基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_028252
当前版本: OH-1004
染色体: Chr06
坐标: 35889041-35890153
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA1035 bp · LXL04_028252|LXL04_028252|OH1004|cDNA
ATGTCGATGGAGGCCACTGCTAATTCCCCACAGCCGTCACTCTCCTTACCATGGAGAACACGCATTAGTATTTTCCTCCTCTCCACTATCACCGACGCATCTTGCCGGAAAAACGGCACCGTCAACCGTCGTATTGTCACCTTAGTCGACTTCAAGAGCCCGCCGAAGTCAAAATCAGTCAACGGCGTATCCTCACACGATGTCGTTATAGATCAAACTCGTAACCTCTGGTTCCGAGTCTATGTACCTACCCAACTCGC...
CDS
下载 CDS FASTA1035 bp · LXL04_028252|LXL04_028252|OH1004|CDS
ATGTCGATGGAGGCCACTGCTAATTCCCCACAGCCGTCACTCTCCTTACCATGGAGAACACGCATTAGTATTTTCCTCCTCTCCACTATCACCGACGCATCTTGCCGGAAAAACGGCACCGTCAACCGTCGTATTGTCACCTTAGTCGACTTCAAGAGCCCGCCGAAGTCAAAATCAGTCAACGGCGTATCCTCACACGATGTCGTTATAGATCAAACTCGTAACCTCTGGTTCCGAGTCTATGTACCTACCCAACTCGC...
344 aa · LXL04_028252|LXL04_028252|OH1004|PROTEIN
MSMEATANSPQPSLSLPWRTRISIFLLSTITDASCRKNGTVNRRIVTLVDFKSPPKSKSVNGVSSHDVVIDQTRNLWFRVYVPTQLANEDLPVMVFFHGGGFVFASPDSTPYDAVCCRFATKVQAVVVSVNYRLAPEHRYPAQHDDCFDVLKFLDDEDNRSTSLQENANLLRCFLAGDSAGANLAHHVAQRACEFNFRRLKVIGVVAIQPFFGGEERTESETRLEGAPLVSIKRTDWMWKAFLPEGEGFNRDHPIINVTG...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_028252 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_028252 | |||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr06:35889041-35890153 (+) | |||||||||||||||||||||
| 描述 | Similar to CXE18: Probable carboxylesterase 18 | |||||||||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻
| |||||||||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | |||||||||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0009739 response to gibberellin 生物过程 GO:0009740 gibberellic acid mediated signaling pathway 生物过程 GO:0009860 pollen tube growth 生物过程 GO:0009939 positive regulation of gibberellic acid mediated signaling pathway 生物过程 GO:0010476 gibberellin mediated signaling pathway 生物过程 GO:0010629 negative regulation of gene expression 生物过程 GO:0048444 floral organ morphogenesis 生物过程 GO:0048530 fruit morphogenesis 生物过程 GO:0071456 cellular response to hypoxia 生物过程 GO:1905516 positive regulation of fertilization 生物过程 GO:0005634 nucleus 细胞组分 GO:0005737 cytoplasm 细胞组分 | |||||||||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT3G05120 ath:AT3G63010 ath:AT5G23530 ath:AT5G27320 dosa:Os05g0407500 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞质0.535
细胞核0.192
内质网0.161
细胞膜0.084
过氧化物酶体0.072
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF00135.35COesterase76-135 aaPF20434.6BD-FAE80-189 aaPF07859.20Abhydrolase_394-315 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_028252 | PF00135.35 | COesterase | 76 | 135 | 4.6e-10 | 39.8 |
| LXL04_028252 | PF20434.6 | BD-FAE | 80 | 189 | 3.2e-13 | 50.4 |
| LXL04_028252 | PF07859.20 | Abhydrolase_3 | 94 | 315 | 2.5e-60 | 204.6 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。
| 蛋白 | 物种 | 描述 | 一致性 | 数据库 | 置信等级 |
|---|---|---|---|---|---|
Q9LT10 | 拟南芥 | Probable carboxylesterase 18 | 58.859% | Swiss-Prot | 强数据库同源证据 |
Q940G6 | 拟南芥 | Gibberellin receptor GID1C | 42.994% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q9LYC1 | 拟南芥 | Gibberellin receptor GID1B | 38.679% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q9MAA7 | 拟南芥 | Gibberellin receptor GID1A | 36.286% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |
Q6L545 | 水稻 | Gibberellin receptor GID1 | 36.335% | Swiss-Prot | 中等数据库同源证据 |