基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_034810
当前版本: OH-1004
染色体: Chr08
坐标: 2116659-2118231
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1440 bp · LXL04_034810|LXL04_034810|OH1004|cDNA
ATGAAACCATCCAACTCTACTATAGTATTTCTTGCATATTGTTTTCTATTGGTTGGGATAGTTGCAGGAAAAAGAAGTGCTTTGGATACAAGTGCAGGCGACGCAGAAACCATTGCCCACCACTATCAAACAGTCAAACTAAGCTCTTTCCTATCATCTTCAATATGTAGTCCTTCAAGTAAACGTGACAAGAAAAGCATATCATTTGAAGTGGTTCACAAACTTGGACCATGTTCCAAGTTCAgtaaaaagaaattaaa...
CDS
下载 CDS FASTA1440 bp · LXL04_034810|LXL04_034810|OH1004|CDS
ATGAAACCATCCAACTCTACTATAGTATTTCTTGCATATTGTTTTCTATTGGTTGGGATAGTTGCAGGAAAAAGAAGTGCTTTGGATACAAGTGCAGGCGACGCAGAAACCATTGCCCACCACTATCAAACAGTCAAACTAAGCTCTTTCCTATCATCTTCAATATGTAGTCCTTCAAGTAAACGTGACAAGAAAAGCATATCATTTGAAGTGGTTCACAAACTTGGACCATGTTCCAAGTTCAGTAAAAAGAAATTAAA...
479 aa · LXL04_034810|LXL04_034810|OH1004|PROTEIN
MKPSNSTIVFLAYCFLLVGIVAGKRSALDTSAGDAETIAHHYQTVKLSSFLSSSICSPSSKRDKKSISFEVVHKLGPCSKFSKKKLKAITLEEILTRDQSRVDTIRSRLTTTSTTRKKVINFKSSKATMPVKSGTTYDSGNYIVNVEIGTPKKNEQLILDSGSDLTWTQCQPCTGSCYTQQEPIFNPSLSTTYSNIPCTSTACSMIPSATGNLPGCSSSTCVYGVQYGDGSYSVGKLAKDKLTLTNNETLDNFYFGCGVT...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_034810 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_034810 |
|---|---|
| 位置 | Chr08:2116659-2118231 (-) |
| 描述 | Similar to At5g10770: Aspartyl protease family protein At5g10770 |
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 | |
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · |
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0006508 proteolysis 生物过程 GO:0009414 response to water deprivation 生物过程 GO:0009627 systemic acquired resistance 生物过程 GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程 GO:0005576 extracellular region 细胞组分 GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分 GO:0005886 plasma membrane 细胞组分 GO:0009505 plant-type cell wall 细胞组分 GO:0048046 apoplast 细胞组分 GO:0098552 side of membrane 细胞组分 GO:0003677 DNA binding 分子功能 GO:0004190 aspartic-type endopeptidase activity 分子功能 |
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G01300 ath:AT3G18490 ath:AT3G20015 ath:AT5G10760 ath:AT5G10770 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞外0.642
细胞膜0.132
内质网0.126
细胞质0.086
溶酶体／液泡0.056
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF00026.29Asp141-195 aaPF14543.12TAXi_N142-310 aaPF00026.29Asp224-473 aaPF14541.12TAXi_C333-473 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_034810 | PF00026.29 | Asp | 141 | 195 | 5.8e-26 | 92.4 |
| LXL04_034810 | PF14543.12 | TAXi_N | 142 | 310 | 4.1e-52 | 177.6 |
| LXL04_034810 | PF00026.29 | Asp | 224 | 473 | 5.8e-26 | 92.4 |
| LXL04_034810 | PF14541.12 | TAXi_C | 333 | 473 | 2.6e-24 | 86.5 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q8S9J6 | 拟南芥 | Aspartyl protease family protein At5g10770 | 49.043% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q9LEW3 | 拟南芥 | Aspartyl protease AED1 | 43.405% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q9LNJ3 | 拟南芥 | Aspartyl protease family protein 2 | 37.500% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q9LS40 | 拟南芥 | Protein ASPARTIC PROTEASE IN GUARD CELL 1 | 36.691% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q9LHE3 | 拟南芥 | Protein ASPARTIC PROTEASE IN GUARD CELL 2 | 35.750% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |