基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_036762
当前版本: OH-1004
染色体: Chr08
坐标: 48026971-48032444
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1773 bp · LXL04_036762|LXL04_036762|OH1004|cDNA
ATGGTCGAAGTGATCggagagaaccatccagacaaCACGTCGGAAGGGATTGAAGTTGGATTAAAAGCCATTGCCACGGCGGTGGACAAATCGCCTGACAATGGAGATGCAATTACCACCGTAACTGGCTCAAGTGGATCATTACAAGTCGGTGACCACGGTGGATCGTCGGAAAACAGCAGTCGCTCCGACAAAAACGAAGATTCAGGATCAGGATCAGGATTGTCTAGCGACGACGATGGCATTTCAGATATTTTGAA...
CDS
下载 CDS FASTA1773 bp · LXL04_036762|LXL04_036762|OH1004|CDS
ATGGTCGAAGTGATCGGAGAGAACCATCCAGACAACACGTCGGAAGGGATTGAAGTTGGATTAAAAGCCATTGCCACGGCGGTGGACAAATCGCCTGACAATGGAGATGCAATTACCACCGTAACTGGCTCAAGTGGATCATTACAAGTCGGTGACCACGGTGGATCGTCGGAAAACAGCAGTCGCTCCGACAAAAACGAAGATTCAGGATCAGGATCAGGATTGTCTAGCGACGACGATGGCATTTCAGATATTTTGAA...
590 aa · LXL04_036762|LXL04_036762|OH1004|PROTEIN
MVEVIGENHPDNTSEGIEVGLKAIATAVDKSPDNGDAITTVTGSSGSLQVGDHGGSSENSSRSDKNEDSGSGSGLSSDDDGISDILKFDGNTYKKDEPTTSHVDAGESSGASGKVVEEEIVELEFEKVKPKLATHSMHCPNCKAEVTKVVLRRKVITFRPAEPAVVPVEAPPRDPEDLVGCLSCLSLFTCSGNGCFNPFDIFRKKPERSNVLPPQATVDGMTPVVTENESCLSMFLVFKKKQKMTEPIDPPQVHNDRDFV...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_036762 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_036762 |
|---|---|
| 位置 | Chr08:48026971-48032444 (-) |
| 描述 | Similar to MEBL: Membrane protein of ER body-like protein |
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 | |
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源:OH1004 · |
| GO 注释(OH1004 来源) | GO:0009753 response to jasmonic acid 生物过程 GO:0010039 response to iron ion 生物过程 GO:0030026 intracellular manganese ion homeostasis 生物过程 GO:0005576 extracellular region 细胞组分 GO:0005634 nucleus 细胞组分 GO:0005773 vacuole 细胞组分 GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分 GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分 GO:0005886 plasma membrane 细胞组分 GO:0009705 plant-type vacuole membrane 细胞组分 GO:0010168 ER body 细胞组分 GO:0016020 membrane 细胞组分 |
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT4G27860 ath:AT4G27870 ath:AT5G24290 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。
细胞膜0.783
内质网0.132
细胞质0.086
细胞核0.065
溶酶体/液泡0.051
LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果
预测功能结构域
没有找到该查询的结果。
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。