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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

LXL04_027053
当前版本: OH-1004 染色体: Chr06 坐标: 7968942-7970605 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1233 bp · LXL04_027053|LXL04_027053|OH1004|cDNA

ATGGTGCACCCCGAAATAGGGTTAGAAGTTGTTATTGACCCTTCATCTATCATCAAACATCAAGAACTACCCACAAAGAAGACGAATCTTAAAAACCACGAAATGAAGCGATCACAAAAACCCATTATAACAAAGATCAATGCAGGGTACTTTAGGATTTGCATGTCGCTTGGTGGTCAAGCTTTGTTATGGAAAACTCTAAGTGAACAAGTTGATATATCACCAACGATTAATAACGTGTTCACGAAGTTACCATTAAC...

CDS

下载 CDS FASTA

1233 bp · LXL04_027053|LXL04_027053|OH1004|CDS

ATGGTGCACCCCGAAATAGGGTTAGAAGTTGTTATTGACCCTTCATCTATCATCAAACATCAAGAACTACCCACAAAGAAGACGAATCTTAAAAACCACGAAATGAAGCGATCACAAAAACCCATTATAACAAAGATCAATGCAGGGTACTTTAGGATTTGCATGTCGCTTGGTGGTCAAGCTTTGTTATGGAAAACTCTAAGTGAACAAGTTGATATATCACCAACGATTAATAACGTGTTCACGAAGTTACCATTAAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

410 aa · LXL04_027053|LXL04_027053|OH1004|PROTEIN

MVHPEIGLEVVIDPSSIIKHQELPTKKTNLKNHEMKRSQKPIITKINAGYFRICMSLGGQALLWKTLSEQVDISPTINNVFTKLPLTAYFLIWCLALCVFISLSTLYLFRCIFHFNMVKGEYHHHVGVNYLYAPWVSALLLLRSAPSFIFPNKYSYEYVWWPLILPVIALDVKIYGQWFTTEKRFLSMVANPTSQLSVIGNLVGAHAAVKIGWTESGICLFTLGMTHYLVVFITLYQRFSGNNHLPSRLRPVFFLFVATP...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDLXL04_027053
版本OH-1004 / GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · OH-1004

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDLXL04_027053
位置Chr06:7968942-7970605 (+)
描述Similar to SLAH1: S-type anion channel SLAH1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g62280 缓慢、弱的电压依赖性 S 型阴离子外流通道，参与阴离子稳态的维持。 暂无已核实直接文献
At1g62262 缓慢、弱的电压依赖性 S 型阴离子外流通道，参与阴离子稳态的维持。 暂无已核实直接文献
At1g12480 缓慢、弱的电压依赖性 S 型阴离子外流通道，参与阴离子稳态的维持。
CO2 regulator SLAC1 and its homologues are essential for anion homeostasis in plant cells.2008 · DOI: 10.1038/nature06720
SLAC1 is required for plant guard cell S-type anion channel function in stomatal signalling.2008 · DOI: 10.1038/nature06608
Ozone-triggered rapid stomatal response involves the production of reactive oxygen species, and is controlled by SLAC1 and OST1.2010 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2010.04159.x
Stomatal action directly feeds back on leaf turgor: new insights into the regulation of the plant water status from non-invasive pressure probe measurements.2010 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2010.04213.x
S-type Anion Channels SLAC1 and SLAH3 Function as Essential Negative Regulators of Inward K+ Channels and Stomatal Opening in Arabidopsis.2016 · DOI: 10.1105/tpc.16.01050
Coordinating the overall stomatal response of plants: Rapid leaf-to-leaf communication during light stress.2018 · DOI: 10.1126/scisignal.aam9514
At5g24030 缓慢、弱的电压依赖性 S 型阴离子流出通道参与阴离子稳态的维持。
S-type Anion Channels SLAC1 and SLAH3 Function as Essential Negative Regulators of Inward K+ Channels and Stomatal Opening in Arabidopsis.2016 · DOI: 10.1105/tpc.16.01050
At4g27970 缓慢、弱的电压依赖性 S 型阴离子外流通道，参与阴离子稳态的维持。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_027053 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006820 monoatomic anion transport 生物过程
GO:0006821 chloride transport 生物过程
GO:0006873 intracellular monoatomic ion homeostasis 生物过程
GO:0009270 response to humidity 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009416 response to light stimulus 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0010037 response to carbon dioxide 生物过程
GO:0010118 stomatal movement 生物过程
GO:0010193 response to ozone 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G12480
ath:AT1G62262
ath:AT1G62280
ath:AT4G27970
ath:AT5G24030
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.677
排名 1 · LXL04_027053 · OH-1004
内质网0.166
排名 2 · LXL04_027053 · OH-1004
溶酶体／液泡0.105
排名 3 · LXL04_027053 · OH-1004
细胞质0.090
排名 4 · LXL04_027053 · OH-1004
高尔基体0.049
排名 5 · LXL04_027053 · OH-1004

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03595.23SLAC147-357 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
LXL04_027053PF03595.23SLAC1473572.5e-41142.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q5E930拟南芥S-type anion channel SLAH151.892%Swiss-Prot强数据库同源证据
A8MRV9拟南芥S-type anion channel SLAH450.959%Swiss-Prot强数据库同源证据
Q9LD83拟南芥Guard cell S-type anion channel SLAC141.570%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9FLV9拟南芥S-type anion channel SLAH339.329%Swiss-Prot中等数据库同源证据
Q9ASQ7拟南芥S-type anion channel SLAH235.655%Swiss-Prot中等数据库同源证据

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