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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_038661
当前版本: OH-1004 染色体: Chr09 坐标: 47714760-47718356 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2114 bp · LXL04_038661|LXL04_038661|OH1004|cDNA

ATGAAGGCGATAAAAAGAATCCAACCACAATGAGTGGGAGGGTTGCTGCGGATCTTGAGATGAAGGATTCAGATGATTGGAGTTTACCTTCTTTACGCCACCAAAACGATGAACTACCCTATGTTCATAAAGTGGGCAAACCTCCAAAACAAGATTTGTTGAAAGAGATCAAAACCGCACTTAAAGAAACTTTTCTTTCCGATGATCCATTGAAGCCTTTTAAGGACCAACCAAGTAAAAGAAAACTCGTTCTTGGATTT...

CDS

下载 CDS FASTA

2085 bp · LXL04_038661|LXL04_038661|OH1004|CDS

ATGAGTGGGAGGGTTGCTGCGGATCTTGAGATGAAGGATTCAGATGATTGGAGTTTACCTTCTTTACGCCACCAAAACGATGAACTACCCTATGTTCATAAAGTGGGCAAACCTCCAAAACAAGATTTGTTGAAAGAGATCAAAACCGCACTTAAAGAAACTTTTCTTTCCGATGATCCATTGAAGCCTTTTAAGGACCAACCAAGTAAAAGAAAACTCGTTCTTGGATTTCAAACCTTGTTTCCAATTCTTCAATGGAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

694 aa · LXL04_038661|LXL04_038661|OH1004|PROTEIN

MSGRVAADLEMKDSDDWSLPSLRHQNDELPYVHKVGKPPKQDLLKEIKTALKETFLSDDPLKPFKDQPSKRKLVLGFQTLFPILQWSRDYSFSKFKGDFIAGCTIASLCIPQDIGYAKLANLDPQYGLYSSFVPPLIYAFMGSSRDIAIGPVAVVSLLLGSMLQDELDPITQKHEYQRLAFTATFFAGVTQATLGFFRLGFLIDFLSHAAIVGFMGGAAVTIALQQLKGLFGIKKFTKKTDVVSVMRSVIQAAHHGWNWQ...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_038661
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_038661
位置Chr09:47714760-47718356 (-)
描述Similar to ST2: High affinity sulfate transporter 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g22150 可能作为高亲和力 H⁺/硫酸盐同向转运蛋白，介导硫酸盐向筛管的装载。
Phloem-localizing sulfate transporter, Sultr1;3, mediates re-distribution of sulfur from source to sink organs in Arabidopsis.2003 · DOI: 10.1104/pp.014712
At1g78000 可能作为高亲和力 H⁺/硫酸盐同向转运蛋白，介导植物根部对环境硫酸盐的吸收。
Two distinct high-affinity sulfate transporters with different inducibilities mediate uptake of sulfate in Arabidopsis roots.2002 · DOI: 10.1046/j.0960-7412.2001.01231.x
Selenate-resistant mutants of Arabidopsis thaliana identify Sultr1;2, a sulfate transporter required for efficient transport of sulfate into roots.2002 · DOI: 10.1046/j.0960-7412.2001.01232.x
At4g08620 可能作为高亲和力 H⁺/硫酸盐同向转运蛋白，介导低硫条件下根部对硫酸盐的吸收。
The roles of three functional sulphate transporters involved in uptake and translocation of sulphate in Arabidopsis thaliana.2000 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2000.00768.x
Two distinct high-affinity sulfate transporters with different inducibilities mediate uptake of sulfate in Arabidopsis roots.2002 · DOI: 10.1046/j.0960-7412.2001.01231.x

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_038661 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009970 cellular response to sulfate starvation 生物过程
GO:0055085 transmembrane transport 生物过程
GO:1902358 sulfate transmembrane transport 生物过程
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0008271 secondary active sulfate transmembrane transporter activity 分子功能
GO:0015116 sulfate transmembrane transporter activity 分子功能
GO:0015293 symporter activity 分子功能
GO:0022857 transmembrane transporter activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G22150
ath:AT1G78000
ath:AT4G08620
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.780
排名 1 · LXL04_038661 · OH-1004
细胞质0.145
排名 2 · LXL04_038661 · OH-1004
内质网0.064
排名 3 · LXL04_038661 · OH-1004
溶酶体／液泡0.063
排名 4 · LXL04_038661 · OH-1004
线粒体0.049
排名 5 · LXL04_038661 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00916.27Sulfate_transp95-476 aa
PF01740.27STAS529-683 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_038661PF00916.27Sulfate_transp954766.6e-140466.9
LXL04_038661PF01740.27STAS5296837.8e-2484.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FEP7拟南芥Sulfate transporter 1.369.585%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9MAX3拟南芥Sulfate transporter 1.269.369%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9SAY1拟南芥Sulfate transporter 1.165.460%Swiss-Prot强数据库同源证据

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