LXL04_034750 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_034750

当前版本: OH-1004 染色体: Chr07 坐标: 115742070-115743478 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1197 bp · LXL04_034750|LXL04_034750|OH1004|cDNA

ATGGGGTTCGGGCTAAGAGGGGTACTTTTGTCATTTACCATAACGACATTGTTTTCATCAACATTTGCTCAAACTTGTTCTTCTTATGCATTCGCAAGCAACAGGGTTTTCAGTGCTTGCAATGACCTCCCAGTTTTGAACTCTTTTCTCCATTACACATACAACCCAATTTCAAAAACACTCAGAATCGCATATCGCCACACCAACGTCGGCTCTTCACGATGGGTCGCATGGGCAATCAATCCAACTTCTCAAGGCAT...

CDS

下载 CDS FASTA

1197 bp · LXL04_034750|LXL04_034750|OH1004|CDS

ATGGGGTTCGGGCTAAGAGGGGTACTTTTGTCATTTACCATAACGACATTGTTTTCATCAACATTTGCTCAAACTTGTTCTTCTTATGCATTCGCAAGCAACAGGGTTTTCAGTGCTTGCAATGACCTCCCAGTTTTGAACTCTTTTCTCCATTACACATACAACCCAATTTCAAAAACACTCAGAATCGCATATCGCCACACCAACGTCGGCTCTTCACGATGGGTCGCATGGGCAATCAATCCAACTTCTCAAGGCAT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

398 aa · LXL04_034750|LXL04_034750|OH1004|PROTEIN

MGFGLRGVLLSFTITTLFSSTFAQTCSSYAFASNRVFSACNDLPVLNSFLHYTYNPISKTLRIAYRHTNVGSSRWVAWAINPTSQGMVGSQALVAFRQSDGKMRAYTAPVTGYTTQLQEGDLSFPVSDLSATYFNNEMIIYATLGLQNASTSLNQVWQDGQLSGSAPMVHATAGDNVKSMATLNVLSGQSGSAPAAGGSSKNEKRNIHGVLNAMSWGMMMPMGAILARYVRVFQSADPAWFYLHVTCQTAGYIVGVAGWA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_034750`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_034750

位置 Chr07:115742070-115743478 (+)

描述 Similar to At5g47530: Cytochrome b561 and DOMON domain-containing protein At5g47530

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g47530`	可能作为儿茶酚胺响应的跨膜电子载体。	暂无已核实直接文献
`At4g17280`	可能作为儿茶酚胺响应的跨膜电子载体。	暂无已核实直接文献
`At5g35735`	可能作为儿茶酚胺响应的跨膜电子载体。	暂无已核实直接文献
`At3g25290`	可能作为儿茶酚胺响应的跨膜电子载体。	暂无已核实直接文献
`At3g59070`	可能作为儿茶酚胺响应的跨膜电子载体。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_034750 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0016036 cellular response to phosphate starvation 生物过程

GO:0071456 cellular response to hypoxia 生物过程

GO:0080022 primary root development 生物过程

GO:0005576 extracellular region 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0009506 plasmodesma 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0016020 membrane 细胞组分

GO:0000293 ferric-chelate reductase activity 分子功能

GO:0009055 electron transfer activity 分子功能

GO:0046872 metal ion binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT3G25290

ath:AT3G59070

ath:AT4G17280

ath:AT5G35735

ath:AT5G47530

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.786

排名 1 · LXL04_034750 · OH-1004

细胞质0.112

排名 2 · LXL04_034750 · OH-1004

溶酶体／液泡0.090

排名 3 · LXL04_034750 · OH-1004

内质网0.063

排名 4 · LXL04_034750 · OH-1004

高尔基体0.046

排名 5 · LXL04_034750 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF04526.19DUF56887-184 aa

PF03188.22Cytochrom_B561208-332 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_034750	`PF04526.19`	DUF568	87	184	1.1e-27	97.3
LXL04_034750	`PF03188.22`	Cytochrom_B561	208	332	2.9e-06	28.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9FGK4`	拟南芥	Cytochrome b561 and DOMON domain-containing protein At5g47530	59.524%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`Q8VYH6`	拟南芥	Cytochrome b561 and DOMON domain-containing protein At4g17280	58.398%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`Q9FKH6`	拟南芥	Cytochrome b561 and DOMON domain-containing protein At5g35735	50.270%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`Q9LSE7`	拟南芥	Cytochrome b561 and DOMON domain-containing protein At3g25290	46.486%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据
`Q9LYS9`	拟南芥	Cytochrome b561 and DOMON domain-containing protein At3g59070	49.112%	Swiss-Prot	中等数据库同源证据

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