LXL04_032797 | RubberDandelionOmics

基因概览

LXL04_032797

当前版本: OH-1004 染色体: Chr07 坐标: 29405173-29415164 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

5013 bp · LXL04_032797|LXL04_032797|OH1004|cDNA

ATGGAATCTGAATCATACTCCTTGCAATGGCCACAACCTTGCCGCCACTTTAAATTTCCTGAAATTCGGTTAGCCACTAGAAACTTTGATGAATCCTTAGTAATAGGGCATGGGGGATTTGGAAAAGTTTACAAAGGTACCATTCACGATGGATCAAGTCTTGTTGTTGCTGCCATTAAACGACTGGATTCCAAGTCCGATCAAGGAGCTGATGAGTTTTGGGCCGAAGTCAAGATGCTTTCCAAGTTGCGCCACTGCCA...

CDS

下载 CDS FASTA

5013 bp · LXL04_032797|LXL04_032797|OH1004|CDS

ATGGAATCTGAATCATACTCCTTGCAATGGCCACAACCTTGCCGCCACTTTAAATTTCCTGAAATTCGGTTAGCCACTAGAAACTTTGATGAATCCTTAGTAATAGGGCATGGGGGATTTGGAAAAGTTTACAAAGGTACCATTCACGATGGATCAAGTCTTGTTGTTGCTGCCATTAAACGACTGGATTCCAAGTCCGATCAAGGAGCTGATGAGTTTTGGGCCGAAGTCAAGATGCTTTCCAAGTTGCGCCACTGCCA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

1670 aa · LXL04_032797|LXL04_032797|OH1004|PROTEIN

MESESYSLQWPQPCRHFKFPEIRLATRNFDESLVIGHGGFGKVYKGTIHDGSSLVVAAIKRLDSKSDQGADEFWAEVKMLSKLRHCHLVSLIGYCDDRNEMILVYEYMPYGSFEDHLHKFSTPLPWLQRLKLCIGAARGLDYLHTGTGIEFGVIHRDVKSANILLNDSWAAKIADFGLSKIGPKDQPFSHVSTLVKGTFGYLDPDYFYTGRLTRKSDVYAFGVVLFEVLCRKRALDASRDEEQHSLARWVQDSIKDGTLK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_032797`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_032797

位置 Chr07:29405173-29415164 (-)

描述 Similar to MPK14: Mitogen-activated protein kinase 14

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g19010`	丝裂原活化蛋白激酶16。	暂无已核实直接文献
`At1g73670`	丝裂原活化蛋白激酶 15。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`Os05g0143500`	线粒体活化蛋白激酶14。	暂无已核实直接文献
`Os11g0271100`	丝裂原活化蛋白激酶 15。	暂无已核实直接文献
`Os05g0576800`	丝裂原活化蛋白激酶17。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_032797 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0007165 signal transduction 生物过程

GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程

GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能

GO:0004707 MAP kinase activity 分子功能

GO:0005524 ATP binding 分子功能

GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT5G19010

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.644

排名 1 · LXL04_032797 · OH-1004

细胞质0.392

排名 2 · LXL04_032797 · OH-1004

细胞膜0.062

排名 3 · LXL04_032797 · OH-1004

内质网0.040

排名 4 · LXL04_032797 · OH-1004

线粒体0.030

排名 5 · LXL04_032797 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069.32Pkinase34-301 aa

PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr34-303 aa

PF00069.32Pkinase395-686 aa

PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr396-614 aa

PF27041.1ZBED1_RNase-like1102-1185 aa

PF27039.1ZBED1_RNase-like_helical1197-1293 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
LXL04_032797	`PF00069.32`	Pkinase	34	301	2.5e-107	358.9
LXL04_032797	`PF07714.24`	PK_Tyr_Ser-Thr	34	303	3e-79	266.7
LXL04_032797	`PF00069.32`	Pkinase	395	686	2.5e-107	358.9
LXL04_032797	`PF07714.24`	PK_Tyr_Ser-Thr	396	614	3e-79	266.7
LXL04_032797	`PF27041.1`	ZBED1_RNase-like	1102	1185	3.1e-20	72.8
LXL04_032797	`PF27039.1`	ZBED1_RNase-like_helical	1197	1293	1e-19	71.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q8W4J2`	拟南芥	Mitogen-activated protein kinase 16	61.101%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据
`Q9C9U4`	拟南芥	Mitogen-activated protein kinase 15	61.822%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据
`Q75KK8`	水稻	Mitogen-activated protein kinase 14	72.554%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据
`Q53N72`	水稻	Mitogen-activated protein kinase 15	71.596%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据
`Q6L5F7`	水稻	Mitogen-activated protein kinase 17	68.983%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据

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