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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_033030
当前版本: OH-1004 染色体: Chr07 坐标: 34398509-34400338 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1652 bp · LXL04_033030|LXL04_033030|OH1004|cDNA

ACATCACATTATATATCATAATTATCGTAATCGAGAGAAATTAAAGAACTAAGAATCCAATGTCTGGTATCGAAGGTTCTCCGGGAAGCTCCATGCATGGAGTTACCGGCCGGGAACCAGTGATGGCGTTCTCTGTGGCATCTCCGATGGTGGCAACTGATACAACGGCGAAGTTCGACCTCCCGGTGGACTCTGAACACAAGGCTAAAGTATTTAAACTCTTCTCATTTGCAAACCCTCACATGAGAACCTTCCACCTC...

CDS

下载 CDS FASTA

1593 bp · LXL04_033030|LXL04_033030|OH1004|CDS

ATGTCTGGTATCGAAGGTTCTCCGGGAAGCTCCATGCATGGAGTTACCGGCCGGGAACCAGTGATGGCGTTCTCTGTGGCATCTCCGATGGTGGCAACTGATACAACGGCGAAGTTCGACCTCCCGGTGGACTCTGAACACAAGGCTAAAGTATTTAAACTCTTCTCATTTGCAAACCCTCACATGAGAACCTTCCACCTCTCGTGGATCTCCTTCTTCGCCACCTTCGTCTCCACCTTCGCGGCGGCTCCTCTGGTCCC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

530 aa · LXL04_033030|LXL04_033030|OH1004|PROTEIN

MSGIEGSPGSSMHGVTGREPVMAFSVASPMVATDTTAKFDLPVDSEHKAKVFKLFSFANPHMRTFHLSWISFFATFVSTFAAAPLVPIIRDNLDLTKADIGNAGVASVSGSIFSRLVMGAVCDLLGPRYGCAFLIMLSAPTIFCMSFVADASGYIAVRFMIGFSLATFVSCQYWMSTMFNSKIIGLVNGTAAGWGNMGGGATQLLMPVLFEIIKKAGATPFTAWRIAFFIPGWLNVIMGIFVLTLGQDLPDGNLGALQKK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_033030
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_033030
位置Chr07:34398509-34400338 (-)
描述Similar to NRT2.1: High-affinity nitrate transporter 2.1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g08090 参与硝酸盐转运，但似乎不能自行介导转运。
Major alterations of the regulation of root NO(3)(-) uptake are associated with the mutation of Nrt2.1 and Nrt2.2 genes in Arabidopsis.2001 · DOI: 10.1104/pp.127.1.262
Disruption of the nitrate transporter genes AtNRT2.1 and AtNRT2.2 restricts growth at low external nitrate concentration.2004 · DOI: 10.1007/s00425-004-1266-x
The putative high-affinity nitrate transporter NRT2.1 represses lateral root initiation in response to nutritional cues.2005 · DOI: 10.1073/pnas.0504219102
A central role for the nitrate transporter NRT2.1 in the integrated morphological and physiological responses of the root system to nitrogen limitation in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1104/pp.105.075721
Dissection of the AtNRT2.1:AtNRT2.2 inducible high-affinity nitrate transporter gene cluster.2007 · DOI: 10.1104/pp.106.091223
Nitrate signaling and the two component high affinity uptake system in Arabidopsis.2007 · DOI: 10.4161/psb.2.4.3870
At5g60770 参与高亲和力硝酸盐转运。
Disruption of the nitrate transporter genes AtNRT2.1 and AtNRT2.2 restricts growth at low external nitrate concentration.2004 · DOI: 10.1007/s00425-004-1266-x
At1g08100 参与高亲和力硝酸盐转运。
Major alterations of the regulation of root NO(3)(-) uptake are associated with the mutation of Nrt2.1 and Nrt2.2 genes in Arabidopsis.2001 · DOI: 10.1104/pp.127.1.262
Disruption of the nitrate transporter genes AtNRT2.1 and AtNRT2.2 restricts growth at low external nitrate concentration.2004 · DOI: 10.1007/s00425-004-1266-x
Dissection of the AtNRT2.1:AtNRT2.2 inducible high-affinity nitrate transporter gene cluster.2007 · DOI: 10.1104/pp.106.091223

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os02g0112600 参与硝酸盐转运，但似乎不能自行介导转运。
Spatial expression and regulation of rice high-affinity nitrate transporters by nitrogen and carbon status.2011 · DOI: 10.1093/jxb/erq403
Rice OsNAR2.1 interacts with OsNRT2.1, OsNRT2.2 and OsNRT2.3a nitrate transporters to provide uptake over high and low concentration ranges.2011 · DOI: 10.1111/j.1365-3040.2011.02335.x
Os02g0112100 参与硝酸盐转运，但似乎不能自行介导转运。
Spatial expression and regulation of rice high-affinity nitrate transporters by nitrogen and carbon status.2011 · DOI: 10.1093/jxb/erq403
Rice OsNAR2.1 interacts with OsNRT2.1, OsNRT2.2 and OsNRT2.3a nitrate transporters to provide uptake over high and low concentration ranges.2011 · DOI: 10.1111/j.1365-3040.2011.02335.x
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_033030 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0010167 response to nitrate 生物过程
GO:0015706 nitrate transmembrane transport 生物过程
GO:0042128 nitrate assimilation 生物过程
GO:0048527 lateral root development 生物过程
GO:0071249 cellular response to nitrate 生物过程
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0015112 nitrate transmembrane transporter activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G08090
ath:AT1G08100
ath:AT5G60770
dosa:Os02g0112100
dosa:Os02g0112600
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.686
排名 1 · LXL04_033030 · OH-1004
细胞质0.171
排名 2 · LXL04_033030 · OH-1004
内质网0.089
排名 3 · LXL04_033030 · OH-1004
溶酶体／液泡0.081
排名 4 · LXL04_033030 · OH-1004
高尔基体0.064
排名 5 · LXL04_033030 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07690.22MFS_169-425 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_033030PF07690.22MFS_1694255e-2175.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O82811拟南芥High-affinity nitrate transporter 2.176.226%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9FJH8拟南芥High affinity nitrate transporter 2.476.571%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9LMZ9拟南芥High-affinity nitrate transporter 2.272.275%Swiss-Prot强数据库同源证据
P0DKH0水稻High-affinity nitrate transporter 2.273.171%Swiss-Prot强数据库同源证据
P0DKG9水稻High-affinity nitrate transporter 2.173.171%Swiss-Prot强数据库同源证据

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