基因详情
输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
基因概览
LXL04_027600
当前版本: OH-1004
染色体: Chr06
坐标: 19918054-19925518
链方向: +
类型: protein_coding
cDNA / CDS / 蛋白序列
cDNA
下载 cDNA FASTA4866 bp · LXL04_027600|LXL04_027600|OH1004|cDNA
ATGGGGTTTAAGCCCTTAGTTTCATACTGTCGTCCGGTGGAAAATGGTGTATGGGCGACGGCGGTGGAAAACGAATTTGGGCCTTACACACCTTGTGCAACCGATTCTCTGGTTACTGGCATTTCCCATTTGGTTCTCCTGGGAATTTGCATATGCCGATTATGGATGACAACGAAGAATCTCAAAGTGCAGCGGTTCAAATTGAGGTCCAAAATCTACAATTACTTCTTGGGATTATTGGCTCTCTTCTGTACTGCTGA...
CDS
下载 CDS FASTA4866 bp · LXL04_027600|LXL04_027600|OH1004|CDS
ATGGGGTTTAAGCCCTTAGTTTCATACTGTCGTCCGGTGGAAAATGGTGTATGGGCGACGGCGGTGGAAAACGAATTTGGGCCTTACACACCTTGTGCAACCGATTCTCTGGTTACTGGCATTTCCCATTTGGTTCTCCTGGGAATTTGCATATGCCGATTATGGATGACAACGAAGAATCTCAAAGTGCAGCGGTTCAAATTGAGGTCCAAAATCTACAATTACTTCTTGGGATTATTGGCTCTCTTCTGTACTGCTGA...
1621 aa · LXL04_027600|LXL04_027600|OH1004|PROTEIN
MGFKPLVSYCRPVENGVWATAVENEFGPYTPCATDSLVTGISHLVLLGICICRLWMTTKNLKVQRFKLRSKIYNYFLGLLALFCTAEPLIRLIMGISVFNVDGETGLAPYEIVTLVIKALAWCSVLIVLGIETVIYVCEIRWFMRFGVIYALLGDAVLLNLVLSVSQYYSRDILYIYSSEVGIQVVFGICLIVYLPTLDPYPGYSPIRVDPLDDGEYEELPSREEICPERHTNIISSIFFSWMNPLMLLGYKRPLTEKDI...
上下游序列下载
序列方向与下载说明
上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。
多版本 ID 对照
| 输入 ID | LXL04_027600 |
|---|---|
| 版本 | OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0 |
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004
展开后加载该基因的变异记录。
基因基本信息与功能注释
| 基因 ID | LXL04_027600 | |||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 位置 | Chr06:19918054-19925518 (+) | |||||||||||||||
| 描述 | Similar to ABCC2: ABC transporter C family member 2 | |||||||||||||||
| 拟南芥 / 水稻参考基因与文献 |
拟南芥
水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。 | |||||||||||||||
| 功能注释来源 | 查看注释来源功能注释来源：OH1004 · | |||||||||||||||
| GO 注释（OH1004 来源） | GO:0015700 arsenite transport 生物过程 GO:0015721 bile acid and bile salt transport 生物过程 GO:0046685 response to arsenic-containing substance 生物过程 GO:0055085 transmembrane transport 生物过程 GO:0071716 leukotriene transport 生物过程 GO:1902418 (+)-abscisic acid D-glucopyranosyl ester transmembrane transport 生物过程 GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分 GO:0005634 nucleus 细胞组分 GO:0005737 cytoplasm 细胞组分 GO:0005773 vacuole 细胞组分 GO:0005774 vacuolar membrane 细胞组分 GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分 | |||||||||||||||
| KEGG 基因交叉引用 | ath:AT1G30400 ath:AT1G30410 ath:AT1G30420 ath:AT2G34660 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。 |
基因表达
查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。
数据来源与对应关系说明
表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。
亚细胞定位 Top 5
以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。
细胞膜0.454
溶酶体／液泡0.231
细胞质0.149
内质网0.145
高尔基体0.117
LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果
预测功能结构域
结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。
PF00664.29ABC_membrane307-571 aaPF00005.34ABC_tran633-768 aaPF00664.29ABC_membrane915-1172 aaPF00005.34ABC_tran1252-1400 aaPF02463.26SMC_N1371-1440 aa| 基因 ID | 结构域编号 | 结构域名称 | 起始 aa | 终止 aa | E 值 | 评分 |
|---|---|---|---|---|---|---|
| LXL04_027600 | PF00664.29 | ABC_membrane | 307 | 571 | 1.5e-63 | 215.8 |
| LXL04_027600 | PF00005.34 | ABC_tran | 633 | 768 | 9.1e-44 | 150.1 |
| LXL04_027600 | PF00664.29 | ABC_membrane | 915 | 1172 | 1.5e-63 | 215.8 |
| LXL04_027600 | PF00005.34 | ABC_tran | 1252 | 1400 | 9.1e-44 | 150.1 |
| LXL04_027600 | PF02463.26 | SMC_N | 1371 | 1440 | 6.9e-11 | 42.7 |
拟南芥 / 水稻蛋白同源
仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。