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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_037018
当前版本: OH-1004 染色体: Chr08 坐标: 51775754-51780181 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2646 bp · LXL04_037018|LXL04_037018|OH1004|cDNA

ATGGGTTCAAAGCCTTGGCTACAACCCGCTCCAACCTACCACCCATTGGAGACGTATTGGGACACTGAAGAAGATGCTCCTGGACCTAGATGTGCTCACACTCTTACTGCCGTCGCCCAAACCAAAGCTCATGGCCCTCGGCTGATCTTATTCGGTGGCGCCACCGCCATCGAAGGCGGCGCTTCCTCTCCCGTCCCCGGCATCCGGTTAGCTGGCGTGACAAATTCAGTTCATTCTTACGATGTGCTGACCAGGAAATG...

CDS

下载 CDS FASTA

2646 bp · LXL04_037018|LXL04_037018|OH1004|CDS

ATGGGTTCAAAGCCTTGGCTACAACCCGCTCCAACCTACCACCCATTGGAGACGTATTGGGACACTGAAGAAGATGCTCCTGGACCTAGATGTGCTCACACTCTTACTGCCGTCGCCCAAACCAAAGCTCATGGCCCTCGGCTGATCTTATTCGGTGGCGCCACCGCCATCGAAGGCGGCGCTTCCTCTCCCGTCCCCGGCATCCGGTTAGCTGGCGTGACAAATTCAGTTCATTCTTACGATGTGCTGACCAGGAAATG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

881 aa · LXL04_037018|LXL04_037018|OH1004|PROTEIN

MGSKPWLQPAPTYHPLETYWDTEEDAPGPRCAHTLTAVAQTKAHGPRLILFGGATAIEGGASSPVPGIRLAGVTNSVHSYDVLTRKWTRIKPAGEPPSPRAAHAAAVVGTMVVFQGGIGPAGHSTDDLYVLDMTNDKYKWHRLVVQGQGPGPRYGHVMDLVAQRYLVTVSGNDGKRVLSDAWALDTAQKPYAWQKLNPEGDKPSARMYATASARSDGMFLLCGGRDTSGTPLADAYGLLMHRNGQWEWTLAPGVSPSSRY...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_037018
TK1151 IDTkA04G010450
OH-1004 IDLXL04_037018
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_037018
位置Chr08:51775754-51780181 (+)
描述Similar to BSL1: Serine/threonine-protein phosphatase BSL1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g03080 参与伸长过程的磷酸酶，可能通过作为油菜素内酯信号调控因子。 暂无已核实直接文献
At2g27210 参与伸长过程的磷酸酶，可能通过作为油菜素内酯信号调控因子。 暂无已核实直接文献
At1g08420 参与伸长过程的磷酸酶，可能通过作为油菜素内酯信号调控因子。 暂无已核实直接文献
At1g03445 正向调控油菜素甾醇（BR）信号转导的磷酸酶。
Nuclear protein phosphatases with Kelch-repeat domains modulate the response to brassinosteroids in Arabidopsis.2004 · DOI: 10.1101/gad.1174204

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os05g0144400 丝氨酸/苏氨酸蛋白磷酸酶BSL1同源物。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_037018 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0032880 regulation of protein localization 生物过程
GO:1900459 positive regulation of brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005777 peroxisome 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0004722 protein serine/threonine phosphatase activity 分子功能
GO:0046872 metal ion binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G03445
ath:AT1G08420
ath:AT2G27210
ath:AT4G03080
dosa:Os05g0144400
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.619
排名 1 · LXL04_037018 · OH-1004
细胞核0.352
排名 2 · LXL04_037018 · OH-1004
细胞膜0.160
排名 3 · LXL04_037018 · OH-1004
溶酶体／液泡0.059
排名 4 · LXL04_037018 · OH-1004
高尔基体0.056
排名 5 · LXL04_037018 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF24681.2Kelch_KLHDC2_KLHL20_DRC721-223 aa
PF13415.13Beta-prop_FBX4222-188 aa
PF13854.13Kelch_HCF71-346 aa
PF24981.2Beta-prop_ATRN-LZTR174-352 aa
PF13415.13Beta-prop_FBX42178-356 aa
PF24681.2Kelch_KLHDC2_KLHL20_DRC7192-355 aa
PF13418.13Beta-prop_TYW4203-280 aa
PF16891.11STPPase_N529-576 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_037018PF24681.2Kelch_KLHDC2_KLHL20_DRC7212237.1e-46157.0
LXL04_037018PF13415.13Beta-prop_FBX42221882.4e-37129.3
LXL04_037018PF13854.13Kelch_HCF713462.9e-1867.0
LXL04_037018PF24981.2Beta-prop_ATRN-LZTR1743529.4e-2278.3
LXL04_037018PF13415.13Beta-prop_FBX421783562.4e-37129.3
LXL04_037018PF24681.2Kelch_KLHDC2_KLHL20_DRC71923557.1e-46157.0
LXL04_037018PF13418.13Beta-prop_TYW42032805.8e-0937.0
LXL04_037018PF16891.11STPPase_N5295764.4e-0627.8
LXL04_037018PF00149.34Metallophos5787853.9e-38132.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8L7U5拟南芥Serine/threonine-protein phosphatase BSL181.532%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9SHS7拟南芥Serine/threonine-protein phosphatase BSL363.141%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9SJF0拟南芥Serine/threonine-protein phosphatase BSL262.821%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9LR78拟南芥Serine/threonine-protein phosphatase BSU153.023%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q60EX6水稻Serine/threonine-protein phosphatase BSL1 homolog77.365%Swiss-Prot强数据库同源证据

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