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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_031821
当前版本: OH-1004 染色体: Chr07 坐标: 11803200-11804450 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

561 bp · LXL04_031821|LXL04_031821|OH1004|cDNA

ATGGACGGACCACCAGGAAACGACTTTTGTGCAATCTGCCATGGCAACTTCCATATCCCTCATCAAGCCAATTGCTCTCATTGGTATTGCGGCAATTGCATTTTACAAGTTTGGAATCATGGATCTGCATTACAGCCATGTAAATGCCCTCTTTGTCGTCGCCAGATTACTCTGTTAGTTCCCAGCCAAGCTTCCTCTCAGCAAGTTGATAATCCAGAAGCTTCTGAGAtcataaaaaaaattgaaactTATAATCGTCT...

CDS

下载 CDS FASTA

561 bp · LXL04_031821|LXL04_031821|OH1004|CDS

ATGGACGGACCACCAGGAAACGACTTTTGTGCAATCTGCCATGGCAACTTCCATATCCCTCATCAAGCCAATTGCTCTCATTGGTATTGCGGCAATTGCATTTTACAAGTTTGGAATCATGGATCTGCATTACAGCCATGTAAATGCCCTCTTTGTCGTCGCCAGATTACTCTGTTAGTTCCCAGCCAAGCTTCCTCTCAGCAAGTTGATAATCCAGAAGCTTCTGAGATCATAAAAAAAATTGAAACTTATAATCGTCT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

186 aa · LXL04_031821|LXL04_031821|OH1004|PROTEIN

MDGPPGNDFCAICHGNFHIPHQANCSHWYCGNCILQVWNHGSALQPCKCPLCRRQITLLVPSQASSQQVDNPEASEIIKKIETYNRLFGSESSGLTQKLQDLPFLIKRLFRELMDPQRSIPFVIKARVYLALISTVLYVLSPVDIIPEALFGILGLLDDVIIALIFFLHVGTLYRALLVRRYGGSS

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_031821
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_031821
位置Chr07:11803200-11804450 (-)
描述Similar to RNF170: E3 ubiquitin-protein ligase RNF170
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

当前来源表未检出该物种的同源命中。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_031821 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000209 protein polyubiquitination 生物过程
GO:0009266 response to temperature stimulus 生物过程
GO:0010467 gene expression 生物过程
GO:0010498 proteasomal protein catabolic process 生物过程
GO:0014823 response to activity 生物过程
GO:0016567 protein ubiquitination 生物过程
GO:0030163 protein catabolic process 生物过程
GO:0034138 toll-like receptor 3 signaling pathway 生物过程
GO:0034140 negative regulation of toll-like receptor 3 signaling pathway 生物过程
GO:0043161 proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process 生物过程
GO:0045087 innate immune response 生物过程
GO:0070936 protein K48-linked ubiquitination 生物过程
KEGG 基因交叉引用
dre:406612
hsa:81790
mmu:77733
xtr:549626
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.477
排名 1 · LXL04_031821 · OH-1004
高尔基体0.344
排名 2 · LXL04_031821 · OH-1004
细胞质0.196
排名 3 · LXL04_031821 · OH-1004
细胞核0.107
排名 4 · LXL04_031821 · OH-1004
细胞膜0.104
排名 5 · LXL04_031821 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF06803.18DUF1232129-164 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_031821PF06803.18DUF12321291641.9e-0937.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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