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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_033279
当前版本: OH-1004 染色体: Chr07 坐标: 40256344-40261952 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1710 bp · LXL04_033279|LXL04_033279|OH1004|cDNA

ATGCACTTGATCAAGGAGACAGCGAGTTTTGGAAAGAGGCCGGTAATGATGCTTTCAGAGTACAAGCATGAAAATATTATCTCCCTCCTTGGGTTCTGTGATGAGGAAGGCCGGAAGATACTTATATACAAATATGCTTCTAAGAAAAGTCTTGACGCACATCTCGATAACAAGGAGTTGGAGTGGGCTCAACGCCTTAAAATATGCATTGGTGCGGCTCAGGGACTAGCTTACATTCATGATCCTACAGGAAGCCAACA...

CDS

下载 CDS FASTA

1710 bp · LXL04_033279|LXL04_033279|OH1004|CDS

ATGCACTTGATCAAGGAGACAGCGAGTTTTGGAAAGAGGCCGGTAATGATGCTTTCAGAGTACAAGCATGAAAATATTATCTCCCTCCTTGGGTTCTGTGATGAGGAAGGCCGGAAGATACTTATATACAAATATGCTTCTAAGAAAAGTCTTGACGCACATCTCGATAACAAGGAGTTGGAGTGGGCTCAACGCCTTAAAATATGCATTGGTGCGGCTCAGGGACTAGCTTACATTCATGATCCTACAGGAAGCCAACA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

569 aa · LXL04_033279|LXL04_033279|OH1004|PROTEIN

MHLIKETASFGKRPVMMLSEYKHENIISLLGFCDEEGRKILIYKYASKKSLDAHLDNKELEWAQRLKICIGAAQGLAYIHDPTGSQQRLLHRDIKSSKILLDENWNAIVSGFGLSRFGPANQKNTSIIIDNVVGTVGYVDPEYMESGILTKESDIYSFGVVLFEVLCGRLCIVSIQRPSLAMMIRRHIRRHKLENLEDIVWSNIKDDIHPESLKKFSAIAYKCLERDHEDRPELEEIIEVLKHCLKIQLTLNTNSSLVKM...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_033279
TK1151 IDTkA08G244710
OH-1004 IDLXL04_033279
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)80.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 85.461 / OH-1004 34.271
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_033279
位置Chr07:40256344-40261952 (-)
描述Similar to ANX2: Receptor-like protein kinase ANXUR2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g28680 类受体蛋白激酶，通过在适当时间引导花粉管破裂来释放精细胞，从而控制花粉管行为。 暂无已核实直接文献
At5g24010 可能的受体样蛋白激酶 At5g24010。 暂无已核实直接文献
At1g30570 可能的受体样蛋白激酶 At1g30570。 暂无已核实直接文献
At3g46290 营养生长过程中细胞伸长所需的受体样蛋白激酶，主要以油菜素甾醇 独立的方式进行。
Three related receptor-like kinases are required for optimal cell elongation in Arabidopsis thaliana.2009 · DOI: 10.1073/pnas.0812346106
At5g39000 推测的受体样蛋白激酶At5g39000。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_033279 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009741 response to brassinosteroid 生物过程
GO:0009826 unidimensional cell growth 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0016324 apical plasma membrane 细胞组分
GO:0090404 pollen tube tip 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0004714 transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G30570
ath:AT5G24010
ath:AT5G28680
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.439
排名 1 · LXL04_033279 · OH-1004
细胞质0.411
排名 2 · LXL04_033279 · OH-1004
细胞核0.223
排名 3 · LXL04_033279 · OH-1004
内质网0.061
排名 4 · LXL04_033279 · OH-1004
线粒体0.048
排名 5 · LXL04_033279 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr15-241 aa
PF00069.32Pkinase16-239 aa
PF00069.32Pkinase352-480 aa
PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr354-479 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_033279PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr152416.7e-54183.6
LXL04_033279PF00069.32Pkinase162397.8e-48163.9
LXL04_033279PF00069.32Pkinase3524807.8e-48163.9
LXL04_033279PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr3544796.7e-54183.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q3E8W4拟南芥Receptor-like protein kinase ANXUR244.534%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9FLW0拟南芥Probable receptor-like protein kinase At5g2401043.882%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9SA72拟南芥Probable receptor-like protein kinase At1g3057041.772%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9LX66拟南芥Receptor-like protein kinase HERK 141.176%Swiss-Prot低置信数据库同源证据
Q9FID8拟南芥Putative receptor-like protein kinase At5g3900040.909%Swiss-Prot低置信数据库同源证据

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