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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_036953
当前版本: OH-1004 染色体: Chr08 坐标: 50829469-50832337 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1746 bp · LXL04_036953|LXL04_036953|OH1004|cDNA

ATGAGAGACGAAATCTTCACGAAAAGCAAGGTTTCATGGCCTAAAACACTCAAGAAATTGTTCAATGTCAAAAACAAAGCTCAAGATTTTCATGCGGATGatttcaatttcaatcatgGCGGTAGTTATGAAGGAAGGAAGAGCAATTTTTCAGAAAAAGAAATATGCACCATGAAGAAAAGCAGAAGAACAGAAAGTTGGAGAGAAAGATCGAGCAAAAGGACTGCTGATAGTCTTCGAGTAAATAAGCTCGATCTTGA...

CDS

下载 CDS FASTA

1746 bp · LXL04_036953|LXL04_036953|OH1004|CDS

ATGAGAGACGAAATCTTCACGAAAAGCAAGGTTTCATGGCCTAAAACACTCAAGAAATTGTTCAATGTCAAAAACAAAGCTCAAGATTTTCATGCGGATGATTTCAATTTCAATCATGGCGGTAGTTATGAAGGAAGGAAGAGCAATTTTTCAGAAAAAGAAATATGCACCATGAAGAAAAGCAGAAGAACAGAAAGTTGGAGAGAAAGATCGAGCAAAAGGACTGCTGATAGTCTTCGAGTAAATAAGCTCGATCTTGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

581 aa · LXL04_036953|LXL04_036953|OH1004|PROTEIN

MRDEIFTKSKVSWPKTLKKLFNVKNKAQDFHADDFNFNHGGSYEGRKSNFSEKEICTMKKSRRTESWRERSSKRTADSLRVNKLDLDRPQVTDVHNYRVFVATWNVAGKPPTSSLNLEDWLHTSPPADIYVLGFQEIVPLNAGNVLGTEDNGPAKKWLSLIRSTLNSLPVASDGYHFPSPVPDPIVELDSDFEGSVTQKPSSVPHRRSFQSLSRSMRMAESSYREIPHPGLDHRFSVSDRSMFGNRCSDFDQGVGSSDED...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_036953
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_036953
位置Chr08:50829469-50832337 (+)
描述Similar to IP5P4: Type I inositol polyphosphate 5-phosphatase 4
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g63240 I 型肌醇多磷酸 5-磷酸酶 4。 暂无已核实直接文献
At2g32010 对 PtdIns(4,5)P₂ 及较弱程度上的 PtdIns(3,4,5)P₃ 具有磷酸酶活性，但不作用于 Ins(1,4,5)P₃。
CVP2- and CVL1-mediated phosphoinositide signaling as a regulator of the ARF GAP SFC/VAN3 in establishment of foliar vein patterns.2009 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2009.03920.x
Primary root protophloem differentiation requires balanced phosphatidylinositol-4,5-biphosphate levels and systemically affects root branching.2015 · DOI: 10.1242/dev.118364
At1g05470 可能对 PtdIns(4,5)P₂ 和 PtdIns(3,4,5)P₃ 具有磷酸酶活性。
Genetic regulation of vascular tissue patterning in Arabidopsis.1999 · DOI: 10.1105/tpc.11.11.2123
Cotyledon vascular pattern2-mediated inositol (1,4,5) triphosphate signal transduction is essential for closed venation patterns of Arabidopsis foliar organs.2004 · DOI: 10.1105/tpc.021030
CVP2- and CVL1-mediated phosphoinositide signaling as a regulator of the ARF GAP SFC/VAN3 in establishment of foliar vein patterns.2009 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2009.03920.x
Primary root protophloem differentiation requires balanced phosphatidylinositol-4,5-biphosphate levels and systemically affects root branching.2015 · DOI: 10.1242/dev.118364
At5g65090 可能参与根毛发育的调节。
Genetic interactions during root hair morphogenesis in Arabidopsis.2000 · DOI: 10.1105/tpc.12.10.1961
Analysis of the root-hair morphogenesis transcriptome reveals the molecular identity of six genes with roles in root-hair development in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2005.02609.x
At5g04980 I 型肌醇多磷酸 5-磷酸酶 10。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_036953 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009932 cell tip growth 生物过程
GO:0010051 xylem and phloem pattern formation 生物过程
GO:0010053 root epidermal cell differentiation 生物过程
GO:0010067 procambium histogenesis 生物过程
GO:0010305 leaf vascular tissue pattern formation 生物过程
GO:0010588 cotyledon vascular tissue pattern formation 生物过程
GO:0030154 cell differentiation 生物过程
GO:0032957 inositol trisphosphate metabolic process 生物过程
GO:0046856 phosphatidylinositol dephosphorylation 生物过程
GO:0048765 root hair cell differentiation 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G05470
ath:AT2G32010
ath:AT3G63240
ath:AT5G65090
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.327
排名 1 · LXL04_036953 · OH-1004
细胞核0.272
排名 2 · LXL04_036953 · OH-1004
细胞膜0.264
排名 3 · LXL04_036953 · OH-1004
质体0.131
排名 4 · LXL04_036953 · OH-1004
高尔基体0.076
排名 5 · LXL04_036953 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF22669.3Exo_endo_phos2103-170 aa
PF22669.3Exo_endo_phos2294-539 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_036953PF22669.3Exo_endo_phos21031705e-67227.2
LXL04_036953PF22669.3Exo_endo_phos22945395e-67227.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8GTS0拟南芥Type I inositol polyphosphate 5-phosphatase 461.473%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q0WQ41拟南芥Type IV inositol polyphosphate 5-phosphatase 758.541%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9LR47拟南芥Type IV inositol polyphosphate 5-phosphatase 668.012%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q66GQ6拟南芥Type I inositol polyphosphate 5-phosphatase 543.725%Swiss-Prot中等数据库同源证据
A8MR21拟南芥Type I inositol polyphosphate 5-phosphatase 1044.111%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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