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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_032120
当前版本: OH-1004 染色体: Chr07 坐标: 17068497-17073943 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1992 bp · LXL04_032120|LXL04_032120|OH1004|cDNA

ATGGGTTTAGACACGAACCGAGTGGAGGACAATTCGGGTTCGGGTCATGCTCAACCAGAAACCACCACGGTTTCTATAGTAGTTCCGCCGGAAACAATGGAGCCACGGGAACTACACGGCGTCTGTCTCCCGCCGAAGAAAACTAGTTTTCAGAAACTCCGGCACAAACTGTCGGAGATTTTCTTCCCTGACGATCCTCTCCACAGATTTAAAAACCAAACACGCTTTAACAAATTCCTCTTCGCTCTTCATTACGTCTT...

CDS

下载 CDS FASTA

1992 bp · LXL04_032120|LXL04_032120|OH1004|CDS

ATGGGTTTAGACACGAACCGAGTGGAGGACAATTCGGGTTCGGGTCATGCTCAACCAGAAACCACCACGGTTTCTATAGTAGTTCCGCCGGAAACAATGGAGCCACGGGAACTACACGGCGTCTGTCTCCCGCCGAAGAAAACTAGTTTTCAGAAACTCCGGCACAAACTGTCGGAGATTTTCTTCCCTGACGATCCTCTCCACAGATTTAAAAACCAAACACGCTTTAACAAATTCCTCTTCGCTCTTCATTACGTCTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

663 aa · LXL04_032120|LXL04_032120|OH1004|PROTEIN

MGLDTNRVEDNSGSGHAQPETTTVSIVVPPETMEPRELHGVCLPPKKTSFQKLRHKLSEIFFPDDPLHRFKNQTRFNKFLFALHYVFPIFQWAPTYNLTLFHSDVVAGLTIASLAIPQGISYAKLANLPPVIGLYSSFVPPLIYAVLGSSKHLAVGPVSIASLVMGTMLNDAVSYSLNPVLYLKLAFTATFFAGLFQASLGFLRLGFLIDFLSKATLVGFMAGAAVIVSMQQLKGLLGIVNFTTKMQIIPVLSSVIEQRD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_032120
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_032120
位置Chr07:17068497-17073943 (+)
描述Similar to SULTR3;4: Probable sulfate transporter 3.4
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g15990 H⁺/硫酸盐共运输蛋白，可能在硫酸盐同化调控中起作用。 暂无已核实直接文献
At1g23090 H⁺/硫酸盐共运输蛋白，可能在硫酸盐同化调控中起作用。 暂无已核实直接文献
At3g51895 H⁺/硫酸盐共运输蛋白，可能在硫酸盐同化调控中起作用。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_032120 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006817 phosphate ion transport 生物过程
GO:0055085 transmembrane transport 生物过程
GO:1902358 sulfate transmembrane transport 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0008271 secondary active sulfate transmembrane transporter activity 分子功能
GO:0015116 sulfate transmembrane transporter activity 分子功能
GO:0015293 symporter activity 分子功能
GO:0022857 transmembrane transporter activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G23090
ath:AT3G15990
ath:AT3G51895
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.674
排名 1 · LXL04_032120 · OH-1004
细胞质0.139
排名 2 · LXL04_032120 · OH-1004
溶酶体／液泡0.116
排名 3 · LXL04_032120 · OH-1004
内质网0.075
排名 4 · LXL04_032120 · OH-1004
线粒体0.056
排名 5 · LXL04_032120 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00916.27Sulfate_transp101-480 aa
PF01740.27STAS534-651 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_032120PF00916.27Sulfate_transp1014802.7e-127425.4
LXL04_032120PF01740.27STAS5346518.8e-2484.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LW86拟南芥Probable sulfate transporter 3.469.335%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9SXS2拟南芥Probable sulfate transporter 3.362.319%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9SV13拟南芥Sulfate transporter 3.154.487%Swiss-Prot强数据库同源证据

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