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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_028164
当前版本: OH-1004 染色体: Chr06 坐标: 32848827-32854742 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2895 bp · LXL04_028164|LXL04_028164|OH1004|cDNA

ATGATTCCGATGGAGATTCTTTAttgttgtttcttcttcttcatgtTCATCTTCTCCGTTTCATCCGCTTCCGATCCTTTCTCCGATGCGCTTTTGGGCTTGAAATCGGAGTTCACTGTTCCGGTTGATGTTTTAAGTGATTGGGTTATCCCTCAAGAACAAAACCCATCTGCGAAAATTCATGCTTGCTCTTGGACTGGTGTACAATGCGATCAAAACTCGACCAAAGTCATCGGCTTGGACATTTCTTTGAAAAACCT...

CDS

下载 CDS FASTA

2895 bp · LXL04_028164|LXL04_028164|OH1004|CDS

ATGATTCCGATGGAGATTCTTTATTGTTGTTTCTTCTTCTTCATGTTCATCTTCTCCGTTTCATCCGCTTCCGATCCTTTCTCCGATGCGCTTTTGGGCTTGAAATCGGAGTTCACTGTTCCGGTTGATGTTTTAAGTGATTGGGTTATCCCTCAAGAACAAAACCCATCTGCGAAAATTCATGCTTGCTCTTGGACTGGTGTACAATGCGATCAAAACTCGACCAAAGTCATCGGCTTGGACATTTCTTTGAAAAACCT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

964 aa · LXL04_028164|LXL04_028164|OH1004|PROTEIN

MIPMEILYCCFFFFMFIFSVSSASDPFSDALLGLKSEFTVPVDVLSDWVIPQEQNPSAKIHACSWTGVQCDQNSTKVIGLDISLKNLSGVLSGVQFNRFVDLTDLNMSHNSFSGELPIGIFNLTSLKTLDISRNNFSGGFPIGISGLRNLVVLDAFSNSFSGPLPPDVCKIGSVEVLNFAGSYFSGPIPGAYGSCKSLDFLHLAGNSLTGYLPIEFGQLKTVTHMEIGYNSYQGNIPWQFGNMSELQYLDIAGANLSGPI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_028164
TK1151 IDTkA07G126920
OH-1004 IDLXL04_028164
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)97.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.782 / OH-1004 95.021
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_028164
位置Chr06:32848827-32854742 (+)
描述Similar to TDR: Leucine-rich repeat receptor-like protein kinase TDR
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g61480 与CLE41p、CLE44p肽构成配体-受体对，参与维管组织发育中的信号转导，调控原形成层的维持及极性。 暂无已核实直接文献
At4g28650 参与调控维管组织发育过程中原形成层的维持和极性。
A receptor heteromer mediates the male perception of female attractants in plants.2016 · DOI: 10.1038/nature16975
At1g08590 参与调控维管组织发育过程中原形成层的维持和极性。 暂无已核实直接文献
At3g49670 富含LRR的类受体激酶（LRR-RLK），涉及CLAVATA家族肽（CLEs）的检测，以及通过CIK蛋白的磷酸化调节触发信号以促进原韧皮部分化和分生组织维持，可能还包括PBL34、PBL35和PBL36。 暂无已核实直接文献
At5g65700 富含亮氨酸重复序列的受体样激酶，与CLV1和BAM3共同感知CLAVATA类肽CLE25、CLE26和CLE45，经CIK及PBL34、PBL35和PBL36的磷酸化传递信号，调控原生韧皮部分化和分生组织维持。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_028164 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0009755 hormone-mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009934 regulation of meristem structural organization 生物过程
GO:0010067 procambium histogenesis 生物过程
GO:0010075 regulation of meristem growth 生物过程
GO:0010087 phloem or xylem histogenesis 生物过程
GO:0010089 xylem development 生物过程
GO:0010183 pollen tube guidance 生物过程
GO:0010223 secondary shoot formation 生物过程
GO:0030154 cell differentiation 生物过程
GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G08590
ath:AT3G49670
ath:AT4G28650
ath:AT5G61480
ath:AT5G65700
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.873
排名 1 · LXL04_028164 · OH-1004
内质网0.087
排名 2 · LXL04_028164 · OH-1004
细胞质0.058
排名 3 · LXL04_028164 · OH-1004
细胞核0.043
排名 4 · LXL04_028164 · OH-1004
溶酶体／液泡0.026
排名 5 · LXL04_028164 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263.18LRRNT_229-71 aa
PF23598.2LRR_1497-178 aa
PF13855.13LRR_8102-159 aa
PF23598.2LRR_14188-275 aa
PF23598.2LRR_14282-373 aa
PF13855.13LRR_8294-349 aa
PF13855.13LRR_8503-543 aa
PF12799.14LRR_4532-568 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_028164PF08263.18LRRNT_229712.3e-0628.5
LXL04_028164PF23598.2LRR_14971783.5e-2072.8
LXL04_028164PF13855.13LRR_81021591.3e-2692.8
LXL04_028164PF23598.2LRR_141882753.5e-2072.8
LXL04_028164PF23598.2LRR_142823733.5e-2072.8
LXL04_028164PF13855.13LRR_82943491.3e-2692.8
LXL04_028164PF13855.13LRR_85035431.3e-2692.8
LXL04_028164PF12799.14LRR_45325689.4e-2277.3
LXL04_028164PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr6909132.4e-1454.0
LXL04_028164PF00069.32Pkinase7148081.6e-0938.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FII5拟南芥Leucine-rich repeat receptor-like protein kinase TDR38.302%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9M0G7拟南芥MDIS1-interacting receptor like kinase 134.642%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9FRS6拟南芥Leucine-rich repeat receptor-like protein kinase PXL132.683%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9M2Z1拟南芥Leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase BAM234.504%Swiss-Prot中等数据库同源证据
O49545拟南芥Leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase BAM134.501%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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