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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_027595
当前版本: OH-1004 染色体: Chr06 坐标: 19837687-19839430 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1398 bp · LXL04_027595|LXL04_027595|OH1004|cDNA

ATGTTAGAGTTTCCGAGGGATCAGTCAGAAGGTTCAGGAGAAGAAGCGGTTTCTGAAGCGGTGAATTCAAGTCAAAGCTCGATGAGTAGTGATAGTTGTACTAGCTTTAGTCGTTTGTCATTTGATGCGTTAGAGCTGCTTCCACCTACTCGGCCACTGTACTCGCCGGAGAATATGATAATGAAGCCGCATAGGTCTTCCGAGTCGTCGTGGCAAGCTATTCGTACGGTGGCGTTGAAGAGGAGCAGCAGTGAAGGATT...

CDS

下载 CDS FASTA

1398 bp · LXL04_027595|LXL04_027595|OH1004|CDS

ATGTTAGAGTTTCCGAGGGATCAGTCAGAAGGTTCAGGAGAAGAAGCGGTTTCTGAAGCGGTGAATTCAAGTCAAAGCTCGATGAGTAGTGATAGTTGTACTAGCTTTAGTCGTTTGTCATTTGATGCGTTAGAGCTGCTTCCACCTACTCGGCCACTGTACTCGCCGGAGAATATGATAATGAAGCCGCATAGGTCTTCCGAGTCGTCGTGGCAAGCTATTCGTACGGTGGCGTTGAAGAGGAGCAGCAGTGAAGGATT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

465 aa · LXL04_027595|LXL04_027595|OH1004|PROTEIN

MLEFPRDQSEGSGEEAVSEAVNSSQSSMSSDSCTSFSRLSFDALELLPPTRPLYSPENMIMKPHRSSESSWQAIRTVALKRSSSEGFGGVDGGSSLSFRDFSLVRQIGSGDIGKVYLCRLRNEDVEESRCYYAMKVVDREVLALKKKIQRAATERKILNMLDHPFLPSLYAQFEASHFSCVVMEYCSGGDLHSLRHKQPRKRFSLSAARFYAAEVLVALEYLHMLGIIYRDLKPENVLVRSDGHIMLTDFDLSLCSDAIP...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_027595
TK1151 IDTkA07G076920
OH-1004 IDLXL04_027595
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_027595
位置Chr06:19837687-19839430 (+)
描述Similar to PID: Protein kinase PINOID
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g34650 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶参与生长素信号传导的调节。 暂无已核实直接文献
At5g47750 蛋白激酶，通过直接磷酸化调节 PIN 生长素外排促进剂的生长素转运活性。
D6PK AGCVIII kinases are required for auxin transport and phototropic hypocotyl bending in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1105/tpc.113.111484
At5g55910 蛋白激酶，通过直接磷酸化调节PIN生长素外排载体的生长素运输活性。
The polarly localized D6 PROTEIN KINASE is required for efficient auxin transport in Arabidopsis thaliana.2009 · DOI: 10.1242/dev.028365
D6PK AGCVIII kinases are required for auxin transport and phototropic hypocotyl bending in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1105/tpc.113.111484
Arabidopsis D6PK is a lipid domain-dependent mediator of root epidermal planar polarity.2015 · DOI: 10.1038/nplants.2015.162
At4g26610 蛋白激酶，通过直接磷酸化调节PIN生长素外排载体的生长素运输活性。
D6PK AGCVIII kinases are required for auxin transport and phototropic hypocotyl bending in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1105/tpc.113.111484

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os12g0614600 丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶参与生长素信号传导的调节。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_027595 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0009630 gravitropism 生物过程
GO:0009638 phototropism 生物过程
GO:0009733 response to auxin 生物过程
GO:0009734 auxin-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009908 flower development 生物过程
GO:0009926 auxin polar transport 生物过程
GO:0009958 positive gravitropism 生物过程
GO:0010540 basipetal auxin transport 生物过程
GO:0048364 root development 生物过程
GO:0048367 shoot system development 生物过程
GO:0048766 root hair initiation 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G34650
ath:AT4G26610
ath:AT5G47750
ath:AT5G55910
dosa:Os12g0614600
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.608
排名 1 · LXL04_027595 · OH-1004
细胞核0.428
排名 2 · LXL04_027595 · OH-1004
细胞膜0.070
排名 3 · LXL04_027595 · OH-1004
线粒体0.051
排名 4 · LXL04_027595 · OH-1004
内质网0.035
排名 5 · LXL04_027595 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069.32Pkinase102-253 aa
PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr103-254 aa
PF00069.32Pkinase320-426 aa
PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr327-410 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_027595PF00069.32Pkinase1022532.4e-57195.0
LXL04_027595PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr1032543.5e-2899.3
LXL04_027595PF00069.32Pkinase3204262.4e-57195.0
LXL04_027595PF07714.24PK_Tyr_Ser-Thr3274103.5e-2899.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O64682拟南芥Protein kinase PINOID60.606%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q39183拟南芥Serine/threonine-protein kinase D6PKL250.990%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9FG74拟南芥Serine/threonine-protein kinase D6PK51.111%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9SUA3拟南芥Serine/threonine-protein kinase D6PKL151.378%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q2QM77水稻Protein kinase PINOID54.953%Swiss-Prot强数据库同源证据

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