基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_032488
当前版本: OH-1004
染色体: Chr07
坐标: 24039249-24042057
链方向: -
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1743 bp · LXL04_032488|LXL04_032488|OH1004|cDNA
ATGGAAGAAATACCGATGAATGAAAAGTCGAGCATCGATGCAGAATTACAAACGAAATTAATCCTGCACAGTGATCATGATCGTAAAGGTGGTCTCAGAACCATGCCGTTCATCATAGTGAATGAAGCATTTGAGAGAGTGGCGAGCTATGGACTGATGCCAAACATGATATTCTATCTGATGGAAGTTTATCACATGGAAGCTGTAACTGGAACAAGCATACTCTCCATCTGGTCAGCTCTTTCGAACGGTCTCTCCAT...
CDS
下载 CDS FASTA1743 bp · LXL04_032488|LXL04_032488|OH1004|CDS
ATGGAAGAAATACCGATGAATGAAAAGTCGAGCATCGATGCAGAATTACAAACGAAATTAATCCTGCACAGTGATCATGATCGTAAAGGTGGTCTCAGAACCATGCCGTTCATCATAGTGAATGAAGCATTTGAGAGAGTGGCGAGCTATGGACTGATGCCAAACATGATATTCTATCTGATGGAAGTTTATCACATGGAAGCTGTAACTGGAACAAGCATACTCTCCATCTGGTCAGCTCTTTCGAACGGTCTCTCCAT...
580 aa · LXL04_032488|LXL04_032488|OH1004|PROTEIN
MEEIPMNEKSSIDAELQTKLILHSDHDRKGGLRTMPFIIVNEAFERVASYGLMPNMIFYLMEVYHMEAVTGTSILSIWSALSNGLSIFGALIADSYLGRFWVIALGSLSTLLVSLPPPLSISILNKLTNIFLFLQGMISLWLTSMFPQLRPSSCSQLDAICTPATSTQLALLFSSLGLLSIGCGCIRPCSMAFGADQLNNDRTPNKQRVIDSYFNWYYASAAFSTVIAFTVVVYIQDRYGWQVGFAVPVLFMVCSALMFL...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_032488 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_032488 | ||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr07:24039249-24042057 (-) | ||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to NPF1.2: Protein NRT1/ PTR FAMILY 1.2 | ||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。 | ||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | ||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0010233 phloem transport 生物过程 GO:0015706 nitrate transmembrane transport 生物过程 GO:0042128 nitrate assimilation 生物过程 GO:0055085 transmembrane transport 生物过程 GO:0090408 phloem nitrate loading 生物过程 GO:0090449 phloem glucosinolate loading 生物过程 GO:1901349 glucosinolate transport 生物过程 GO:0005634 nucleus 细胞组分 GO:0005886 plasma membrane 细胞组分 GO:0009506 plasmodesma 细胞组分 GO:0009507 chloroplast 细胞组分 GO:0015112 nitrate transmembrane transporter activity 分子功能 | ||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G18880 ath:AT1G52190 ath:AT1G69870 ath:AT3G16180 ath:AT5G62680 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞膜0.560
溶酶体／液泡0.187
内质网0.120
细胞质0.077
高尔基体0.045
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF00854.28PTR2134-539 aaPF07690.22MFS_1167-519 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_032488 | PF00854.28 | PTR2 | 134 | 539 | 1.4e-73 | 248.8 |
| LXL04_032488 | PF07690.22 | MFS_1 | 167 | 519 | 8.1e-13 | 48.7 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q9M817 | 拟南芥 | Protein NRT1/ PTR FAMILY 1.2 | 45.085% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q8LPL2 | 拟南芥 | Protein NRT1/ PTR FAMILY 1.1 | 44.662% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q8RX77 | 拟南芥 | Protein NRT1/ PTR FAMILY 2.13 | 37.676% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q9LV10 | 拟南芥 | Protein NRT1/ PTR FAMILY 2.11 | 35.314% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q9M9V7 | 拟南芥 | Protein NRT1/ PTR FAMILY 2.9 | 34.118% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |