基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_037266
当前版本: OH-1004
染色体: Chr09
坐标: 4718427-4721974
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1062 bp · LXL04_037266|LXL04_037266|OH1004|cDNA
ATGATCTTGAGGGGTTTTACCTCAGAGGTCTCAGAAGAATTAACAGCAGTAAAAAGACGAAAAAGGCCTTGTCTCGAATCTATCCGTTTGGGGTGGTGTCACGTGATCTGCCTCACCGGTCTCGCCGGGACTACGGATATGTACCCTATCACCATCACCTCCATCAACCATCCTCGTGTCATCTCTCCCATCATTGCATTTAAAGGTAAAATCTTTTCGTCGTTTTTCTCCAATCTCTTCATCCTCCGATTTGAGTTTCT...
CDS
下载 CDS FASTA1062 bp · LXL04_037266|LXL04_037266|OH1004|CDS
ATGATCTTGAGGGGTTTTACCTCAGAGGTCTCAGAAGAATTAACAGCAGTAAAAAGACGAAAAAGGCCTTGTCTCGAATCTATCCGTTTGGGGTGGTGTCACGTGATCTGCCTCACCGGTCTCGCCGGGACTACGGATATGTACCCTATCACCATCACCTCCATCAACCATCCTCGTGTCATCTCTCCCATCATTGCATTTAAAGGTAAAATCTTTTCGTCGTTTTTCTCCAATCTCTTCATCCTCCGATTTGAGTTTCT...
353 aa · LXL04_037266|LXL04_037266|OH1004|PROTEIN
MILRGFTSEVSEELTAVKRRKRPCLESIRLGWCHVICLTGLAGTTDMYPITITSINHPRVISPIIAFKGKIFSSFFSNLFILRFEFLFKSFTNQQVSRFRTCKSPLEHNQHNLNLPEEISGCRSSKLSDIYFSSCRKWSKVTIMEHFDVRQVPCLTLEDPEILARETVFSVSEIEALYELFKKISSAVIDDGLINKEEFQLALFKTNKKESLFADRVFDLFDTKHNGILGFEEFARALSVFHPNAPIDDKIEFSFQLYDL...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_037266 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_037266 | |||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr09:4718427-4721974 (-) | |||||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to CBL3: Calcineurin B-like protein 3 | |||||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻
| |||||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | |||||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0005513 detection of calcium ion 生物过程 GO:0019722 calcium-mediated signaling 生物过程 GO:0055075 potassium ion homeostasis 生物过程 GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分 GO:0005773 vacuole 细胞组分 GO:0005829 cytosol 细胞组分 GO:0005886 plasma membrane 细胞组分 GO:0009536 plastid 细胞组分 GO:0009705 plant-type vacuole membrane 细胞组分 GO:0016020 membrane 细胞组分 GO:0022626 cytosolic ribosome 细胞组分 GO:0032578 aleurone grain membrane 细胞组分 | |||||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT4G26570 ath:AT5G55990 dosa:Os03g0626800 dosa:Os12g0162400 dosa:Os12g0597000 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞质0.435
细胞核0.264
细胞膜0.189
线粒体0.120
内质网0.120
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF13499.13EF-hand_7190-238 aaPF00036.39EF-hand_1215-239 aaPF13499.13EF-hand_7249-314 aaPF00036.39EF-hand_1295-319 aaPF13202.13EF-hand_5295-319 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_037266 | PF13499.13 | EF-hand_7 | 190 | 238 | 1.5e-16 | 61.2 |
| LXL04_037266 | PF00036.39 | EF-hand_1 | 215 | 239 | 2.3e-17 | 61.9 |
| LXL04_037266 | PF13499.13 | EF-hand_7 | 249 | 314 | 1.5e-16 | 61.2 |
| LXL04_037266 | PF00036.39 | EF-hand_1 | 295 | 319 | 2.3e-17 | 61.9 |
| LXL04_037266 | PF13202.13 | EF-hand_5 | 295 | 319 | 2.4e-15 | 55.9 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q8LEM7 | 拟南芥 | Calcineurin B-like protein 3 | 95.431% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q8LAS7 | 拟南芥 | Calcineurin B-like protein 2 | 95.939% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q75LU8 | 水稻 | Calcineurin B-like protein 3 | 95.939% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q3HRP5 | 水稻 | Calcineurin B-like protein 2 | 91.878% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q3HRP1 | 水稻 | Calcineurin B-like protein 6 | 89.340% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |