控离子通道。
The Arabidopsis dnd1 "defense, no death" gene encodes a mutated cyclic nucleotide-gated ion channel.2000 · DOI: 10.1073/pnas.150005697
Developmentally regulated expression of a cyclic nucleotide-gated ion channel from Arabidopsis indicates its involvement in programmed cell death.2001 · DOI: 10.1007/s004250000510
At5g54250 充当环核苷酸门控离子通道。
HLM1, an essential signaling component in the hypersensitive response, is a member of the cyclic nucleotide-gated channel ion channel family.2003 · DOI: 10.1105/tpc.006999
At1g15990 推定环核苷酸门控离子通道。 暂无已核实直接文献
At1g19780 推定环核苷酸门控离子通道。 暂无已核实直接文献
At4g30560 推定环核苷酸门控离子通道。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_038740 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0007263 nitric oxide mediated signal transduction 生物过程
GO:0009626 plant-type hypersensitive response 生物过程
GO:0009860 pollen tube growth 生物过程
GO:0070509 calcium ion import 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0090406 pollen tube 细胞组分
GO:0005216 monoatomic ion channel activity 分子功能
GO:0005221 intracellularly cyclic nucleotide-activated monoatomic cation channel activity 分子功能
GO:0005222 intracellularly cAMP-activated cation channel activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G15990
ath:AT1G19780
ath:AT4G30560
ath:AT5G15410
ath:AT5G54250
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.886
排名 1 · LXL04_038740 · OH-1004
细胞质0.075
排名 2 · LXL04_038740 · OH-1004
内质网0.062
排名 3 · LXL04_038740 · OH-1004
细胞核0.034
排名 4 · LXL04_038740 · OH-1004
溶酶体／液泡0.028
排名 5 · LXL04_038740 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00027.36cNMP_binding554-639 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_038740PF00027.36cNMP_binding5546395.6e-0730.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O65718拟南芥Cyclic nucleotide-gated ion channel 268.895%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q94AS9拟南芥Cyclic nucleotide-gated ion channel 447.544%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9S9N5拟南芥Putative cyclic nucleotide-gated ion channel 737.153%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9FXH6拟南芥Putative cyclic nucleotide-gated ion channel 836.979%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9M0A4拟南芥Putative cyclic nucleotide-gated ion channel 936.332%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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