LXL04_033432 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_033432

当前版本: OH-1004 染色体: Chr07 坐标: 43809513-43815416 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

2103 bp · LXL04_033432|LXL04_033432|OH1004|cDNA

ATGTTCAGAAAGATCATTTCTTCCCATTCTAAGTCAAAGACAAGAAAATTTGTATCGATATCACATCATTCCACCAACTATTGCTACTACGATCACTCAGCACCACCTTCTTCCCCATCAAAACACATTTCCCCCAGACAAAAATGGCTTGATATCACACCAACTTCATTAAAGGGTTTCAATCGATCTTTTTCAGCTGGGTACCAGTTAAATTCGACGCAGTATAGTGGGTCTAATTCGAATAAAAGAAATAGGTTTTC...

CDS

下载 CDS FASTA

2103 bp · LXL04_033432|LXL04_033432|OH1004|CDS

ATGTTCAGAAAGATCATTTCTTCCCATTCTAAGTCAAAGACAAGAAAATTTGTATCGATATCACATCATTCCACCAACTATTGCTACTACGATCACTCAGCACCACCTTCTTCCCCATCAAAACACATTTCCCCCAGACAAAAATGGCTTGATATCACACCAACTTCATTAAAGGGTTTCAATCGATCTTTTTCAGCTGGGTACCAGTTAAATTCGACGCAGTATAGTGGGTCTAATTCGAATAAAAGAAATAGGTTTTC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

700 aa · LXL04_033432|LXL04_033432|OH1004|PROTEIN

MFRKIISSHSKSKTRKFVSISHHSTNYCYYDHSAPPSSPSKHISPRQKWLDITPTSLKGFNRSFSAGYQLNSTQYSGSNSNKRNRFSVRRGFSSETVRECINYDVVIVGGGPAGLSAAIRLKQLCRESDVDLSVCVVEKGAEVGAHILSGNVFEPRALNELIPQWREEEAPISVSVSSDKFMLLTEKHAIPLPNPFDNKGNYVISLSQFVRWLGQKAEELGVEVYPGFAAKEVLFDENENVIGIATNDMGIGKDGSKKDN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_033432`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_033432

位置 Chr07:43809513-43815416 (-)

描述 Similar to ETFQO: Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At2g43400`	通过将电子从电子转移黄素蛋白转移到泛醌，将脂肪酸 β-氧化和氨基酸分解代谢与呼吸链联系起来。	The critical role of Arabidopsis electron-transfer flavoprotein:ubiquinone oxidoreductase during dark-induced starvation.2005 · DOI: 10.1105/tpc.105.035162 Identification of the 2-hydroxyglutarate and isovaleryl-CoA dehydrogenases as alternative electron donors linking lysine catabolism to the electron transport chain of Arabidopsis mitochondria.2010 · DOI: 10.1105/tpc.110.075630

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os10g0516300`	通过将电子从电子转移黄素蛋白 (ETF) 转移到泛醌，将脂肪酸 β-氧化和氨基酸分解代谢与呼吸链联系起来。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_033432 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006552 L-leucine catabolic process 生物过程

GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程

GO:0009646 response to absence of light 生物过程

GO:0010230 alternative respiration 生物过程

GO:0022900 electron transport chain 生物过程

GO:0033539 fatty acid beta-oxidation using acyl-CoA dehydrogenase 生物过程

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0005743 mitochondrial inner membrane 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0016020 membrane 细胞组分

GO:0031966 mitochondrial membrane 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT2G43400

ddi:DDB_G0278849

dosa:Os10g0516300

rno:295143

ssc:100515785

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.930

排名 1 · LXL04_033432 · OH-1004

细胞质0.055

排名 2 · LXL04_033432 · OH-1004

细胞核0.039

排名 3 · LXL04_033432 · OH-1004

质体0.034

排名 4 · LXL04_033432 · OH-1004

细胞膜0.026

排名 5 · LXL04_033432 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01946.24Thi495-153 aa

PF01266.31DAO104-146 aa

PF13450.13NAD_binding_8107-152 aa

PF21162.4ETFQO_UQ-bd303-396 aa

PF05187.20Fer4_ETF_QO532-631 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_033432	`PF01946.24`	Thi4	95	153	1.7e-06	28.2
LXL04_033432	`PF01266.31`	DAO	104	146	2.2e-07	31.5
LXL04_033432	`PF13450.13`	NAD_binding_8	107	152	4.9e-07	30.7
LXL04_033432	`PF21162.4`	ETFQO_UQ-bd	303	396	3.9e-42	143.4
LXL04_033432	`PF05187.20`	Fer4_ETF_QO	532	631	3.6e-44	149.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`O22854`	拟南芥	Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial	73.875%	Swiss-Prot	强数据库同源证据
`Q337B8`	水稻	Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial	76.923%	Swiss-Prot	强数据库同源证据

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