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基因概览

LXL04_029815

当前版本: OH-1004 染色体: Chr06 坐标: 101101967-101103594 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

546 bp · LXL04_029815|LXL04_029815|OH1004|cDNA

ATGGCTGATAGTAATCCAGGAGTCAAATTCAACCACATCAGCTTTGAAAGATTACCAAATCCTTTCTCCGTCGGGATGCTTTCAAATCATGGATCTTCGACTATTGGTTTACCAAATGAATCAAGTGAGGTTGTTGTTGGTAGTACAAGAGATCAGTTAATTGGAAGCAAGTTAAGAACAAGATGGCCTGATGACAATAACTTTTATGAAGCTGTCATAGTCGAATATAATCCTGTAcagGGACTACATGCACTGCTTTA...

CDS

下载 CDS FASTA

546 bp · LXL04_029815|LXL04_029815|OH1004|CDS

ATGGCTGATAGTAATCCAGGAGTCAAATTCAACCACATCAGCTTTGAAAGATTACCAAATCCTTTCTCCGTCGGGATGCTTTCAAATCATGGATCTTCGACTATTGGTTTACCAAATGAATCAAGTGAGGTTGTTGTTGGTAGTACAAGAGATCAGTTAATTGGAAGCAAGTTAAGAACAAGATGGCCTGATGACAATAACTTTTATGAAGCTGTCATAGTCGAATATAATCCTGTACAGGGACTACATGCACTGCTTTA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

181 aa · LXL04_029815|LXL04_029815|OH1004|PROTEIN

MADSNPGVKFNHISFERLPNPFSVGMLSNHGSSTIGLPNESSEVVVGSTRDQLIGSKLRTRWPDDNNFYEAVIVEYNPVQGLHALLYNKNTPQESFEWVNLKENPVDMEGLKNAHIRDGAAVVQYLAWLDMQMQELYGASGYFKESESQKTKTPLGDAKLTEVSVSDKLEEFHAAKKGNAV

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`LXL04_029815`
版本	OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID LXL04_029815

位置 Chr06:101101967-101103594 (-)

描述 Similar to APP1: Aminopeptidase P1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At4g36760`	催化从肽的N端去除倒数第二个脯氨酸残基，例如 Arg-Pro-Pro（根据相似性）。	Identification, purification, and molecular cloning of N-1-naphthylphthalmic acid-binding plasma membrane-associated aminopeptidases from Arabidopsis.2002 · DOI: 10.1104/pp.010519
`At2g44440`	可能参与染色质状态的调控（可能）。	EMSY-like genes are required for full RPP7-mediated race-specific immunity and basal defense in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1094/mpmi-05-11-0123
`At5g13020`	可能参与染色质状态的调控（可能）。	暂无已核实直接文献
`At5g06780`	可能参与染色质状态的调控（可能）。	EMSY-like genes are required for full RPP7-mediated race-specific immunity and basal defense in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1094/mpmi-05-11-0123

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_029815 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0006357 regulation of transcription by RNA polymerase II 生物过程

GO:0006508 proteolysis 生物过程

GO:0009408 response to heat 生物过程

GO:0009609 response to symbiotic bacterium 生物过程

GO:0009877 nodulation 生物过程

GO:0009926 auxin polar transport 生物过程

GO:0010228 vegetative to reproductive phase transition of meristem 生物过程

GO:0050832 defense response to fungus 生物过程

GO:0051607 defense response to virus 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

KEGG 基因交叉引用

ath:AT2G44440

ath:AT4G36760

ath:AT5G06780

ath:AT5G13020

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.795

排名 1 · LXL04_029815 · OH-1004

细胞质0.261

排名 2 · LXL04_029815 · OH-1004

细胞膜0.047

排名 3 · LXL04_029815 · OH-1004

内质网0.032

排名 4 · LXL04_029815 · OH-1004

质体0.018

排名 5 · LXL04_029815 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

没有找到该查询的结果。

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`F4JQH3`	拟南芥	Aminopeptidase P1	69.333%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据
`Q08A72`	拟南芥	Protein EMSY-LIKE 4	48.649%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据
`F4K2F0`	拟南芥	Protein EMSY-LIKE 3	59.322%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据
`Q9FG29`	拟南芥	Protein EMSY-LIKE 2	55.556%	Swiss-Prot	低置信数据库同源证据

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