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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_037607
当前版本: OH-1004 染色体: Chr09 坐标: 15751400-15752990 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1119 bp · LXL04_037607|LXL04_037607|OH1004|cDNA

ATGGAGGGCGTTGATGCGAATGATAAGTACGCTAAAGAGTTAGAAATCGGTGTTAGAGTTGTACAGCTCGCTTGTTGTCTATGCCAGAAGGTGCAAAAGGGCTCGATTGGTCCGACGCCTGATCAGATCTTCTCCAAAGATGACGATTCACCTGTTACTGTCGCCGATTGGAGTGTACAAGCGATGATAAGCTGGATTCTATCAGAATCATTCGGTAAACAAAACGTCTCGATTGTAGCTGAAGAAGACACACAAACTTT...

CDS

下载 CDS FASTA

1119 bp · LXL04_037607|LXL04_037607|OH1004|CDS

ATGGAGGGCGTTGATGCGAATGATAAGTACGCTAAAGAGTTAGAAATCGGTGTTAGAGTTGTACAGCTCGCTTGTTGTCTATGCCAGAAGGTGCAAAAGGGCTCGATTGGTCCGACGCCTGATCAGATCTTCTCCAAAGATGACGATTCACCTGTTACTGTCGCCGATTGGAGTGTACAAGCGATGATAAGCTGGATTCTATCAGAATCATTCGGTAAACAAAACGTCTCGATTGTAGCTGAAGAAGACACACAAACTTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

372 aa · LXL04_037607|LXL04_037607|OH1004|PROTEIN

MEGVDANDKYAKELEIGVRVVQLACCLCQKVQKGSIGPTPDQIFSKDDDSPVTVADWSVQAMISWILSESFGKQNVSIVAEEDTQTLSDSNSTRLLSSVVSTVNESLSIAPKFGLKAPTSPLEPTQVLDAINNCNSTGGPTGKHWVLDPVDGTLGFVRGDQYAVALALIENGQVVVGVLGCPNYSSKKKLVNNSSVSKEGCVMYARKGSGEAWMQPLVCEGGGPALVWPNSGSRIRVSCIDDPSMATFCEPVEKANSNHS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_037607
TK1151 IDTkA04G328880
OH-1004 IDLXL04_037607
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_037607
位置Chr09:15751400-15752990 (+)
描述Similar to AHL: PAP-specific phosphatase HAL2-like
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g54390 磷酸酶，可将腺苷3'-磷酸5'-磷酸硫酸酯（PAPS）转化为腺苷5'-磷酸硫酸酯（APS）以及将3'-磷酸腺苷5'-磷酸（3'-PAP）转化为AMP。 暂无已核实直接文献
At5g63980 磷酸酶，可将腺苷 3'-磷酸 5'- 磷酸硫酸 转化为腺苷 5'-磷酸硫酸 ，并将 3'- 磷酸腺苷 5'-磷酸 转化为 AMP。
FIERY1 encoding an inositol polyphosphate 1-phosphatase is a negative regulator of abscisic acid and stress signaling in Arabidopsis.2001 · DOI: 10.1101/gad.891901
Arabidopsis FIERY1, XRN2, and XRN3 are endogenous RNA silencing suppressors.2007 · DOI: 10.1105/tpc.107.055319
The SAL1 gene of Arabidopsis, encoding an enzyme with 3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase and inositol polyphosphate 1-phosphatase activities, increases salt tolerance in yeast.1996 · DOI: 10.1105/tpc.8.3.529
At5g09290 磷酸酶，将腺苷三磷酸 3'-磷酸 5'-磷硫酸盐（PAPS）转化为腺苷 5'-磷硫酸盐（APS），并将 3'(2')-磷酸腺苷 5'-磷酸盐（PAP）转化为 AMP。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os12g0183300 磷酸酶，将腺苷三磷酸 3'-磷酸 5'-磷硫酸盐（PAPS）转化为腺苷 5'-磷硫酸盐（APS），并将 3'(2')-磷酸腺苷 5'-磷酸盐（PAP）转化为 AMP。 暂无已核实直接文献
UniProt: P0C5A3 磷酸酶，将腺苷三磷酸 3'-磷酸 5'-磷硫酸盐（PAPS）转化为腺苷 5'-磷硫酸盐（APS），并将 3'(2')-磷酸腺苷 5'-磷酸盐（PAP）转化为 AMP。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_037607 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000103 sulfate assimilation 生物过程
GO:0006401 RNA catabolic process 生物过程
GO:0009409 response to cold 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009416 response to light stimulus 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009968 negative regulation of signal transduction 生物过程
GO:0010587 miRNA catabolic process 生物过程
GO:0042752 regulation of circadian rhythm 生物过程
GO:0045892 negative regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0046854 phosphatidylinositol phosphate biosynthetic process 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G09290
ath:AT5G54390
ath:AT5G63980
dosa:Os12g0183300
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.721
排名 1 · LXL04_037607 · OH-1004
细胞核0.397
排名 2 · LXL04_037607 · OH-1004
过氧化物酶体0.080
排名 3 · LXL04_037607 · OH-1004
溶酶体／液泡0.049
排名 4 · LXL04_037607 · OH-1004
线粒体0.048
排名 5 · LXL04_037607 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00459.31Inositol_P49-342 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_037607PF00459.31Inositol_P493422.4e-43149.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q38945拟南芥3',5'-bisphosphate nucleotidase AHL65.172%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q42546拟南芥3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase 144.928%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q84VY5拟南芥Probable 3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase 442.700%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q2QWT4水稻3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase43.713%Swiss-Prot中等数据库同源证据
P0C5A3水稻3'(2'),5'-bisphosphate nucleotidase43.713%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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